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히든 마코브 모델을 이용한 식물 저항성 유전자 동정 및 분류를 위한 시스템 및 방법

  • 기술번호 : KST2014045997
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 단백질이나 DNA 서열로부터 식물의 저항성 유전자를 빠르고 정확하게 동정 및 분류하기 위한 시스템 및 방법에 관한 것이다.본 발명은 히든 마코브 모델 (Hidden Marcov Model)을 사용하여 식물의 저항성 유전자 (resistance gene)를 동정 및 분류하기 위하여 저항성 유전자를 암호화하고 있는 도메인 (domain)의 단백질 서열을 이용하여 만든 프로파일 메트릭스 (profile matrix)와 이 프로파일 메트릭스를 이용하여 저항성 유전자의 도메인을 동정하고 도메인의 조합에 따른 저항성 유전자를 분류하기 위한 시스템을 고안하였다.본 발명은 상기 프로파일 메트릭스와 프로그램을 이용하여 뉴클레오타이드 염기 서열 또는 단백질 서열이 밝혀진 식물의 저항성 유전자를 효과적으로 동정 및 분류할 수 있다.저항성 유전자, 히든 마코브 모델, 프로파일 메트릭스, 도메인
Int. CL G06F 19/00 (2011.01)
CPC
출원번호/일자 1020090123006 (2009.12.11)
출원인 한국생명공학연구원
등록번호/일자 10-1140780-0000 (2012.04.20)
공개번호/일자 10-2011-0066380 (2011.06.17) 문서열기
공고번호/일자 (20120503) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2009.12.11)
심사청구항수 2

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 허철구 대한민국 대전광역시 유성구
2 김정은 대한민국 대전광역시 서구
3 이봉우 대한민국 대전광역시 동구
4 이승원 대한민국 대전광역시 유성구
5 홍지만 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 최규환 대한민국 대전광역시 서구 한밭대로 ***, **층 그린국제특허법률사무소 (둔산동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 대한민국(산업통상자원부장관) 세종특별자치시 한누리대
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2009.12.11 수리 (Accepted) 1-1-2009-0765733-48
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2010.10.07 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2010.11.15 수리 (Accepted) 9-1-2010-0070517-58
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2011.03.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0172967-77
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2011.04.07 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2011-0254188-71
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2011.04.07 수리 (Accepted) 1-1-2011-0254182-08
7 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2011.09.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0539316-27
8 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2011.11.11 수리 (Accepted) 1-1-2011-0890354-05
9 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2011.11.11 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2011-0890355-40
10 등록결정서
Decision to grant
2012.04.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0230529-77
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.02.05 수리 (Accepted) 4-1-2015-0007152-08
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
저항성 유전자를 동정 및 분류하기 위한 단백질이나 뉴클레오타이드 서열을 입력할 수 있는 입력부;입력된 서열로부터 기존에 알려져 있는 CC(coiled-coil)-NBS(nucleotide binding site)-LRR(leucine rich repeat)(CNL) 그룹의 NBS 도메인과 TIR(toll interleukine-1 like receptor)-NBS(nucleotide binding site)-LRR(leucine rich repeat)(TNL) 그룹의 NBS 도메인을 구별하여 따로 구축된 HMM(Hidden Markov Model) 프로파일 메트릭스(profile matrix)를 이용하여 저항성 유전자를 암호화하는 각 NBS 도메인을 동정하고, 저항성 유전자를 분류하는 처리부;처리부의 알고리즘에 의해 동정 및 분류된 저항성 유전자를 저장하는 데이터베이스;기존의 공개용 데이터베이스의 단백질 및 UniGene 서열로부터 저항성 유전자를 동정하고, 분류하여 만든 데이터베이스로부터 검색하기 위한 검색부; 및처리부에서 가공되어 데이터베이스에 저장된 정보를 웹상에 출력하는 출력부;를 포함하는 식물의 대량의 단백질 또는 뉴클레오타이드 서열을 가공하여 저항성 유전자 관련 도메인을 동정하고, 그 도메인의 조합으로부터 저항성 유전자를 분류하는 시스템
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3 3
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4 4
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5 5
제1항에 있어서, 상기 알고리즘은 각 메트릭스의 적정 경계 값을 이용하여 도메인을 동정하고 동정된 도메인의 조합을 이용하여 저항성 유전자를 분류하는 알고리즘인 것을 특징으로 하는 시스템
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10 10
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1 US20120271558 US 미국 FAMILY
2 WO2011071209 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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1 US2012271558 US 미국 DOCDBFAMILY
2 WO2011071209 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부, 미생물유전체활용기술개발사업단 한국생명공학연구원 21C 프론티어연구개발사업 병독성미생물에 관한 유전자조절 네트워크 해석 시스템 개발