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a) 암 줄기세포주에 파지디스플레이 기법으로 바이오패닝을 진행하고, 바이오패닝으로 각 라운드별로 확보한 파지항체 풀(pool)을 각각 발현시킨 후 암 줄기세포 및 정상 세포에 대한 결합력을 분석하고,b) 상기 항체 풀로부터 싱글 콜로니를 분리하여 각 단일클론 항체의 암 줄기세포주에 대한 결합력을 분석하여 정상세포에는 결합하지 않으면서 암 줄기세포 및/또는 암 세포주에만 특이적으로 결합하거나 정상세포보다 암 줄기세포 및/또는 암 세포주에 특이적으로 결합하는 단일클론 항체를 선별하고,c) 상기 선별된 항체는 파지-단쇄가변분절(scFv)에서 전체(whole) IgG와 유사한 기능을 하는 항체 또는 그 기능적 단편 형태로 제작하고,d) 암 줄기세포 및 암세포에 IgG 또는 상기 기능적 단편을 넣고 항체결합 반응을 진행한 후 암 줄기세포 및 암세포 파쇄액을 획득한 후 상층액을 분리하고, 정제된 세포표면 단백체-항체 결합체를 분리하고, 획득한 세포표면 단백체-항체 결합체 샘플은 분석하여 암 줄기세포 항체가 인식하는 특이적 암 줄기세포막 단백질을 동정하는 것을 포함하고,여기서 상기 선별된 암 줄기세포에 특이적인 항체와 암 줄기세포막 타겟 단백질은 액체크로마토그래피 질량분석기(LC-MS/MS)로 분석하는 것을 특징으로 하는 암줄기세포에 결합하는 항체 발굴과 암줄기세포에 대한 진단 및/또는 의약품이 될만한(druggable) 타겟 단백질을 동시에 검출하는 방법
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제1항에 있어서, 상기 a) 단계의 정상세포는 말초 혈액 단핵세포(PBMC) 세포인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항에 있어서, 상기 a) 단계의 결합력 분석은 유동세포 분석법으로 수행한 것을 특징으로 하는 방법
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제1항에 있어서, 상기 c) 단계는 항체의 기능적 단편을 PCR기법으로 증폭하고 동물세포 발현용 벡터에 상기 기능적 단편으로 서브-클로닝한 후 발현하거나 항체 또는 그 기능적 단편과 태그가 결합된 것을 대장균에서 발현한 후 각각의 항체 또는 기능적 단편을 정제하는 것을 특징으로 하는 방법
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제1항에 있어서, 상기 암 줄기세포막 타겟 단백질은 CD44, 또는 CD71인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항에 있어서, 상기 암 줄기세포막 타겟 단백질이 CD44인 경우에 선별된 암 줄기세포에 특이적인 항체는 3C7항체인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 또는 제7항에 있어서, 상기 선별된 암 줄기세포에 특이적인 항체는 3C7항체이고, 상기 3C7항체는 서열번호 1로 기재되는 CDR1 영역, 서열번호 2로 기재되는 CDR2 영역 및 서열번호 3으로 기재되는 CDR3 영역을 포함하는 중쇄 및 서열번호 4로 기재되는 CDR1 영역, 서열번호 5로 기재되는 CDR2 영역 및 서열번호 6으로 기재되는 CDR3 영역을 포함하는 경쇄를 포함하는 단클론 항체, 또는 그 기능적 단편인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항에 있어서, 상기 암 줄기세포막 타겟 단백질이 CD71인 경우에 선별된 암 줄기세포에 특이적인 항체는 1E12항체 또는 2E1항체인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 또는 제9항에 있어서, 상기 선별된 암 줄기세포에 특이적인 항체는 1E12항체이고, 상기 1E12항체는 서열번호 7로 기재되는 CDR1 영역, 서열번호 8로 기재되는 CDR2 영역 및 서열번호 9로 기재되는 CDR3 영역을 포함하는 중쇄 및 서열번호 10으로 기재되는 CDR1 영역, 서열번호 11로 기재되는 CDR2 영역 및 서열번호 12로 기재되는 CDR3 영역을 포함하는 경쇄를 포함하는 단클론 항체, 또는 그 기능적 단편인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항 또는 제9항에 있어서, 상기 선별된 암 줄기세포에 특이적인 항체는 2E1항체이고, 상기 2E1 항체는 서열번호 13으로 기재되는 CDR1 영역, 서열번호 14로 기재되는 CDR2 영역 및 서열번호 15로 기재되는 CDR3 영역을 포함하는 중쇄 및 서열번호 16으로 기재되는 CDR1 영역, 서열번호 17로 기재되는 CDR2 영역 및 서열번호 18로 기재되는 CDR3 영역을 포함하는 경쇄를 포함하는 단클론 항체, 또는 그 기능적 단편인 것을 특징으로 하는 방법
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제1항의 방법의 암 줄기세포 대신 암세포, 염증 질환 및 자가면역질환을 포함한 다른 특이적 질환에 대한 세포 및 줄기세포를 사용하여 해당 질환 세포에 결합하는 항체 발굴과 해당 질환의 세포에 대한 진단 및 치료 의약품이 될만한(druggable) 타겟 단백질을 동시에 검출하는 방법
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