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당 동정을 위한 새로운 생물정보처리 분석 방법

  • 기술번호 : KST2015014112
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 혈액내 당단백질에 당(N-glycan)의 동정을 위해 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)를 이용한 질량 스펙트럼 검색 결과를 분석하는 방법에 대한 것으로, 구체적으로 당 절단 효소에 의해 분리된 당을 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계(단계 1); 상기 질량 스펙트럼에서 노이즈를 제거하고, 피크를 선택하여 피크의 리스트를 작성하는 단계(단계 2); 상기 피크 리스트에서 동위원소들을 그룹화하는 단계(단계 3); 상기 피크 리스트에서 당 데이터베이스로부터 이론적으로 가능한 동위원소 분포를 모델링하는 단계(단계 4); S-스코어를 계산하고, S-스코어가 4.5 이상인 당을 동정하는 단계(단계 5); 상기 동정된 당을 기본으로 하여 상관관계 분석을 통하여 추가적으로 당(Branching N-glycan)을 동정하는 단계(단계 6); 상기 동정된 당들을 확인하고, 프로파일링 및 상관관계 맵을 작성하는 단계(단계 7)를 포함하는 생물정보처리 분석 방법에 관한 것이다. 본 발명은 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로부터 얻은 질량 스펙트럼의 결과를 이용하여 상대적으로 낮은 감도(또는 농도)로 존재하는 당을 효율적이고 정확히 동정 및 정량화하여, 질병 표지자(Biomarker)인 당을 발견하여 효과적으로 암을 예측, 진단할 수 있는 기술에 유용하게 사용될 수 있다.
Int. CL G01N 33/50 (2006.01) B01D 59/44 (2006.01) G06F 19/10 (2011.01) G01N 33/574 (2006.01)
CPC G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01)
출원번호/일자 1020110042607 (2011.05.04)
출원인 한국기초과학지원연구원
등록번호/일자 10-1311412-0000 (2013.09.16)
공개번호/일자 10-2012-0124767 (2012.11.14) 문서열기
공고번호/일자 (20130925) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2011.05.04)
심사청구항수 8

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 박건욱 대한민국 충청북도 청원군
2 안현주 대한민국 대전광역시 유성구
3 김재한 대한민국 대전광역시 유성구
4 칼리토 레브릴라 미국 캐나다 *****, 다비스 다비스, 디파트
5 유종신 대한민국 서울특별시 강남구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2011.05.04 수리 (Accepted) 1-1-2011-0334684-60
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2011.10.21 수리 (Accepted) 4-1-2011-5212108-42
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2012.05.17 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2012.06.18 수리 (Accepted) 9-1-2012-0046652-75
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2012.08.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0480846-87
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2012.08.31 수리 (Accepted) 4-1-2012-5184293-13
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2012.08.31 수리 (Accepted) 4-1-2012-5184331-50
8 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2012.10.19 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2012-0852207-56
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2012.10.19 수리 (Accepted) 1-1-2012-0852206-11
10 최후의견제출통지서
Notification of reason for final refusal		 2013.02.21 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0119890-42
11 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2013.03.29 수리 (Accepted) 1-1-2013-0276358-10
12 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2013.03.29 보정승인 (Acceptance of amendment) 1-1-2013-0276361-58
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.04.15 수리 (Accepted) 4-1-2013-5058386-17
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.04.15 수리 (Accepted) 4-1-2013-5058545-81
15 등록결정서
Decision to grant		 2013.08.29 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0603246-34
16 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.06.22 수리 (Accepted) 4-1-2020-5135881-88
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
당 절단 효소(PNGase F)에 의해 분리된 당을 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계(단계 1);상기 단계 1에서 얻은 질량 스펙트럼에서 노이즈를 제거하고, 피크(Peak)를 선택하여 피크의 리스트를 작성하는 단계(단계 2);상기 단계 2에서 작성된 피크 리스트에서 동위원소들을 그룹화(Isotope Grouping)하는 단계(단계 3); 상기 단계 2에서 작성된 피크 리스트에서 당 데이터베이스로부터 이론적으로 가능한 동위원소 분포를 모델링하는 단계(Isotopic Modeling)(단계 4); 상기 단계 3 및 4로부터 S-스코어를 계산하고, S-스코어가 4
2 2
당 절단 효소(PNGase F)에 의해 분리된 당을 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계(단계 1);상기 단계 1에서 얻은 질량 스펙트럼에서 베이스 라인을 수정하여 노이즈를 제거하고, S/N(signal to noise)가 3
3 3
당 절단 효소(PNGase F)에 의해 분리된 당을 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계(단계 1);상기 단계 1에서 얻은 질량 스펙트럼에서 베이스 라인을 수정하여 노이즈를 제거하고, S/N(signal to noise)가 3
4 4
제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 단계 1에서 당 절단 효소에 의해 분리된 당을 정제하기 위하여 3개 이상의 분획물을 제조하는 것을 특징으로 하는 혈액시료로부터 당 동정을 위한 새로운 생물정보처리 분석 방법
5 5
제4항에 있어서, 상기 분획물은 크로마토그래피를 이용하여 분리 분치하는 것을 특징으로 하는 혈액시료로부터 당 동정을 위한 새로운 생물정보처리 분석 방법
6 6
제5항에 있어서, 상기 크로마토그래피의 이동상은 10% 아세토니트릴(ACN)/물(H20), 20% ACN/H20 및 40% ACN/H20으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 하나인 것을 특징으로 하는 혈액시료로부터 당 동정을 위한 새로운 생물정보처리 분석 방법
7 7
제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 방법에 의해 분석된 악성 종양의 질병 표지자
8 8
제7항에 있어서, 상기 악성 종양의 질병 표지자는(1) 3Hex 4HexNac;(2) 6Hex 4HexNac;(3) 3Hex 3HexNac 1DxyHex;(4) 4Hex 3HexNac 1DxyHex;(5) 6Hex 5HexNac;(6) 3Hex 4HexNac 1DxyHex;(7) 7Hex 6HexNac 1NeuAc;(8) 6Hex 5HexNac 1DxyHex 2NeuAc;(9) 7Hex 6HexNac 1DxyHex 1NeuAc;(10) 4Hex 5HexNac 1DxyHex 1NeuAc;(11) 13Hex 3HexNac 0DxyHex 0NeuAc;(12) 6Hex 5HexNac 1DxyHex 1NeuAc; 및(13) 6Hex 5HexNac 0DxyHex 2NeuAc으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 당사슬(glycoform)인 것을 특징으로 하는 악성 종양의 질병 표지자
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패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 한국기초과학지원연구원 질량분석기반 디지털 분자진단 의료시스템 개발 질량분석기반 신기술 융합형 진단기술 개발