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십자화과 식물 유전자의 진화 및 기능 연구를 위한 발현 유전체 비교분석 시스템 구축 방법

  • 기술번호 : KST2014046153
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 진화적으로 유사한 배추, 양배추 및 유채의 유전자 기능 연구 및 진화 연구에 기반이 되는 시스템 구축 방법으로서, 데이터베이스 구축법과 염기서열 상동성을 이용한 BLAST 분석 시 디스플레이(display)하는 방법을 변화시켜 유용성 및 효율성을 증대시키는 방법에 관한 것이다.본 발명은 유채, 배추, 양배추에 모델 식물인 애기장대(Arabidopsis)의 유전자 정보를 추가하여 데이터베이스로 구축함으로써 십자화과 연구자들에게 한 단계 발전된 유전 정보 검색 기능 및 결과를 제공하기 위한 새로운 시스템 및 방법으로 매우 유용하게 이용될 수 있을 것이다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) G06F 19/10 (2011.01)
CPC G16B 20/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01)
출원번호/일자 1020110039357 (2011.04.27)
출원인 한국생명공학연구원
등록번호/일자 10-1289403-0000 (2013.07.18)
공개번호/일자 10-2012-0121500 (2012.11.06) 문서열기
공고번호/일자 (20130729) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2012.03.29)
심사청구항수 4

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김혜란 대한민국 대전광역시 유성구
2 남성혁 대한민국 대전광역시 유성구
3 권석윤 대한민국 대전광역시 유성구
4 김민영 대한민국 대전광역시 유성구
5 오상근 대한민국 대전광역시 유성구
6 이정여 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 최규환 대한민국 대전광역시 서구 한밭대로 ***, **층 그린국제특허법률사무소 (둔산동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2011.04.27 수리 (Accepted) 1-1-2011-0312343-02
2 [심사청구]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2012.03.29 수리 (Accepted) 1-1-2012-0250853-77
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2013.01.11 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2013.02.06 수리 (Accepted) 9-1-2013-0008367-11
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2013.03.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0178803-18
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2013.04.02 수리 (Accepted) 1-1-2013-0286297-13
7 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2013.04.02 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2013-0286302-54
8 등록결정서
Decision to grant		 2013.07.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0494950-34
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.05 수리 (Accepted) 4-1-2015-0007152-08
10 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2017.07.11 수리 (Accepted) 1-1-2017-0663476-15
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
유채, 배추 및 양배추의 발현체를 공개 데이터베이스에서 내려받고, 각 발현체 서열을 EST(Expressed Sequence Tag) 어셈블리 프로그램을 사용하여 어셈블리함으로써 중복을 줄인 유니젠 세트(Unigene set)로 구성하는 단계;애기장대(Arabidopsis)의 Unigene을 TAIR(The Arabidopsis Information Resource) 데이터베이스에서 내려받고, 내려받은 Unigene의 ID를 이용하여 십자화과의 진화적으로 보존적인 염색체 블록 정보를 애기장대의 Unigene에 추가하는 단계;염색체 블록 정보가 포함된 애기장대 유니젠 세트에 유채, 배추 및 양배추의 Unigene을 BLASTN 알고리즘으로 정렬한 후, 가장 높은 정렬 스코어를 기록한 정렬 결과를 이용하여 유채, 배추 및 양배추의 Unigene에 정렬된 애기장대 유전자명, 블록 정보, 정렬 정확도(identity) 및 유전자 기능 정보를 추가하는 단계; 및상기 애기장대의 정보가 추가된 유채, 배추 및 양배추의 Unigene 서열을 이용하여 데이터베이스를 구축하는 단계를 포함하는 십자화과 식물 유전자의 진화 및 기능 연구를 위한 발현 유전체 비교분석 시스템 구축 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 공개 데이터베이스는 NCBI Entrez EST 데이터베이스인 것을 특징으로 하는 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 EST 어셈블리 프로그램은 TGICL(TIGR Gene Indices clustering tools) 프로그램인 것을 특징으로 하는 방법
4 4
삭제
5 5
제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 방법을 수행하기 위한 컴퓨터로 판독 가능한 프로그램을 기록한 기록매체
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 농림축산식품부 한국생명공학연구원 농림기술개발사업 양배추류 유전체 분석 및 육종 지원시스템 개발