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마이크로어레이 실험 정보의 통합 관리 방법 및 그기록매체

  • 기술번호 : KST2014000931
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 마이크로어레이 실험 정보의 통합 관리 방법 및 그 기록매체가 개시된다.본 발명에 따른 마이크로어레이 실험 정보의 통합 관리 방법은 DNA 칩 실험에 대한 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보 및 이미지 정보를 등록하는 단계; 상기 이미지 정보의 이미지에 대한 블럭 인덱싱 및 스팟 인덱싱을 수행하고 상기 인덱싱된 이미지에 대해 통계 분석을 수행하여 분석 결과를 생성하는 단계; 및 상기 분석 결과를 상기 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보에 따라 생성된 프로젝트 데이터베이스에 기록하는 단계를 포함하고, 상기 분석 결과를 생성하는 단계는 상기 이미지 정보에 대응하는 마이크로어레이 스캐닝 이미지를 로드하는 단계; 상기 이미지 상에서 수정 k-최근접 이웃법을 이용하여 블럭 인덱싱을 수행하는 단계; 및 상기 이미지의 각 블럭 내에서 강도가 사용자의 입력에 따라 미리 결정된 임계값보다 높은 반점을 추출하여 추출된 반점을 정점으로 입실론 그래프를 생성하고, 상기 입실론 그래프를 이용하여 스팟 인덱싱을 수행하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.본 발명에 의하면, DNA 칩 실험 결과에 대한 계층적인 데이터베이스를 구축하여, 통합 시스템 상에서 각종 통계 분석을 수행하고 그 결과를 가공할 수 있으며, 분석 프로그램간 데이터 호환 문제를 해소하고, 분석 데이터들을 체계적으로 관리할 수 있으며, 현장 연구자가 사용하기 편리한 인터페이스를 제공할 수 있으며, 주어진 상황에 맞는 통계방법을 선택하는 가이드라인을 제공하며, 웹기반 시스템으로 구성하는 경우 많은 사용자가 접근 가능하게 할 수 있다.
Int. CL G06F 17/40 (2006.01) G06F 17/00 (2006.01)
CPC G06F 19/12(2013.01) G06F 19/12(2013.01) G06F 19/12(2013.01) G06F 19/12(2013.01)
출원번호/일자 1020060095838 (2006.09.29)
출원인 고려대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-0836865-0000 (2008.06.03)
공개번호/일자 10-2008-0030145 (2008.04.04) 문서열기
공고번호/일자 (20080611) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.09.29)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 성북구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이재원 대한민국 서울 성북구
2 김철민 대한민국 부산 서구
3 이정복 대한민국 경기 안산시 단원구
4 손인석 대한민국 서울 성북구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 현종철 대한민국 서울특별시 중구 다산로 **, *층 특허법인충현 (신당동, 두지빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 성북구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application
2006.09.29 수리 (Accepted) 1-1-2006-0715843-42
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2007.03.22 수리 (Accepted) 4-1-2007-5043540-16
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2007.07.05 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2007.08.14 수리 (Accepted) 9-1-2007-0049244-13
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2007.11.15 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0609606-11
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2008.01.15 수리 (Accepted) 1-1-2008-0034442-87
7 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2008.01.15 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2008-0034459-52
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2008.03.05 수리 (Accepted) 4-1-2008-5034712-96
9 등록결정서
Decision to grant
2008.05.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0252909-01
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2009.06.09 수리 (Accepted) 4-1-2009-5111177-32
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2010.08.12 수리 (Accepted) 4-1-2010-5149278-93
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.02.11 수리 (Accepted) 4-1-2014-5018243-16
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.04.22 수리 (Accepted) 4-1-2014-5049934-62
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.10.10 수리 (Accepted) 4-1-2019-5210941-09
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
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삭제
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삭제
3 3
삭제
4 4
DNA 칩 실험에 대한 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보 및 이미지 정보를 등록하는 단계;상기 이미지 정보의 이미지에 대한 블럭 인덱싱 및 스팟 인덱싱을 수행하고 상기 인덱싱된 이미지에 대해 통계 분석을 수행하여 분석 결과를 생성하는 단계; 및상기 분석 결과를 상기 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보에 따라 생성된 프로젝트 데이터베이스에 기록하는 단계를 포함하고, 상기 분석 결과를 생성하는 단계는상기 이미지 정보에 대응하는 마이크로어레이 스캐닝 이미지를 로드하는 단계;상기 이미지 상에서 수정 k-최근접 이웃법을 이용하여 블럭 인덱싱을 수행하는 단계; 및상기 이미지의 각 블럭 내에서 강도가 사용자의 입력에 따라 미리 결정된 임계값보다 높은 반점을 추출하여 추출된 반점을 정점으로 입실론 그래프를 생성하고, 상기 입실론 그래프를 이용하여 스팟 인덱싱을 수행하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 실험 정보의 통합 관리 방법
5 5
DNA 칩 실험에 대한 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보 및 이미지 정보를 등록하는 단계;상기 이미지 정보의 이미지에 대한 블럭 인덱싱 및 스팟 인덱싱을 수행하고 상기 인덱싱된 이미지에 대해 통계 분석을 수행하여 분석 결과를 생성하는 단계; 및상기 분석 결과를 상기 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보에 따라 생성된 프로젝트 데이터베이스에 기록하는 단계를 포함하고,상기 분석 결과를 생성하는 단계는상기 인덱싱된 이미지를 슬라이드 정보에 적용하고, 실험 설계, 표준화, 추정과 검정, 군집 분석 및 분류로 구성된 상위 메뉴의 아이템을 디스플레이하는 단계;상기 아이템 중 상기 실험 설계가 선택되면, 염료교환, 기준설계 또는 루프설계 중 어느 하나의 실험 디자인을 선택하는 인터페이스와 상기 선택된 실험 디자인에 사용될 설계 파라미터를 입력하는 인터페이스를 디스플레이하고, 상기 입력된 설계 파라미터를 이용하여 상기 선택된 실험 디자인에 대한 아노바 설계 매트릭스를 생성하는 단계;상기 아이템 중 상기 표준화가 선택되면, 상기 슬라이드 정보를 이용한 단일 슬라이드 표준화, 단일 배치 표준화 및 다중 슬라이드 표준화를 순차적으로 수행하여 표준화 결과를 생성하는 단계;상기 아이템 중 상기 추정과 검정이 선택되면, 상기 표준화 결과에 대해, 뉴턴 분석 방법, B 통계량 방법, 조정 유의 확률 방법, 에스에이엠 방법 및 이비에이엠 방법 중에서 선택된 적어도 하나의 추정 방법을 수행하여 마이크로어레이 실험에서 유의한 유전자를 추정하고, 상기 추정된 유전자에 따른 잘못 발견할 확률을 연산하는 단계;상기 아이템 중 상기 군집 분석이 선택되면, 상기 표준화 결과를 이용하여 계층적 군집 분석, K-평균 군집 분석, 주성분 분석, 자기조직도 분석 및 진쉐이빙(geneshaving) 분석 방법 중에서 선택된 적어도 하나의 군집 분석을 수행하여 생성된 군집 분석 결과를 그래프로 디스플레이하는 단계; 및상기 아이템 중 상기 분류가 선택되면, 상기 표준화 결과 및 처리군 간의 변동과 처리군 내에서의 변동의 비를 이용하여 후보 유전자를 선정하고, 상기 후보 유전자에 대해 고전적 분류 또는 트리 분류를 수행하여 상기 설계 파라미터에 유의한 유전자가 분류된 그룹과 오분류율을 출력하는 단계를 실행하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 실험 정보의 통합 관리 방법
6 6
DNA 칩 실험에 대한 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보 및 이미지 정보를 등록하는 단계;상기 이미지 정보의 이미지에 대한 블럭 인덱싱 및 스팟 인덱싱을 수행하고 상기 인덱싱된 이미지에 대해 통계 분석을 수행하여 분석 결과를 생성하는 단계; 및상기 분석 결과를 상기 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보에 따라 생성된 프로젝트 데이터베이스에 기록하는 단계를 포함하고,상기 분석 결과를 생성하는 단계는상기 인덱싱된 이미지를 상기 데이터베이스의 작업 정보에 저장된 실험 조건별로 분류하고, 상기 실험 조건 중 어느 하나의 실험 조건에서 복제 실험용 DNA 칩 및 염료교환 실험용 DNA 칩을 선택하는 단계;상기 선택된 복제 실험용 DNA 칩과 염료교환 실험용 DNA 칩 사이의 강도 차이 값을 입력하는 단계; 및상기 선택된 복제 실험용 DNA 칩과 염료교환 실험용 DNA 칩 상에서 상기 입력된 강도 차이 이상에 해당하는 반점 영역을 디스플레이하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 실험 정보의 통합 관리 방법
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DNA 칩 실험에 대한 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보 및 이미지 정보를 등록하는 단계;상기 이미지 정보의 이미지에 대한 블럭 인덱싱 및 스팟 인덱싱을 수행하고 상기 인덱싱된 이미지에 대해 통계 분석을 수행하여 분석 결과를 생성하는 단계; 및상기 분석 결과를 상기 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보에 따라 생성된 프로젝트 데이터베이스에 기록하는 단계를 포함하고,상기 분석 결과를 생성하는 단계는상기 인덱싱된 이미지를 이용하여 복수의 서로 다른 실험조건마다 유효한 유전자 정보를 생성하는 단계;상기 복수의 서로 다른 실험조건의 리스트를 디스플레이하는 단계;상기 복수의 서로 다른 실험조건 중 어느 하나의 실험 조건을 선택하는 단계; 및상기 생성된 유전자 정보로부터 상기 선택된 실험조건에 유효한 반점의 블럭 정보, 상기 블럭 내에서의 행 및 열 인덱스를 포함하는 정보를 추출하고 상기 추출된 정보를 테이블로 디스플레이하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 실험 정보의 통합 관리 방법
8 8
DNA 칩 실험에 대한 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보 및 이미지 정보를 등록하는 단계;상기 이미지 정보의 이미지에 대한 블럭 인덱싱 및 스팟 인덱싱을 수행하고 상기 인덱싱된 이미지에 대해 통계 분석을 수행하여 분석 결과를 생성하는 단계;상기 분석 결과를 상기 프로젝트 정보, 실험 정보, 작업 정보에 따라 생성된 프로젝트 데이터베이스에 기록하는 단계;상기 인덱싱된 이미지에 포함된 이에스티를 기능별 카테고리에 따라 분류하여 기능 그룹 정보를 생성하는 단계;상기 기능별 카테고리의 리스트를 디스플레이하는 단계; 및상기 기능별 카테고리 중 어느 하나를 선택하면 상기 선택된 카테고리에 해당하는 이에스티를 상기 기능 그룹 정보로부터 추출하고, 상기 추출된 이에스티의 블럭 정보, 상기 블럭 내에서의 행 및 열 인덱스를 포함하는 정보를 테이블로 디스플레이하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 실험 정보의 통합 관리 방법
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제 4 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항의 방법을 컴퓨터에서 실행시키기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.