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인덱스를 생성하는 수단, 상기 인덱스를 관점별로 저장하는 수단 및 상기 인덱스의 관계를 분석하는 수단을 구비하는 컴퓨터가 수행하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법에 있어서, 상기 인덱스를 생성하는 수단이 대용량 생명공학 문헌을 입력받아 질병, 유전자, 화합물에 대한 다차원 인덱스를 구축하는 단계와, 상기 인덱스를 관점별로 저장하는 수단이 구축된 상기 다차원 인덱스를 미리 정해진 인덱스 저장구조에 따라 저장하는 단계와, 상기 인덱스의 관계를 분석하는 수단이 상기 저장된 인덱스를 기초로 사용자에 의해 입력된 검색어를 이용하여 상기 대용량 생명공학 문헌으로부터 질병, 유전자, 화합물에 대한 다차원 분석을 수행하는 단계를 포함하여 구성된 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 1항에 있어서, 상기 다차원 인덱스를 구축하는 단계는, PubMed 데이터베이스로부터 초록(Abstract) 필드가 널(NULL)이 아닌 문헌만을 추출하는 단계와, 각 초록의 내용을 문장 단위로 분할하여 큐레이션(curation)을 통해 문장 테이블(Sentence table)로 만드는 단계와, 상기 문장 테이블에 대하여 역인덱스를 구축하는 단계와, 유전자, 질병, 화합물에 대한 각각의 동의어 사전을 상기 역인덱스와 비교하여 유전자, 질병, 화합물에 대한 각각의 차원 인덱스를 구축하는 단계를 포함하여 구성된 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 2항에 있어서, 상기 문장 테이블로 만드는 단계에서, 상기 문장 테이블은, [pubmed id, 문장 id(sentence id), 문장(sentence)]의 순서로 저장되는 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 1항에 있어서, 상기 인덱스 저장구조는, 스타 스키마(Star Schema) 구조인 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 4항에 있어서, 상기 인덱스 저장구조에서, 질병 인덱스는, pubmed 아이디, 문장번호, 질병 아이디 및 질병이름, 시작위치, 종료위치에 대한 정보가 저장되고, 여기에 표준 질병명 및 질병에 대한 동의어 정보가 관련지어져 저장되는 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 4항에 있어서, 상기 인덱스 저장구조에서, 유전자 인덱스는, pubmed 아이디, 문장번호, 유전자 아이디 및 유전자 이름, 시작위치, 종료위치에 대한 정보가 저장되고, 여기에 표준 유전자 및 유전자에 대한 동의어 정보가 관련지어져 저장되는 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 4항에 있어서, 상기 인덱스 저장구조에서, 화합물 인덱스는, pubmed 아이디, 문장번호, 합성물 아이디 및 화합물 아이디, 화합물 이름, 시작위치, 종료위치에 대한 정보가 저장되고, 여기에 합성물명 및 합성물에 대한 동의어 정보가 관련지어져 저장되는 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 5항 내지 제 7항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 인덱스 저장구조는, 질병 인덱스, 유전자인덱스 및 화합물 인덱스 이외에 다른 분석차원에 대하여도 인덱스 정보를 추가하여 다차원 분석모델을 수립할 수 있도록 구성된 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 1항에 있어서, 상기 방법은, 상기 대용량 생명공학 문헌을 1차원(유전자, 질병, 화합물), 2차원(유전자-질병, 질병-유전자, 유전자-화합물, 화합물-유전자, 질병-화합물, 화합물-질병 관계) 및 3차원(유전자-질병-화합물 관계)으로 분석할 수 있도록 구성된 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 1항에 있어서, 사용자가 검색어를 입력하면, 검색결과를 나타내는 화면에 각 유전자, 질병, 화합물에 대한 색 또는 하이라이트를 각각 적용하여, 시각적인 효과를 줄 뿐만 아니라 사용자가 직관적으로 내용을 이해할 수 있도록 구성된 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 1항에 있어서, 사용자가 검색어를 입력하면, 문장을 기준으로 내용을 파악한 다음 전체 초록을 볼 수 있도록 함으로써, 문장을 중심으로 초록 내용을 확인할 수 있도록 구성된 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 1항에 있어서, 사용자가 검색어를 입력하면, 그와 관련된 키워드들이 표시되고, 상기 키워드를 선택하면 상기 검색어 및 상기 키워드에 해당하는 검색결과 및 초록이 표시되어, 사용자가 상기 검색어와 상기 키워드간의 관계 분석을 용이하게 수행할 수 있도록 구성된 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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제 1항에 있어서, 유전자-질병-화합물간의 관계를 추출하기 위한 별도의 프로그램을 작성할 필요 없이, SQL을 이용하여 상기 인덱스에 접근하여 필요한 분석을 즉시 수행할 수 있도록 구성된 것을 특징으로 하는 대용량 생명공학 문헌으로부터 유전자-질병-화합물 관계를 추출하는 방법
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