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서열번호 4의 52번 잔기의 아스파테이트, 207번 잔기의 아스파테이트, 및 265번잔기의 글루타메이트를 반드시 포함하는 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소(α-neoagarobiose hydrolase)
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제 1항에 있어서 상기 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소는 서열번호 4의 222번 잔기인 라이신, 224번 잔기의 글루타메이트, 235번 잔기인(ARG), 아르기닌, 358번 잔기인 세린, 및 359번 잔기인 타이로신을 더욱 포함하는 것을 특징으로 하는 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소(α-neoagarobiose hydrolase)
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제 1항 또는 제2항에 있어서, 상기 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소는 서열번호 1 내지 서열번호 11의 아미노산 서열 중 하나를 가지는 효소인 것을 특징으로 하는 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소(α-neoagarobiose hydrolase)
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제 3항에 있어서, 상기 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소는 서열번호 4의 아미노산 서열로 이루어진 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소(α-neoagarobiose hydrolase)
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서열번호 4의 52번 잔기의 아스파테이트, 207번 잔기의 아스파테이트, 및 265번 잔기의 글루타메이트를 활성부위로 가지고, 공간 그룹은 C2이고, 유니트 쎌 파라미터는 a = 129
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제 5항에 있어서, 상기 결정은 갈락토스 결합 부위인 서열번호 4의 222번 잔기인 라이신, 224번 잔기인 글루타메이트, 235번 잔기인 아르기닌, 358번 잔기인 세린, 및 359번 잔기인 타이로신을 더욱 포함하는 것인 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 결정
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제 5항 또는 제 6항에 있어서, 상기 결정은 C-말단 부위인 서열번호 4의 354-366 잔기가 D-갈락토스와 상호작용하는 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 결정
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제 5항 또는 제6항에 있어서, 상기 결정은 체인 A와 체인 B로 구성된 상동 이량체 구조이고, 각 단량체는 5개의 날개를 갖는 베타-프로펠러 접힘 구조를 가지는 것을 특징으로 하는 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 결정
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a)알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소를 발현 및 정제하는 단계; 및 b)상기 효소 단백질과 침전용액을 혼합하여 시팅 드롭(sitting drop) 방법으로 셋업 한 후, 실온에서 결정화하는 단계를 포함하는 제 5항 또는 제6항의 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 결정화 방법
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제 9항에 있어서, 상기 결정은 갈락토스 결합 부위인 서열번호 4의 222번 잔기인 라이신, 224번 잔기인 글루타메이트, 235번 잔기인 아르기닌, 358번 잔기인 세린, 및 359번 잔기인 타이로신을 더욱 포함하는 것인 제 5항 또는 제 6항의 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 결정화 방법
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제 9항 또는 제 10항에 있어서, 상기 결정은 C-말단 부위인 서열번호 4의 354-366 잔기가 D-갈락토스와 상호작용하는 제 5항 또는 제 6항의 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 결정화 방법
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제 9항 또는 제 10항에 있어서, 상기 결정은 체인 A와 체인 B로 구성된 상동 이량체 구조이고, 각 단량체는 5개의 날개를 갖는 베타-프로펠러 접힘 구조를 가지는 것을 특징으로 하는 제 5항 또는 제 6항의 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 결정화 방법
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a)제 5항 또는 제6항의 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 결정을 얻는 단계;b) 상기 결정의 원자 코디네이트들을 얻는 단계; 및c) 상기 효소와 상호작용하는 물질을 동정하기 위하여 상기 원자 코디네이트들과 하나 이상의 분자 모델링 기술을 사용하는 단계를 포함하는 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 활성 조절물질 동정 방법
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제 13항에 있어서, 상기 분자 모델링 기술은 그래픽 분자 모델링 또는 컴퓨터 화학(computational chemistry) 기술인 알파-네오 아가로바이오스 가수분해 효소 활성 조절물질 동정 방법
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