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질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 기술

  • 기술번호 : KST2014065686
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요약 전술한 기술적 과제를 해결하기 위하여, 본 발명의 일 실시예에 따른 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법은, 단백질 상호 작용에 대한 데이터를 수신하는 단계, 상기 수신한 데이터 중 특정 질병과 관련된 단백질 상호 작용 데이터를 검출하는 단계, 상기 검출된 단백질 상호 작용 데이터에 포함된 단백질 상호 연관관계 정보를 바탕으로, 제 1 단백질 네트워크를 생성하는 단계, 상기 제 1 단백질 네트워크 내의 특정 단백질을 루트(root) 단백질 노드로 하는 트리(tree) 구조의 제 2 단백질 네트워크를 생성하는 단계, 상기 제 2 단백질 네트워크 내에 포함된 단백질 노드 사이의 엣지 (edge)의 웨이트 (weight)를 계산하는 단계, 상기 제 2 단백질 네트워크 내에서, 하나 이상의 특정 엣지를 분리하여 두 개 이상의 서브 네트워크를 생성하는 단계 및 상기 각각의 서브 네트워크 내의 엣지의 웨이트를 재계산 하고, 각각의 서브 네트워크 별로, 상기 재계산된 웨이트의 합을, 상기 각각의 서브 네트워크의 네트워크 파워로 결정하는 단계를 포함한다.
Int. CL G06F 19/10 (2011.01)
CPC G06F 19/12(2013.01) G06F 19/12(2013.01) G06F 19/12(2013.01)
출원번호/일자 1020110099175 (2011.09.29)
출원인 한국과학기술정보연구원
등록번호/일자 10-1274144-0000 (2013.06.05)
공개번호/일자 10-2013-0034988 (2013.04.08) 문서열기
공고번호/일자 (20130613) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2011.09.29)
심사청구항수 16

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술정보연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 유석종 대한민국 충청북도 청주시 흥덕구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 김용인 대한민국 서울특별시 송파구 올림픽로 ** (잠실현대빌딩 *층)(특허법인(유한)케이비케이)
2 박영복 대한민국 서울특별시 강남구 논현로**길 **, *층(역삼동, 삼화빌딩)(특허법인 두성)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술정보연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2011.09.29 수리 (Accepted) 1-1-2011-0763075-15
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2012.09.26 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2012.10.24 수리 (Accepted) 9-1-2012-0079999-64
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2012.10.31 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0655722-84
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2012.12.26 수리 (Accepted) 1-1-2012-1075929-66
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2012.12.26 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2012-1075928-10
7 등록결정서
Decision to grant
2013.05.31 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0378903-11
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
단백질 상호 작용에 대한 데이터를 수신하는 단계;상기 수신한 데이터 중 특정 질병의 원인이 되는 단백질 상호 작용에 대한 데이터를 검출하는 단계; 상기 검출된 단백질 상호 작용에 대한 데이터에 포함된 단백질 상호 연관관계 정보를 바탕으로, 제 1 단백질 네트워크를 생성하는 단계;상기 제 1 단백질 네트워크 내의 특정 단백질을 루트(root) 단백질 노드로 하는 트리(tree) 구조의 제 2 단백질 네트워크를 생성하는 단계;상기 제 2 단백질 네트워크 내에 포함된 단백질 노드 사이의 엣지 (edge)의 웨이트 (weight)를 계산하는 단계;상기 제 2 단백질 네트워크 내에서, 하나 이상의 특정 엣지를 분리하여 두 개 이상의 서브 네트워크를 생성하는 단계; 및상기 각각의 서브 네트워크 내의 엣지의 웨이트를 재계산 하고, 각각의 서브 네트워크 별로, 상기 재계산된 웨이트의 합을, 상기 각각의 서브 네트워크의 네트워크 파워로 결정하는 단계;를 포함하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법
2 2
제 1 항에 있어서, 상기 제 1 단백질 네트워크는, 두 개 이상의 단백질 노드를 포함하며, 상기 두 개 이상의 단백질 노드를 연결하는 엣지(edge)를 포함하는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법
3 3
제 1 항에 있어서, 상기 웨이트는, 상기 트리 구조의 네트워크에서 웨이트를 계산하고자 하는 엣지에 연결된 노드가 속하는, 하위 레벨에 포함된 노드의 개수를 상기 하위 레벨의 레벨 값으로 나누는 것으로 계산되는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법
4 4
제 1 항에 있어서, 상기 하나 이상의 서브 네트 워크를 생성하는 단계는,분리되어야 하는 엣지들의 웨이트의 합이 가장 적은 하나 이상의 엣지를 분리하여 두 개 이상의 서브 네트워크를 생성하는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법
5 5
제 1 항에 있어서, 상기 결정된 네트워크 파워의 값을, 상기 각각의 서브 네트워크 내의 단백질 노드의 개수로 나눈 값이 가장 큰 서브 네트워크를 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크로 결정하는 단계;를 더 포함하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법
6 6
제 1 항에 있어서, 상기 결정된 네트워크 파워 및 상기 각각의 서브 네트워크 내에 포함된 노드의 개수를 기준으로 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크로 결정하는 단계;를 더 포함하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법
7 7
제 6 항에 있어서, 상기 핵심 단백질 네트워크로 결정하는 단계는,네트워크 파워 값과 서브 네트워크에 포함되는 노드의 개수를 각각 x 축 또는 y 축으로 하는 2차원 그래프를 형성하고, 상기 형성된 2차원 그래프에서, 상기 각각의 서브 네트워크가 해당되는 좌표를 설정하고, 상기 설정된 좌표에 대하여 스카이라인 (skyline) 형성하고, 상기 형성된 스카이라인에 포함되는 서브 네트워크를 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크로 결정하는 것으로 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법
8 8
제 1 항에 있어서, 상기 수신한 데이터 중 특정 질병의 원인이 되는 단백질 상호 작용에 대한 데이터를 검출하는 단계, 상기 수신한 단백질 상호 작용에 대한 데이터를 텍스트 기반의 데이터로 변환하는 단계;상기 텍스트 기반의 데이터에 대하여, 상기 특정 질병의 분야 또는 질병 용어로 쿼리 (query)를 수행하는 단계; 및상기 쿼리된 데이터를 마이닝 (mining) 하는 단계;를 더 포함하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 방법
9 9
단백질 상호 작용에 대한 데이터를 수신하는 데이터 수집부;상기 수신한 데이터 중 특정 질병의 원인이 되는 단백질 상호 작용에 대한 데이터를 검출하는 데이터 분석부;상기 검출된 단백질 상호 작용에 대한 데이터에 포함된 단백질 상호 연관관계 정보를 바탕으로, 제 1 단백질 네트워크를 생성하는 기초 네트워크 생성부; 및상기 제 1 단백질 네트워크 내의 특정 단백질을 루트(root) 단백질 노드로 하는 트리(tree) 구조의 제 2 단백질 네트워크를 생성하고, 상기 제 2 단백질 네트워크 내에 포함된 단백질 노드 사이의 엣지 (edge)의 웨이트 (weight)를 계산하고, 상기 제 2 단백질 네트워크 내에서, 하나 이상의 특정 엣지를 분리하여 두 개 이상의 서브 네트워크를 생성하며, 상기 각각의 서브 네트워크 내의 엣지의 웨이트를 재계산 하고, 각각의 서브 네트워크 별로, 상기 재계산된 웨이트의 합을, 상기 각각의 서브 네트워크의 네트워크 파워로 결정하는 핵심 네트워크 생성부;를 포함하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 시스템
10 10
제 9 항에 있어서, 상기 제 1 단백질 네트워크는, 두 개 이상의 단백질 노드를 포함하며, 상기 두 개 이상의 단백질 노드를 연결하는 엣지(edge)를 포함하는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 시스템
11 11
제 9 항에 있어서, 상기 웨이트는, 상기 트리 구조의 네트워크에서 웨이트를 계산하고자 하는 엣지에 연결된 노드가 속하는, 하위 레벨에 포함된 노드의 개수를 상기 하위 레벨의 레벨 값으로 나누는 것으로 계산되는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 시스템
12 12
제 9 항에 있어서, 상기 핵심 네트워크 생성부는,분리되어야 하는 엣지들의 웨이트의 합이 가장 적은 하나 이상의 엣지를 분리하여 두 개 이상의 서브 네트워크를 생성하는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 시스템
13 13
제 9 항에 있어서, 상기 핵심 네트워크 생성부는,상기 결정된 네트워크 파워의 값을, 상기 각각의 서브 네트워크 내의 단백질 노드의 개수로 나눈 값이 가장 큰 서브 네트워크를 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크로 결정하는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 시스템
14 14
제 9 항에 있어서, 상기 핵심 네트워크 생성부는,상기 결정된 네트워크 파워 및 상기 각각의 서브 네트워크 내에 포함된 노드의 개수를 기준으로 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크로 결정하는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 시스템
15 15
제 14 항에 있어서, 상기 핵심 네트워크 생성부는,네트워크 파워 값과 서브 네트워크에 포함되는 노드의 개수를 각각 x 축 또는 y 축으로 하는 2차원 그래프를 형성하고, 상기 형성된 2차원 그래프에서, 상기 각각의 서브 네트워크가 해당되는 좌표를 설정하고, 상기 설정된 좌표에 대하여 스카이라인 (skyline) 형성하고, 상기 형성된 스카이라인에 포함되는 서브 네트워크를 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크로 결정하는 것으로 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 시스템
16 16
제 9 항에 있어서, 상기 데이터 분석부는, 상기 수신한 단백질 상호 작용에 대한 데이터를 텍스트 기반의 데이터로 변환하고, 상기 텍스트 기반의 데이터에 대하여, 상기 특정 질병의 분야 또는 질병 용어로 쿼리 (query)를 수행하고, 상기 쿼리된 데이터를 마이닝 (mining) 하는 것을 특징으로 하는 질병 연구를 위한 핵심 단백질 네트워크 추출 시스템
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.