| 1 |
1
(i) 가닥간(interstrand) 비공유결합이 형성되는 패러럴(parallel), 안티패러럴(antiparallel) 또는 패러럴(parallel)과 안티패러럴(antiparallel) 아미노산 가닥들을 포함하는 구조 안정화 부위(structure stabilizing region); (ⅱ) 상기 구조 안정화 부위의 양 말단에 결합되어 있고 무작위적으로 선택된 각각 n 및 m개의 아미노산을 포함하는 타겟 결합 부위 I(target binding region I) 및 타겟 결합 부위 Ⅱ(target binding region Ⅱ)를 포함하는 앱타머-유사 펩타이드(Aptamer-Like Peptide: Aptide, 앱타이드)를 제조하는 단계를 포함하며, 상기 구조화 안정화 부위, 타겟 결합 부위 I 및 타겟 결합 부위 Ⅱ에 포함된 아미노산을 D-아미노산을 이용하여 제조하여 D-앱타이드(D-Aptide)를 제조하는 것을 특징으로 하는 L-아미노산으로 이루어진 앱타이드(L-앱타이드)의 타겟에 대한 친화도는 유지하면서 단백질 분해효소에 대한 안정성을 증가시키는 방법으로서, 상기 D-앱타이드의 타겟에 대한 해리상수(Kd) 대(to) L-앱타이드의 타겟에 대한 해리상수(Kd)의 비율이 0
|
| 2 |
2
삭제
|
| 3 |
3
제 1 항에 있어서, 상기 D-앱타이드의 타겟에 대한 해리상수(Kd) 대(to) L-앱타이드의 타겟에 대한 해리상수(Kd)의 비율은 0
|
| 4 |
4
제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위에 형성되는 가닥간 비공유결합은 수소결합, 정전기적 상호작용, 소수성상호작용, 반데르 발스 상호작용, 파이-파이 상호작용, 양이온-파이 상호작용 또는 이들의 조합인 것을 특징으로 하는 방법
|
| 5 |
5
제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위의 아미노산 가닥들은 링커로 연결된 것을 특징으로 하는 방법
|
| 6 |
6
제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위는 β-헤어핀, 헤어핀, 링커로 연결된 β-쉬트, 루이신 지퍼, 링커로 연결된 루이신 지퍼, 루이신 리치 모티프 또는 링커로 연결된 루이신 리치 모티프인 것을 특징으로 하는 방법
|
| 7 |
7
제 1 항에 있어서, 상기 타겟 결합 부위 I 및 타겟 결합 부위 Ⅱ는 타겟에 공동으로 작용하여 결합하는 것을 특징으로 하는 방법
|
| 8 |
8
제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위, 타겟 결합 부위 I 또는 타겟 결합 부위 Ⅱ에 추가적으로 기능성 분자가 결합되어 있는 것을 특징으로 하는 방법
|
| 9 |
9
제 1 항에 있어서, 상기 방법은 다음의 소단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법: (a) (i) 가닥간(interstrand) 비공유결합이 형성되는 패러럴(parallel), 안티패러럴(antiparallel) 또는 패러럴(parallel)과 안티패러럴(antiparallel) L-아미노산 가닥들을 포함하는 구조 안정화 부위(structure stabilizing region); (ⅱ) 상기 구조 안정화 부위의 양 말단에 결합되어 있고 무작위적으로 선택된 각각 n 및 m개의 L-아미노산을 포함하는 타겟 결합 부위 I(target binding region I) 및 타겟 결합 부위 Ⅱ(target binding region Ⅱ)를 포함하는 L-앱타이드의 라이브러리를 제공하는 단계; (b) 상기 라이브러리와 타겟을 접촉시키는 단계; 그리고, (c) 상기 타겟과 결합된 L-앱타이드를 선택하는 단계; (d) 상기 L-앱타이드의 아미노산 서열을 결정하는 단계; 및 (e) 상기 L-앱타이드에 포함된 L-아미노산을 D-아미노산으로 치환하여 D-앱타이드를 제조하는 단계
|
| 10 |
10
제 9 항에 있어서, 상기 D-앱타이드는 상기 L-앱타이드와 동일한 서열 및 동일한 방향성을 가지는 것을 특징으로 하는 방법
|
| 11 |
11
제 9 항에 있어서, 상기 D-앱타이드는 상기 L-앱타이드와 동일한 서열 및 반대의 방향성을 가지는 것을 특징으로 하는 방법
|
| 12 |
12
(a) 가닥간(interstrand) 비공유결합이 형성된 패러럴(parallel), 안티패러럴(antiparallel) 또는 패러럴(parallel)과 안티패러럴(antiparallel) D-아미노산 가닥들을 포함하는 구조 안정화 부위(structure stabilizing region); 및 (b) 상기 구조 안정화 부위의 양 말단에 결합되어 있고 무작위적으로 선택된 각각 n 및 m개의 D-아미노산을 포함하는 타겟 결합 부위 I(target binding region I) 및 타겟 결합 부위 Ⅱ(target binding region Ⅱ)를 포함하는 타겟에 특이적으로 결합하는 D-앱타이드(D-Aptide), 상기 D-앱타이드는 동일한 아미노산 서열을 가지는 L-앱타이드와 비교하여 타겟에 대한 친화도는 유지하면서 단백질 분해효소에 대한 안정성이 증가되며, 상기 D-앱타이드의 타겟에 대한 해리상수(Kd) 대(to) L-앱타이드의 타겟에 대한 해리상수(Kd)의 비율이 0
|
| 13 |
13
삭제
|
| 14 |
14
제 12 항에 있어서, 상기 D-Aptide의 타겟에 대한 해리상수(Kd) 대(to) L-Aptide의 타겟에 대한 해리상수(Kd)의 비율은 0
|
| 15 |
15
제 12 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위에 형성되는 가닥간 비공유결합은 수소결합, 정전기적 상호작용, 소수성상호작용, 반데르 발스 상호작용, 파이-파이 상호작용, 양이온-파이 상호작용 또는 이들의 조합인 것을 특징으로 하는 D-앱타이드(D-Aptide)
|
| 16 |
16
제 12 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위의 아미노산 가닥들은 링커로 연결된 것을 특징으로 하는 D-앱타이드(D-Aptide)
|
| 17 |
17
제 12 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위는 β-헤어핀, 헤어핀, 링커로 연결된 β-쉬트, 루이신 지퍼, 링커로 연결된 루이신 지퍼, 루이신 리치 모티프 또는 링커로 연결된 루이신 리치 모티프인 것을 특징으로 하는 D-앱타이드(D-Aptide)
|
| 18 |
18
제 12 항에 있어서, 상기 타겟 결합 부위 I 및 타겟 결합 부위 Ⅱ는 타겟에 공동으로 작용하여 결합하는 것을 특징으로 하는 D-앱타이드(D-Aptide)
|
| 19 |
19
제 12 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위, 타겟 결합 부위 I 또는 타겟 결합 부위 Ⅱ에 추가적으로 기능성 분자가 결합되어 있는 것을 특징으로 하는 D-앱타이드(D-Aptide)
|
| 20 |
20
상기 제 12 항 및 제 14 항 내지 제 19 항 중 어느 한 항의 D-앱타머-유사 펩타이드(D-Aptide)와 동일한 D-아미노산 서열을 가지면서 반대의 방향성을 갖는 레트로 인버소(retro inverso)-앱타이드(RI-Aptide), 상기 RI-Aptide는 상기 D-Aptide와 유사한 타겟 친화도를 가지는 것을 특징으로 하는 레트로 인버소-앱타이드(RI-Aptide)
|
