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변형 MLPA 를 이용한 카피 수 다형성의 다중 분석 방법

  • 기술번호 : KST2014057085
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 프로브의 길이 차이에 의존하여 카피 수를 분석하는 기존의 MLPA(Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) 기술을 변형한 것으로, 프로브의 길이 차이에 관계없이 프로브의 입체 구조에 따른 이동상의 차이에 따라 카피 수 다형성을 다중 검출하는 방법 및 상기 방법을 구현하기 위한 키트에 관한 것이다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01)
CPC C12Q 1/6883(2013.01) C12Q 1/6883(2013.01) C12Q 1/6883(2013.01)
출원번호/일자 1020120058639 (2012.05.31)
출원인 가톨릭대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-1513276-0000 (2015.04.13)
공개번호/일자 10-2013-0135414 (2013.12.11) 문서열기
공고번호/일자 (20150421) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2012.05.31)
심사청구항수 8

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 가톨릭대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서초구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 정연준 대한민국 서울 서초구
2 정규열 대한민국 경북 포항시 남구
3 정승현 대한민국 서울 서초구
4 신기원 대한민국 경북 포항시 남구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 유미특허법인 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 서림빌딩 **층 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 가톨릭대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서초구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2012.05.31 수리 (Accepted) 1-1-2012-0438322-09
2 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2012.10.31 수리 (Accepted) 1-1-2012-0894337-56
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2013.02.01 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2013.03.19 수리 (Accepted) 9-1-2013-0020145-75
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2013.10.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0736441-16
6 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2013.12.27 수리 (Accepted) 1-1-2013-1199608-24
7 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2014.01.27 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2014-0085647-10
8 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2014.01.27 수리 (Accepted) 1-1-2014-0085642-93
9 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2014.05.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0324813-35
10 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2014.07.11 수리 (Accepted) 1-1-2014-0654227-49
11 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2014.08.13 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2014-0767961-50
12 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2014.08.13 수리 (Accepted) 1-1-2014-0767960-15
13 최후의견제출통지서
Notification of reason for final refusal
2014.12.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0863176-02
14 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2015.02.04 수리 (Accepted) 1-1-2015-0120529-32
15 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2015.02.04 보정승인 (Acceptance of amendment) 1-1-2015-0120530-89
16 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.03.05 수리 (Accepted) 4-1-2015-0012383-55
17 등록결정서
Decision to grant
2015.04.08 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2015-0234935-08
18 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.11.21 수리 (Accepted) 4-1-2019-5245084-94
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
(a) 시료 핵산 및 표준(reference) 핵산을 각각 프로브 세트와 접촉시키는 단계로, 상기 각 프로브 세트는 서열번호 21의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 22의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 23의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 24의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 25의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 26의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 27의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 28의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 29의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 30의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 31의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 32의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 33의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 34의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 35의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 36의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트, 및서열번호 37의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 38의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트를 포함하는 것이고;(b) 시료 핵산 및 표준 핵산을 각각 상기 프로브 세트와 인큐베이션하여 각 핵산의 표적 부위와 프로브 내 표적 혼성화 서열을 혼성화시키는 단계;(c) 표적 핵산과 혼성화된 제1 프로브 및 제2 프로브를 연결하여 프로브 연결산물을 생성하는 단계; (d) 프로브 연결산물들을 유니버설 프라이머를 사용하여 PCR 증폭시키는 단계; (e) 상기 (d) 단계에서 PCR 증폭된 PCR 산물을 변성시켜 단일 가닥 구조 다형성을 유도하는 단계; (f) 상기 단일 가닥 구조 다형성이 유도된 각 PCR 산물들에 대하여 비변성 모세관 전기영동하는 단계; 및(g) 상기 비변성 모세관 전기영동의 결과를 피크로 변환한 후, 시료 핵산 및 표준 핵산에서의 피크 면적을 비교하는 단계를 포함하는,상염색체 상의 카피 수 다형성(copy number variation)의 다중 검출 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 방법은 단계 (f)의 비변성 모세관 전기영동 결과 나타난, 각 PCR 산물들의 단일 가닥 입체 구조에 따른 이동상의 차이에 따라 카피 수를 분석하는 것인 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 단계 (c)의 프로브 연결산물은 90 내지 114 nt 의 길이 범위인 방법
4 4
제3항에 있어서, 상기 단계 (c)의 프로브 연결산물은 109 내지 112 nt 의 길이 범위인 방법
5 5
삭제
6 6
제1항에 있어서, 상기 단계 (c)는 내열성 핵산 연결효소를 처리하여 프로브 연결산물을 생성하는 것인 방법
7 7
제1항에 있어서, 상기 단계 (e) 는 각 PCR 산물들을 포름아미드의 첨가 및 가열에 의해 변성시켜 단일 가닥 구조 다형성을 유도하는 것인 방법
8 8
제1항에 있어서, 상기 단계 (f) 에서 상기 모세관 전기영동은 폴리에틸렌옥사이드-폴리프로필렌옥사이드-폴리에틸렌옥사이드(PEO-PPO-PEO) 삼블록 공중합체를 포함하는 충진젤을 사용하는 것인 방법
9 9
삭제
10 10
삭제
11 11
서열번호 21의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 22의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 23의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 24의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 25의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 26의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 27의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 28의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 29의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 30의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 31의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 32의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 33의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 34의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트,서열번호 35의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 36의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트, 및서열번호 37의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 41의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제1 프로브, 및 서열번호 38의 표적 혼성화 서열 및 서열번호 42의 유니버설 프라이머 인식 서열을 포함하는 제2 프로브를 포함하는 프로브 세트를 포함하는;상염색체 상의 표적 핵산의 카피 수 다형성의 다중 검출용 키트
12 12
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13 13
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패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 보건복지부 가톨릭대학교 산학협력단 선도형 특성화연구사업 선도형 면역질환융합연구사업단(CRCID)/ 약물유전체 및 통합분석 기술개발
2 보건복지부 가톨릭대학교 산학협력단 2011년 상반기 보건의료연구개발사업 Array CGH BAC 칩 시스템 개발을 통한 개인별 질병위험도 예측 연구