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핵산 마이크로어레이 및 이의 제조방법

  • 기술번호 : KST2015026491
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요약 본 발명은 나노 입자를 이용하여 제조된 핵산 마이크로어레이(nucleic acid microarray) 및 이의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는, 원판 핵산 마이크로어레이에 고정된 핵산과 상보적으로 결합 할 수 있는 핵산 조각이 고정된 나노입자를 혼성화시켜 나노입자를 원판 마이크로어레이 상에 위치시키고, 나노입자의 위치정보를 유지시킨 상태에서 하이드로 겔을 이용하여 새 기판으로 이동시켜서 복제된 핵산 마이크로어레이를 제작하는 방법 및 이와 같이 제작된 핵산 마이크로어레이에 관한 것이다.
Int. CL C12Q 1/68 (2011.01) G06F 19/20 (2011.01)
CPC C12Q 1/6837(2013.01) C12Q 1/6837(2013.01) C12Q 1/6837(2013.01) C12Q 1/6837(2013.01)
출원번호/일자 1020020082125 (2002.12.21)
출원인 엘지전자 주식회사
등록번호/일자 10-0498288-0000 (2005.06.21)
공개번호/일자 10-2004-0055441 (2004.06.26) 문서열기
공고번호/일자 (20050701) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2002.12.21)
심사청구항수 20

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 엘지전자 주식회사 대한민국 서울특별시 영등포구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김수현 대한민국 서울특별시서초구
2 임귀삼 대한민국 서울특별시강서구
3 심봉주 대한민국 서울특별시은평구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 박장원 대한민국 서울특별시 강남구 강남대로 ***, *층~*층 (논현동, 비너스빌딩)(박장원특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 엘지전자 주식회사 대한민국 서울특별시 영등포구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application
2002.12.21 수리 (Accepted) 1-1-2002-0423545-87
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2003.10.16 수리 (Accepted) 4-1-2003-0055522-32
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2004.09.23 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2004.10.14 수리 (Accepted) 9-1-2004-0059390-35
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2004.12.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2004-0538343-40
6 명세서등보정서
Amendment to Description, etc.
2005.02.21 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2005-0091408-01
7 의견서
Written Opinion
2005.02.21 수리 (Accepted) 1-1-2005-0091406-10
8 등록결정서
Decision to grant
2005.04.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2005-0191135-01
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2008.08.08 수리 (Accepted) 4-1-2008-5128387-76
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2009.04.27 수리 (Accepted) 4-1-2009-5080835-50
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2009.11.03 수리 (Accepted) 4-1-2009-0023850-26
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.05.22 수리 (Accepted) 4-1-2015-5068349-97
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.05.28 수리 (Accepted) 4-1-2020-5118228-40
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번호 청구항
1 1
기판 상에, 원판 핵산 마이크로어레이 상의 핵산과 상보적 염기 서열을 갖는 핵산을 포함하는 핵산 마이크로어레이로서,상기 원판 핵산 마이크로어레이 상의 핵산과 상보적 염기 서열을 갖는 핵산은 나노 입자와 결합되어 있으며, 상기 나노 입자에 의하여 하이드로겔 내에 고정되어 기판에 결합되어 있는 것이고,원판 핵산 마이크로어레이 상의 핵산과 상보적 염기 서열을 갖는 핵산이 상기 원판 핵산 마이크로어레이 상의 핵산 분자의 공간적 배열과 거울상의 대칭 배열 상태를 유지하면서 고정되어 있는 것을 특징으로 하는 핵산 마이크로어레이
2 2
제 1 항에 있어서, 상기 핵산이 각종 DNA, RNA, PNA(Peptide Nucleic Acids), 또는 LNA(Locked Nucleic Acids)와 같이 염기서열 형태로 정보를 가지며 상보적인 염기서열을 포함하는 핵산과 선택적으로 결합할 수 있는 분자인 핵산 마이크로어레이
3 3
제 1 항에 있어서, 상기 하이드로 겔이 에틸렌(ethylene)기를 가진 모노머 유니트가 중합 반응하여 만들어진 친수성 고분자인 핵산 마이크로어레이
4 4
제 3 항에 있어서, 상기 하이드로 겔의 모노머가 에틸렌기를 가진 폴리머화가 가능한 화합물로서, 아크릴아마이드(acrylamide), 메타크릴아마이드(methacrylamide), 아크릴산(acrylic acid), 메타크릴산 (methacrylic acid), 또는 이들과 구조적으로 연관된 아마이드(amide)나 에스테르(ester)인 핵산 마이크로어레이
5 5
제 4 항에 있어서, 상기 하이드로 겔이 폴리아크릴아마이드 겔인 핵산 마이크로어레이
6 6
제 1 항에 있어서, 상기 나노입자의 지름이 수 nm 내지 100 nm인 핵산 마이크로어레이
7 7
제 1 항에 있어서, 상기 기판이 에틸렌기로 표면 개질된 것인 핵산 마이크로어레이
8 8
1) 제작하고자 하는 핵산 마이크로어레이와 상보적인 염기서열을 갖는 핵산이 배열된 원판 핵산 마이크로어레이를 제작하는 단계; 2) 상기 원판 핵산 마이크로어레이를 핵산 마이크로어레이를 구성할 핵산이 결합된 나노입자를 포함하는 용액에 담가, 서로 상보적 염기서열을 갖는 원판 핵산 마이크로어레이 상의 핵산과 나노입자 상의 핵산을 혼성화시키는 단계; 3) 상기 나노입자가 결합된 원판 핵산 마이크로어레이를 세척하여 비선택적으로 결합된 나노입자를 제거하는 단계; 4) 상기 나노입자가 결합된 원판 핵산 마이크로어레이 상에 기판을 대고, 그 사이를 하이드로 겔로 채워, 원판 핵산 마이크로어레이 상의 상보적 염기서열을 갖는 핵산의 공간적 배열과 거울상의 대칭 배열 상태를 유지한 채로 하이드로 겔 내에 나노입자를 고정시키는 단계; 및 5) 나노입자가 고정된 하이드로 겔이 고정된 기판을 떼어 내어 복제된 핵산 마이크로어레이를 얻는 단계를 포함하여 이루어지는 핵산 마이크로어레이 제작방법
9 9
제 8 항에 있어서, 상기 단계 5) 이후의 원판 핵산 마이크로어레이에 단계 2) 내지 단계 5)의 과정을 반복하는 단계를 추가적으로 포함함으로써, 하나의 원판 핵산 마이크로어레이를 사용하여 다수의 복제된 핵산 마이크로어레이를 제작할 수 있는 방법
10 10
제 8 항에 있어서, 상기 핵산으로서 각종 DNA, RNA, PNA(Peptide Nucleic Acids), 또는 LNA(Locked Nucleic Acids)와 같이 염기서열 형태로 정보를 가지며 상보적인 염기서열을 포함하는 핵산과 선택적으로 결합할 수 있는 모든 분자를 사용하는 방법
11 11
제 8 항에 있어서, 상기 나노입자로서 지름이 수 nm 내지 100 nm인 것을 사용하는 방법
12 12
제 8 항에 있어서, 상기 단계 2)를 나노입자에 스트렙트아비딘(streptavidin)을 고정시키고, 핵산의 끝에 비오틴(biotin)을 결합시켜서, 스트렙트아비딘-비오틴의 강한 결합을 통하여 나노입자에 핵산을 고정시켜서 수행하는 방법
13 13
제 8 항에 있어서, 상기 단계 2)를 금(gold) 등과 같이 티올(thiol)기와 결합할 수 있는 금속으로 만든 나노입자 또는 표면이 이들 금속으로 된 나노입자와 티올기가 부착된 핵산을 사용하여, 상기 금속과 핵산의 티올기와의 공유결합을 통하여 나노입자에 핵산을 고정시켜서 수행하는 방법
14 14
제 8 항에 있어서, 상기 단계 4)를 에틸렌(ethylene)기를 갖는 중합 가능한 모노머를 포함하는 용액을 원판과 기판 사이에 주입하고, 이들을 중합 반응시켜, 원판과 기판 사이에 친수성 하이드로 겔을 형성시켜서 수행하는 방법
15 15
제 14 항에 있어서, 상기 단계 4)를 원판과 기판 사이에 아크릴아마이드(acrylamide), 메타크릴아마이드(methacrylamide), 아크릴산(acrylic acid), 메타크릴산 (methacrylic acid), 또는 이들과 구조적으로 연관된 아마이드(amide)나 에스테르(ester)를 포함하는 용액을 주입하여 친수성 하이드로 겔을 형성시켜서 수행하는 방법
16 16
제 15 항에 있어서, 상기 단계 4)를 원판과 기판 사이에 아크릴아마이드(acrylamide) 용액을 넣고 중합반응을 시켜 폴리아크릴아마이드(polyacrylamide) 겔을 형성시켜서 수행하는 방법
17 17
제 16 항에 있어서, 상기 형성된 폴리아크릴아마이드 겔의 구조적 강도를 강화시키기 위하여, 이들을 가교시켜 줄 수 있는 비스아크릴아마이드(bisacrylamide)와 같은 가교제를 아크릴아마이드 용액 첨가하고, 이들을 중합반응 시켜서 수행하는 방법
18 18
제 14 항에 있어서, 상기 중합 반응을 모노머 용액에 퍼설페이트(persulfate) 및 테트라에틸메틸렌디아민(tetraetylmethylenediamine; TEMED)를 첨가하거나, 퍼설페이트를 첨가하고 가열하거나, 과산화수소 및 Fe2+를 첨가하거나, 리보플라빈(riboflavin)을 첨가하고 가시광선을 조사하거나, 퍼설페이트 및 바이설파이트(bisulfite)를 첨가하거나, 퍼설페이트 및 티오설페이트(thiosulfate)를 첨가하거나, 감마광 조사하여 수행하는 방법
19 19
제 8 항에 있어서, 하이드로 겔과 결합이 잘 되도록 하기 위하여 기판의 표면을 에틸렌(ethylene)기로 개질시켜 사용하는 방법
20 20
제 8 항에 있어서, 상기 단계 5)의 원판과 기판의 분리 시 핵산-핵산 결합력에 의하여 핵산이 손상되거나 핵산 마이크로어레이에서 떨어지는 것을 방지하기 위하여, 온도를 올려 원판 상의 핵산과 나노입자에 고정된 핵산 사이에 결합을 약화시킨 후 상기 단계 5)를 수행하는 방법
21 20
제 8 항에 있어서, 상기 단계 5)의 원판과 기판의 분리 시 핵산-핵산 결합력에 의하여 핵산이 손상되거나 핵산 마이크로어레이에서 떨어지는 것을 방지하기 위하여, 온도를 올려 원판 상의 핵산과 나노입자에 고정된 핵산 사이에 결합을 약화시킨 후 상기 단계 5)를 수행하는 방법
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