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류머티즘에 특이적인 HLA 타이핑을 위한 프로브 조성물에 있어서, 서열번호 2의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 3의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 4의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 5의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 6의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 7의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 8의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 9의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 10의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브를 포함하는 류머티즘에 특이적인 HLA 타이핑을 위한 프로브 조성물
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류머티즘에 특이적인 HLA 타이핑을 위한 DNA 칩에 있어서,서열번호 2의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 3의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 4의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 5의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 6의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 7의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 8의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 9의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브와, 서열번호 10의 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드와 이러한 올리고뉴클레오티드에 상보적인 염기서열을 갖는 올리고뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 프로브를 포함하는 류머티즘에 특이적인 HLA 타이핑을 위한 DNA 칩
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제2항에 있어서,상기 프로브들은 동일 기판 상에 마이크로어레이되어 있는 것을 특징으로 하는 류머티즘에 특이적인 HLA 타이핑을 위한 DNA 칩
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서열번호 11 내지 14의 정방향 프라이머들과 서열번호 15의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트, DNA 중합효소, dNTPs, PCR 완충용액 및 PCR 증폭산물의 표지물질을 포함하는 류머티즘 관련 HLA-DRB1 대립유전자를 특이적으로 증폭하는 PCR 증폭키트
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시료 DNA를 PCR을 수행하여 증폭하는 단계와, 상기 PCR 증폭 산물을 청구항 제2항에 정의된 류머티즘에 특이적인 HLA 타이핑을 위한 DNA 칩 상에 집적된 프로브들에 혼성화시키는 단계와, 상기 혼성화 여부에 따라 HLA-DRB1 대립유전자형을 분석하는 단계를 포함하는 류머티즘 특이적인 HLA-DRB1 대립유전자형 분석방법
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제5항에 있어서, 상기 HLA-DRB1 대립유전자형을 분석하는 단계에 있어서, 류머티즘 관련 HLA-DRB1 대립유전자를 4자리 숫자로 표시되는 아형 수준까지 판별하는 것을 특징으로 하는 류머티즘 특이적인 HLA-DRB1 대립유전자형 분석방법
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제5항 또는 제6항에 있어서,상기 HLA-DRB1 대립유전자형을 분석하는 단계는, 형광표지된 PCR 증폭 산물을 상기 프로브들에 대해 혼성화시킨 후 측정된 형광세기가 컷오프값 이상을 나타내는 프로브에 대해서는 "1"의 값을 할당하고 형광세기가 컷오프값 미만을 나타내는 프로브에 대해서는 "0"의 값을 할당하는 단계와,상기 할당된 값에 기초하여 전체 프로브 조합 세트에 대해 "1"과 "0"으로 이루어진 바이너리 코드(binary code)를 생성하는 단계와, 상기 생성된 각 바이너리 코드를 분석대상이 되는 HLA-DRB1의 대립유전자와 매칭시키는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 류머티즘 특이적인 HLA-DRB1 대립유전자형 분석방법
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제7항에 있어서,2배체 상에 존재하는 대립유전자 1과 대립유전자 2 각각의 바이너리 코드의 조합을 생성하고, 이러한 바이너리 코드의 조합으로부터 HLA-DRB1 대립유전자형이 동형접합체(homozygote)인지 또는 이형접합체(heterozygote)인지 분석하는 것을 특징으로 하는 류머티즘 특이적인 HLA-DRB1 대립유전자형 분석방법
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청구항 제2항 또는 제3항에 정의된 DNA 칩과, 류머티즘 관련 HLA-DRB1 대립유전자를 특이적으로 증폭하기 위한 서열번호 11 내지 14의 정방향 프라이머들과 서열번호 15의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트와, 상기 DNA 칩과 혼성화되는 증폭된 유전자 산물을 검출하기 위한 표지수단을 포함하는 류머티즘 특이적인 HLA-DRB1 대립유전자형을 분석할 수 있는 검사 키트
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