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화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법 및 그 시스템

  • 기술번호 : KST2021016002
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 레이블 데이터셋을 서로 유사도가 낮은 훈련용 레이블 데이터셋과 검증용 레이블 데이터셋으로 분리하고, 비-레이블 데이터셋으로부터 샘플 가중치에 기초하여 비-레이블 부표본을 추출하며, 상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 비-레이블 부표본에 기초한 손실함수를 이용하여 심층 신경망의 가중치를 업데이트하고, 상기 검증용 레이블 데이터셋에 기초한 손실함수를 이용하여 상기 샘플 가중치를 업데이트하는 화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법 및 그 시스템에 관한 것이다. 본 발명에 따른 준지도 학습 방법 및 그 시스템에 따르면, 훈련용 레이블 데이터셋과 유사도가 낮은 검증용 레이블 데이터셋을 선정함으로써 신규성이 높은 화합물에 대한 예측 정확도를 향상시킬 수 있는 효과가 있다.
Int. CL G16C 20/30 (2019.01.01) G16C 20/70 (2019.01.01) G16C 20/10 (2019.01.01) G06N 20/00 (2019.01.01) G06N 3/08 (2006.01.01)
CPC G16C 20/30(2013.01) G16C 20/70(2013.01) G16C 20/10(2013.01) G06N 20/00(2013.01) G06N 3/08(2013.01)
출원번호/일자 1020210054316 (2021.04.27)
출원인 주식회사 바이온사이트, 강원대학교산학협력단
등록번호/일자 10-2343523-0000 (2021.12.22)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20211227) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2021.04.27)
심사청구항수 15

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 주식회사 바이온사이트 대한민국 강원도 춘천시 강원대학길 *
2 강원대학교산학협력단 대한민국 강원도 춘천시

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 양희정 강원도 춘천시 강원대학길
2 유호진 경기도 수원시 영통구
3 이남길 세종특별자치시 남세종로

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 정여순 대한민국 서울특별시 강남구 선릉로 ***, *층 ***호(삼성동, 성원타워)(법률사무소그루)
2 이형일 대한민국 서울 강남구 선릉로 ***,*층 ***호 (삼성동,성원타워)(법률사무소그루)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 주식회사 바이온사이트 강원도 춘천시 강원대학길 *
2 강원대학교 산학협력단 강원도 춘천시
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2021.04.27 수리 (Accepted) 1-1-2021-0491473-72
2 [우선심사신청]심사청구서·우선심사신청서
2021.05.11 수리 (Accepted) 1-1-2021-0543948-11
3 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2021.07.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2021-0584589-64
4 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2021.09.23 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2021-1088530-68
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2021.09.23 수리 (Accepted) 1-1-2021-1088554-53
6 등록결정서
Decision to grant
2021.11.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2021-0926678-52
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번호 청구항
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화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법으로서,생체활성 화합물 데이터베이스로부터 추출한 레이블 데이터셋을 서로 유사도가 낮은 훈련용 레이블 데이터셋과 검증용 레이블 데이터셋으로 분리하는 단계; 비-레이블 데이터셋으로부터 샘플 가중치에 기초하여 비-레이블 부표본을 추출하는 단계; 상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 비-레이블 부표본에 기초한 손실함수를 이용하여 심층 신경망의 가중치를 업데이트하는 단계; 및상기 검증용 레이블 데이터셋에 기초한 손실함수를 이용하여 상기 샘플 가중치를 업데이트하는 단계를 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법
2 2
제1항에 있어서,상기 심층 신경망은 그래프 합성곱 신경망 및 완전 연결 계층을 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법
3 3
제1항에 있어서,상기 레이블 데이터셋을 서로 유사도가 낮은 상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 검증용 레이블 데이터셋으로 분리하는 단계는상기 레이블 데이터셋에 포함된 화합물(분자)들의 구조적 특성을 기준으로 서로 유사도가 낮도록 상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 검증용 레이블 데이터셋으로 분리하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법
4 4
제1항에 있어서,상기 레이블 데이터셋을 서로 유사도가 낮은 상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 검증용 레이블 데이터셋으로 분리하는 단계 이전에,생체활성 화합물 데이터베이스로부터 생체 표적에 대한 생체활성 정보가 알려진 화합물들을 선택하여 상기 레이블 데이터셋을 추출하는 단계를 더 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법
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제1항에 있어서,상기 비-레이블 데이터셋으로부터 상기 샘플 가중치에 기초하여 상기 비-레이블 부표본을 추출하는 단계 이전에,분자 데이터베이스로부터 미리 입력된 분자 특성에 기초하여 상기 비-레이블 데이터셋을 추출하는 단계를 더 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법
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제1항에 있어서,상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 비-레이블 부표본에 기초한 손실함수를 이용하여 상기 심층 신경망의 가중치를 업데이트하는 단계는 상기 훈련용 레이블 데이터셋에 해당하는 화합물 데이터를 입력 받은 상기 심층 신경망이 출력한 생체활성 정보와 실제 생체활성 정보(레이블)의 차이에 기초한 손실함수; 상기 비-레이블 부표본을 입력 받은 상기 심층 신경망이 출력한 생체활성 정보에 기초한 손실함수; 및 상기 비-레이블 부표본을 입력 받은 그래프 합성곱 신경망으로부터 얻어진 특성 벡터와 그래프 임베딩 방식으로 도출된 특성 벡터의 차이에 기초한 손실함수 중에서 적어도 둘 이상의 손실함수들을 조합한 다수준 손실함수를 이용하여 상기 심층 신경망의 가중치를 업데이트하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 방법
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화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템으로서, 생체활성 화합물 데이터베이스로부터 레이블 데이터셋을 추출하여 상기 레이블 데이터셋을 훈련용 레이블 데이터셋 및 검증용 레이블 데이터셋을 분리하고, 분자 데이터베이스로부터 비-레이블 부표본을 추출하는 데이터 추출부; 심층 신경망; 및 상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 비-레이블 부표본에 기초한 손실함수를 이용하여 상기 심층 신경망의 가중치를 계산하고, 상기 검증용 레이블 데이터셋에 기초한 손실함수를 이용하여 샘플 가중치를 계산하는 손실함수 계산부;를 포함하고,상기 데이터 추출부는 상기 생체활성 화합물 데이터베이스로부터 도출된 상기 레이블 데이터셋을 서로 유사도가 낮은 상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 검증용 레이블 데이터셋으로 분리하는 분리부; 및 상기 분자 데이터베이스로부터 도출된 비-레이블 데이터셋으로부터 상기 샘플 가중치에 기초하여 상기 비-레이블 부표본을 추출하는 샘플부;를 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
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제7항에 있어서,상기 심층 신경망은 그래프 합성곱 신경망 및 완전 연결 계층을 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
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제7항에 있어서,상기 분리부는 상기 레이블 데이터셋에 포함된 화합물(분자)들의 구조적 특성을 기준으로 서로 유사도가 낮도록 상기 훈련용 레이블 데이터셋과 상기 검증용 레이블 데이터셋으로 분리하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
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제7항에 있어서,상기 데이터 추출부는 상기 생체활성 화합물 데이터베이스로부터 생체 표적에 대한 생체활성 정보가 알려진 화합물들을 선택하여 상기 레이블 데이터셋을 추출하는 생체활성도 필터부를 더 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
11 11
제7항에 있어서,상기 데이터 추출부는 상기 분자 데이터베이스로부터 미리 입력된 분자 특성에 기초하여 상기 비-레이블 데이터셋을 추출하는 분자 필터부를 더 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
12 12
제7항에 있어서,상기 데이터 추출부는 상기 레이블 데이터셋 및 상기 비-레이블 데이터셋에 포함되는 화합물(분자)의 구조적 특성을 도출하는 특성화부를 더 포함하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
13 13
제7항에 있어서,상기 심층 신경망은 상기 비-레이블 데이터셋에 속하는 화합물의 분자 구조를 표현한 그래프를 특성 벡터로 변환하는 임베딩부를 포함하는, 화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
14 14
제7항에 있어서,상기 손실함수 계산부는 상기 비-레이블 부표본에 속하는 화합물의 분자 구조를 표현한 그래프를 특성 벡터로 변환하는 임베딩부를 포함하는, 화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
15 15
제13항 또는 제14항에 있어서,상기 손실함수 계산부는 상기 훈련용 레이블 데이터셋에 해당하는 화합물 데이터를 입력 받은 상기 심층 신경망이 출력한 생체활성 정보와 실제 생체활성 정보(레이블)의 차이에 기초한 손실함수; 상기 비-레이블 부표본을 입력 받은 상기 심층 신경망이 출력한 생체활성 정보에 기초한 손실함수; 및 상기 비-레이블 부표본에 대한 그래프 합성곱 신경망으로부터 얻어진 특성 벡터와 상기 임베딩부로부터 도출된 특성 벡터의 차이에 기초한 손실함수 중에서 적어도 둘 이상의 손실함수들을 조합한 다수준 손실함수를 이용하여 상기 심층 신경망의 가중치를 업데이트하는,화합물 생체활성 예측을 위한 준지도 학습 시스템
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.