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전자 라이브러리로부터 시뮬레이션을 통해 표적 분자 저해를 위한 최적의 단백질 구조를 검색하는 방법

  • 기술번호 : KST2014039237
  • 담당센터 : 대구기술혁신센터
  • 전화번호 : 053-550-1450
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 정보기록 수단에 저장된 전자 라이브러리로부터 특히 시뮬레이션을 수행함으로써 단백질을 검색하는 방법에 관한 것으로서, 본 발명에 의한 전자 라이브러리로부터 시뮬레이션을 통해 단백질을 검색하는 방법은 전자 라이브러리로부터 표적에 특이적인 비항체 단백질을 검색하는 방법에 있어서, 상기 전자 라이브러리는 비항체 단백질로 구성되며, (a) 상기 전자 라이브러리에 포함된 상기 비항체 단백질과 상기 표적의 도킹 시뮬레이션을 수행하여 상기 표적의 잔기들 중 기 설정된 개수 이상 결합되는 상기 비항체 단백질을 선택하는 단계; (b) 상기 (a)단계에서 선택된 상기 비항체 단백질과 상기 표적의 결합에너지를 계산하고, 상기 결합에너지가 낮은 순서에 따라 기 설정된 개수만큼 상기 비항체 단백질을 정렬하는 단계; (c) 상기 (b)단계에서 선택된 상기 비항체 단백질 중 구조적 상보성 점수가 기설정된 점수 이하인 상기 비항체 단백질을 제거하는 단계를 포함하고, 상기 (c)단계에서 제거하고 남은 상기 비항체 단백질이 표적에 특이적인 비항체 단백질인 것을 특징으로 한다.
Int. CL G01N 33/68 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01)
CPC G01N 33/68(2013.01) G01N 33/68(2013.01) G01N 33/68(2013.01)
출원번호/일자 1020100015396 (2010.02.19)
출원인 포항공과대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-1020933-0000 (2011.03.02)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20110309) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2010.02.19)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 포항공과대학교 산학협력단 대한민국 경상북도 포항시 남구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 최윤섭 대한민국 경상북도 포항시 남구
2 서판길 대한민국 경상북도 포항시 남구
3 정준호 대한민국 서울시 종로구
4 유지호 대한민국 서울시 동작구
5 조현수 대한민국 경기도 고양시 덕양구
6 윤수민 대한민국 서울시 종로구
7 김경록 대한민국 부산광역시 남구
8 류성호 대한민국 경상북도 포항시 남구
9 김상욱 대한민국 경상북도 포항시 남구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 손민 대한민국 서울특별시 송파구 법원로 ***, *층(문정동)(특허법인한얼)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 포항공과대학교 산학협력단 대한민국 경상북도 포항시 남구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2010.02.19 수리 (Accepted) 1-1-2010-0111542-32
2 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2010.07.01 수리 (Accepted) 1-1-2010-0428001-00
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2010.07.21 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2010.08.05 수리 (Accepted) 9-1-2010-0047378-68
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2010.08.16 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2010-0353821-21
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2010.09.10 수리 (Accepted) 1-1-2010-0590787-67
7 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2010.09.10 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2010-0590789-58
8 등록결정서
Decision to grant		 2010.12.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2010-0570391-79
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.06.13 수리 (Accepted) 4-1-2013-0025573-58
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.02.25 수리 (Accepted) 4-1-2014-5024386-11
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.11.20 수리 (Accepted) 4-1-2019-5243581-27
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.11.22 수리 (Accepted) 4-1-2019-5245997-53
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.11.25 수리 (Accepted) 4-1-2019-5247115-68
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
전자 라이브러리로부터 표적에 특이적인 비항체 단백질을 검색하는 방법에 있어서,상기 전자 라이브러리는 비항체 단백질로 구성되며,(a) 상기 전자 라이브러리에 포함된 상기 비항체 단백질과 상기 표적의 도킹 시뮬레이션을 수행하여 상기 표적의 잔기들 중 기 설정된 개수 이상 결합되는 상기 비항체 단백질을 선택하는 단계;(b) 상기 (a)단계에서 선택된 상기 비항체 단백질과 상기 표적의 결합에너지를 계산하고, 상기 결합에너지가 낮은 순서에 따라 기 설정된 개수만큼 상기 비항체 단백질을 정렬하는 단계; 및,(c) 상기 (b)단계에서 선택된 상기 비항체 단백질 중 구조적 상보성 점수가 기설정된 점수 이하인 상기 비항체 단백질을 제거하는 단계를 포함하고,상기 (c)단계에서 제거하고 남은 상기 비항체 단백질이 표적에 특이적인 비항체 단백질이고, 상기 전자 라이브러리는,인간 단백질 중 10 내지 40kDa의 분자량을 가지고, 10개 이하의 상호작용을 가지고, 단량체(monomer), 동종이량체(homodimer), 및 동종삼량체(homotrimer) 중 어느 하나 이상을 형성할 수 있는 비항체 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는, 표적 특이적 비항체 단백질의 검색 방법
2 2
삭제
3 3
제 1 항에 있어서,상기 전자 라이브러리는,(ㄱ) 인간 단백질 중 10 내지 40kDa의 분자량을 갖는 단백질을 선택하는 단계;(ㄴ) 상기 (ㄱ)단계에서 선택된 단백질에서 막 단백질 및 항체 단백질을 제거하는 단계;(ㄷ) 상기 (ㄴ)단계에서 제거하고 남은 단백질에서 10개 이하의 상호작용이 알려진 단백질을 선택하는 단계; 및,(ㄹ) 상기 (ㄷ)단계에서 선택된 단백질에서 단량체(monomer), 동종이량체(homodimer), 및 동종삼량체(homotrimer) 중 어느 하나 이상을 형성할 수 있는 단백질을 선택하는 단계를 포함하는 방법으로 제조하는 것을 특징으로 하는,표적 특이적 비항체 단백질의 검색 방법
4 4
제 3 항에 있어서,상기 (ㄱ)단계에서,인간 단백질은 복수의 그룹으로 이루어져 있고, 상기 복수의 그룹에서 각각 10 내지 40kDa의 분자량을 갖는 단백질을 5개 이하로 선택하는 것을 특징으로 하는,표적 특이적 비항체 단백질의 검색 방법
5 5
제 1 항에 있어서,(d) 상기 표적과 상기 비항체 단백질의 상기 잔기의 결합에너지를 계산하는 단계; 및(e) 상기 잔기의 결합에너지 중 기 설정된 값보다 큰 값을 가지는 잔기를 표시하는 단계를 더 포함하는,표적 특이적 비항체 단백질의 검색 방법
6 6
제 1 항에 있어서,상기 표적은, 표피세포성장인자수용체(Epidermal Growth Factor Receptor, EGFR)의 제 2 도메인인 것을 특징으로 하는,표적 특이적 비항체 단백질의 검색 방법
7 7
제 6 항에 있어서,상기 (a)단계는,상기 표적의 잔기는 28개이고,상기 기 설정된 개수는 10개인 것을 특징으로 하는,표적 특이적 비항체 단백질의 검색 방법
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 포항공과대학교 산학협력단 21C프론티어연구 인슐린 신호 프로테옴 규명 및 조절 물질 개발