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인-실리코 분석 방법을 통한 인트론 기반 다형성 프라이머세트의 제조방법

  • 기술번호 : KST2015150628
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 인-실리코 분석 방법을 통한 인트론 기반 다형성 프라이머 세트의 제조방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로 십자화과(Brassicaceae) 식물 유전체와 발현 유전자 표지 염기 서열(Expressed Sequence Tag)을 비교하고 그 결과를 공지된 십자화과(Brassicaceae) 식물 발현 유전자 서열 및 단백질 서열과 비교하여 공통된 엑손을 구분한 다음, 구분된 엑손사이의 인트론을 이용하여 인-실리코(in- silico) 시뮬레이션을 수행함으로써 인트론 기반 다형성(Intron Based Polymorphism) 프라이머를 제작하는 방법에 관한 것이다. 상기 본 발명의 프라이머 세트의 제조방법은 인-실리코 방법으로 분자 표지를 신속하게 대량으로 생산함으로써, 십자화과 식물의 품종을 구별하거나 유용한 형질을 지닌 신품종을 개발하는데 유용하게 사용될 수 있으며 십자화과 식물의 정밀한 유전자 지도 제작에 유용하게 이용될 수 있다. 인트론, 다형성, 프라이머, 인-실리코
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)
CPC C12Q 1/6827(2013.01) C12Q 1/6827(2013.01) C12Q 1/6827(2013.01)
출원번호/일자 1020080023266 (2008.03.13)
출원인 대한민국(농촌진흥청장)
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2009-0098087 (2009.09.17) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 거절
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2008.03.13)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 대한민국(농촌진흥청장) 대한민국 전라북도 전주시 덕진구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 설영주 대한민국 경기 용인시 처인구
2 문정환 대한민국 경기 수원시 팔달구
3 김정선 대한민국 경기 수원시 장안구
4 진민아 대한민국 경기 수원시 권선구
5 임명호 대한민국 경기 수원시 권선구
6 권수진 대한민국 경기 수원시 팔달구
7 김진아 대한민국 경기 수원시 팔달구
8 이수인 대한민국 경기 안성시
9 강만정 대한민국 경기 수원시 권선구
10 김창국 대한민국 경기 수원시 권선구
11 박동석 대한민국 경기 수원시 장안구
12 박범석 대한민국 경기 수원시 장안구
13 한장호 대한민국 경기 수원시 권선구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이희숙 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 **길 ** *층 (역삼동, JS빌딩)(시원국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2008.03.13 수리 (Accepted) 1-1-2008-0182622-81
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2008.10.08 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2008.11.27 수리 (Accepted) 9-1-2008-0076719-55
4 [대리인사임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Resignation of Agent] Report on Agent (Representative)
2009.06.18 수리 (Accepted) 1-1-2009-0369499-70
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2010.01.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2010-0035566-13
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2010.03.05 수리 (Accepted) 4-1-2010-5038211-75
7 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2010.03.26 수리 (Accepted) 1-1-2010-0194423-86
8 거절결정서
Decision to Refuse a Patent
2010.06.03 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2010-0238991-54
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.12.30 수리 (Accepted) 4-1-2014-5159891-99
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2017.06.13 수리 (Accepted) 4-1-2017-0030830-54
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2018.07.13 수리 (Accepted) 4-1-2018-5134139-02
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번호 청구항
1 1
(a) 십자화과(Brassicaceae) 식물 유전체와 발현 유전자 표지 염기 서열(Expressed Sequence Tag)을 비교하여 상기 십자화과(Brassicaceae) 식물 유전체에 포함된 엑손과 인트론을 구분하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 구분된 엑손과 공지된 십자화과(Brassicaceae) 식물 발현 유전자 서열 및 단백질 서열을 비교하여 공통된 엑손을 구분하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 구분된 엑손사이의 인트론을 이용하여 인-실리코(in-silico) 시뮬레이션을 수행함으로써 인트론 기반 다형성(Intron Based Polymorphism) 프라이머를 제작하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 인트론 기반 다형성 프라이머(Intron Based Polymorphism) 세트의 제조방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 (a) 단계에 유전자 예측용 프로그램을 이용하여 십자화과(Brassicaceae) 식물 유전체에 포함된 엑손과 인트론을 추가적으로 구분하는 단계를 포함하는 인트론 기반 다형성 프라이머(Intron Based Polymorphism) 세트의 제조방법
3 3
제1항에 있어서, (d) 상기 (c) 단계에서 제조된 프라이머 세트의 염기 서열을 데이터베이스에 저장하는 단계; 및 (e) 상기 (d) 단계의 데이터베이스에서 분석 대상이 되는 유전자 부위에 설계된 프라이머를 선발하는 단계를 추가적으로 포함하는 인트론 기반 다형성 프라이머(Intron Based Polymorphism) 세트의 제조방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 십자화과(Brassicaceae) 식물은 배추, 양배추, 무 및 브로콜리로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 인트론 기반 다형성(Intron Based Polymorphism) 프라이머 세트의 제조방법
5 5
제1항에 있어서, 상기 (c) 단계에 인-실리코(in- silico) 시뮬레이션은 상기 (b) 단계에서 구분된 엑손사이의 인트론을 이용하여 프라이머의 적정온도, 최고온도, 최저온도, 최대 GC함량 및 최소 GC함량을 파라미터로 사용하여 인트론 기반 다형성(Intron Based Polymorphism) 프라이머를 제작하는 것을 특징으로 하는 인트론 기반 다형성(Intron Based Polymorphism) 프라이머 세트의 제조방법
6 6
제1항의 제조방법으로 제조된 프라이머 세트를 이용하여 십자화과(Brassicaceae) 식물의 다형성을 검출하는 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 농촌진흥청 농업생명공학연구원 농업생명공학연구원 기관프로젝트 브라시카 제놈 구조 해독 연구