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mRNA 발현 값의 발현 차이를 이용하여 유전자 집합을 검출하기 위한 장치 및 그 방법

  • 기술번호 : KST2015127810
  • 담당센터 : 서울서부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-6124-6930
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명에 의한 mRNA 발현 값의 발현 차이를 이용하여 유전자 집합을 검출하기 위한 장치 및 그 방법이 개시된다. 본 발명에 따른 유전자 집합을 검출하기 위한 장치는 기 설정된 개수의 유전자와 샘플로 이루어진 다수의 바이클러스터들 중 기 설정된 개수의 바이클러스터를 선택하는 제1 선택부; 선택된 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들을 수정하는 수정부; 수정된 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들 각각에 대한 점수를 산출하는 점수화부; 및 산출된 상기 점수를 기반으로 적어도 하나의 바이클러스터를 선택하는 제2 선택부를 포함한다.
Int. CL G06F 19/24 (2011.01)
CPC G06F 19/24(2013.01) G06F 19/24(2013.01)
출원번호/일자 1020140058421 (2014.05.15)
출원인 연세대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-1514762-0000 (2015.04.17)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20150520) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2014.05.15)
심사청구항수 14

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서대문구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 박상현 대한민국 서울특별시 양천구
2 김정림 대한민국 서울특별시 서대문구
3 안재균 대한민국 서울특별시 서초구
4 여윤구 대한민국 경기도 부천시 소사구
5 윤영미 대한민국 서울특별시 양천구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인우인 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 ***, *층(역삼동, 중평빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서대문구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2014.05.15 수리 (Accepted) 1-1-2014-0457361-38
2 보정요구서
Request for Amendment
2014.05.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2014-0084747-03
3 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2014.06.02 수리 (Accepted) 1-1-2014-0523051-72
4 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)
2014.09.12 수리 (Accepted) 1-1-2014-0865698-12
5 [우선심사신청]선행기술조사의뢰서
[Request for Preferential Examination] Request for Prior Art Search
2014.09.15 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
6 [우선심사신청]선행기술조사보고서
[Request for Preferential Examination] Report of Prior Art Search
2014.09.16 수리 (Accepted) 9-1-2014-0075969-81
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.09.25 수리 (Accepted) 4-1-2014-5114224-78
8 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2014.12.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0894131-74
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2015.02.23 수리 (Accepted) 1-1-2015-0172824-59
10 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2015.02.23 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2015-0172825-05
11 등록결정서
Decision to grant
2015.04.14 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2015-0248579-18
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
기 설정된 개수의 유전자와 샘플로 이루어진 다수의 바이클러스터들 중 기 설정된 개수의 바이클러스터를 선택하는 제1 선택부;선택된 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들을 수정하는 수정부;수정된 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들 각각에 대한 점수를 산출하는 점수화부; 및산출된 상기 점수를 기반으로 적어도 하나의 바이클러스터를 선택하는 제2 선택부;를 포함하는 유전자 집합을 검출하기 위한 장치
2 2
제1 항에 있어서,상기 제1 선택부는,N개의 바이클러스터들 중 제1 확률 p로 점수가 가장 높은 상위 k개의 바이클러스터들 중에서 임의의 하나를 선택하고, 나머지 제2 확률 (1-p)로 (N-k)개의 바이클러스터들 중에서 임의의 하나를 선택하는 과정을 n번 반복하여 n개의 바이클러스터를 선택하는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 장치
3 3
제1 항에 있어서,상기 수정부는,선택된 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들 각각의 유전자와 샘플들을 서로 교차시키거나 추가, 삭제하거나 또는 임의로 바이클러스터들의 유전자와 샘플을 임의로 추가, 삭제하는 과정을 수행하여 결과로 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들 각각을 수정하는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 장치
4 4
제1 항에 있어서,상기 점수화부는,수정된 상기 바이클러스터에 포함된 유전자에 대해서 해당 바이클러스터에 속해 있는 샘플들에서의 발현 값의 총합과 해당 바이클러스터에 속해 있지 않은 샘플에서의 발현 값의 총합을 산출하고,산출된 발현 값의 총합의 평균값을 구하여 구한 상기 평균값을 기반으로 유전자의 점수를 산출하며, 산출된 상기 유전자의 점수를 기반으로 해당 바이클러스터의 점수를 산출하는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 장치
5 5
제1 항에 있어서,상기 제2 선택부는,산출된 상기 바이클러스터의 점수에 따라 기 설정된 개수의 바이클러스터들을 정렬한 후 가장 점수가 높은 바이클러스터부터 미리 설정된 임계값까지의 점수를 갖는 바이클러스터를 선택하는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 장치
6 6
제5 항에 있어서,상기 제2 선택부는,기 선택된 바이클러스터에 포함된 유전자 집합과 유사한 유전자를 가지는 바이클러스터는 선택에서 제외시키는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 장치
7 7
제5 항에 있어서,상기 제2 선택부는,기 선택된 바이클러스터에 포함되는 유전자 집합과 20% 이상 동일한 유전자를 갖는 바이클러스터는 선택에서 제외시키는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 장치
8 8
기 설정된 개수의 유전자와 샘플로 이루어진 다수의 바이클러스터들 중 기 설정된 개수의 바이클러스터를 선택하는 제1 선택단계;선택된 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들을 수정하는 수정단계;수정된 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들 각각에 대한 점수를 산출하는 점수화단계; 및산출된 상기 점수를 기반으로 적어도 하나의 바이클러스터를 선택하는 제2 선택단계;를 포함하는 유전자 집합을 검출하기 위한 방법
9 9
제8 항에 있어서,상기 제1 선택단계는,N개의 바이클러스터들 중 제1 확률 p로 점수가 가장 높은 상위 k개의 바이클러스터들 중에서 임의의 하나를 선택하고, 제2 확률 (1-p)로 (N-k)개의 바이클러스터들 중에서 임의의 하나를 선택하는 과정을 n번 반복하여 n개의 바이클러스터를 선택하는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 방법
10 10
제8 항에 있어서,상기 수정단계는,선택된 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들 각각의 유전자와 샘플들을 서로 교차시키거나 추가, 삭제하거나 또는 임의로 바이클러스터들의 유전자와 샘플을 임의로 추가, 삭제하는 과정을 수행하여 결과로 상기 기 설정된 개수의 바이클러스터들 각각을 수정하는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 방법
11 11
제8 항에 있어서,상기 점수화단계는,수정된 상기 바이클러스터에 포함된 유전자에 대해서 해당 바이클러스터에 속해 있는 샘플들에서의 발현 값의 총합과 해당 바이클러스터에 속해 있지 않은 샘플에서의 발현 값의 총합을 산출하고,산출된 발현 값의 총합의 평균값을 구하여 구한 상기 평균값을 기반으로 유전자의 점수를 산출하며, 산출된 상기 유전자의 점수를 기반으로 해당 바이클러스터의 점수를 산출하는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 방법
12 12
제8 항에 있어서,상기 제2 선택단계는,산출된 상기 바이클러스터의 점수에 따라 기 설정된 개수의 바이클러스터들을 정렬한 후 가장 점수가 높은 바이클러스터부터 미리 설정된 임계값까지의 점수를 갖는 바이클러스터를 선택하는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 방법
13 13
제12 항에 있어서,상기 제2 선택단계는,기 선택된 바이클러스터에 포함된 유전자 집합과 유사한 유전자를 가지는 바이클러스터는 선택에서 제외시키는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 방법
14 14
제12 항에 있어서,상기 제2 선택단계는,기 선택된 바이클러스터에 포함되는 유전자 집합과 20% 이상 동일한 유전자를 갖는 바이클러스터는 선택에서 제외시키는 것을 특징으로 하는 유전자 집합을 검출하기 위한 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 미래창조과학부 연세대학교 산학협력단 중견연구자지원사업(도약연구) 데이터마이닝 분석기법을 이용한 질병 모듈 탐색 및 질병 네트워크 구축에 관한 연구