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정방향 프라이머 결합 영역, 및 표적 서열의 제 1 영역에 특이적으로 혼성화하는 LHS(left hybridization sequence) 영역을 포함하는 LPO(left probe oligonucleotide); 및 상기 표적 서열의 상기 제 1 영역과 연속으로 연결된 제 2 영역에 특이적으로 혼성화하는 RHS(right hybridization sequence) 및 역방향 프라이머 결합 영역을 포함하는 RPO(right probe oligonucleotide);로 구성되고,상기 LHS(left hybridization sequence) 및 상기 RHS(right hybridization sequence)가 서열번호 1 및 서열번호 2 인 제 1 프로브, 서열번호 3 및 서열번호 4 인 제 2 프로브, 서열번호 5 및 서열번호 6 인 제 3 프로브, 서열번호 7 및 서열번호 8 인 제 4 프로브, 및 서열번호 9 및 서열번호 10 인 제 5 프로브로 이루어진 그룹에서 선택되는 어느 하나인 것인 스터퍼(stuffer) 서열을 가지지 않는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 (novel swine-origin influenza A/H1N1 virus) 검출용 프로브
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제 1 항에 있어서,상기 서열번호 1 및 서열번호 2 인 제 1 프로브는 인플루엔자 A형 유전자 M (matrix) 의 서열번호 11 에 특이적으로 혼성 결합하고,상기 서열번호 3 및 서열번호 4 인 제 2 프로브는 계절 인플루엔자 유전자 H1 의 서열번호 12 에 특이적으로 혼성 결합하고,상기 서열번호 5 및 서열번호 6 인 제 3 프로브는 계절 인플루엔자 유전자 H3 의 서열번호 13 에 특이적으로 혼성 결합하고,상기 서열번호 7 및 서열번호 8 인 제 4 프로브는 신종 인플루엔자 A 특이 유전자 H1 의 서열번호 14 에 특이적으로 혼성 결합하고,상기 서열번호 9 및 서열번호 10 인 제 5 프로브는 신종 인플루엔자 A 특이 유전자 NP 의 서열번호 15 에 특이적으로 혼성 결합하는 것을 특징으로 하는 스터퍼 서열을 가지지 않는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 (novel swine-origin influenza A/H1N1 virus) 검출용 프로브
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제 1항에 의한 스터퍼 서열을 가지지 않는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 검출용 프로브를 2개 내지 5개 포함하는 스터퍼(stuffer) 서열을 가지지 않는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 (novel swine-origin influenza A/H1N1 virus) 검출용 프로브 세트
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제 1항의 프로브를 이용하여 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 (novel swine-origin influenza A/H1N1 virus)의 존재를 검출하는 방법으로 하기 단계를 포함하는 방법:(1) 시료를 제 1항의 스터퍼 서열을 가지지 않는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 검출용 프로브와 접촉시켜 혼성화시키는 단계;(2) 상기 시료와 혼성화된 프로브를 라이게이션(ligation)하여 프로브 어셈블리를 형성시키는 단계;(3) 상기 형성된 프로브 어셈블리를 주형으로 하여 PCR 증폭시키는 단계; (4) 상기 증폭 산물을 분리 및 검출하는 단계; 및(5) 상기 증폭 산물이 분리, 검출되는 경우 상기 시료 내에 상기 증폭된 프로브 어셈블리를 구성하는 프로브가 상보적으로 결합하는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스가 존재하는 것으로 판단하는 단계
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제 4항에 있어서, 상기 (1) 단계에서, 상기 시료의 표적 서열 제 1 영역과 상기 LPO 프로브의 LHS가 혼성화되고, 상기 시료의 표적 서열 제 2 영역과 상기 RPO 프로브의 RHS 가 혼성화되는 것을 특징으로 하는, 방법
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제 4항에 있어서, 상기 (2) 단계에서, 상기 시료의 제 1 영역과 혼성 결합된 LPO의 LHS 말단과 상기 시료의 제 2 영역과 혼성 결합된 RPO 의 RHS 의 말단을 라이게이션하여 정방향 프라이머 결합 영역-LHS-RHS-역방향 프라이머 결합 영역 으로 구성된 프로브 어셈블리를 형성하는 것을 특징으로 하는, 방법
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제 4 항에 있어서,상기 (3) 단계에서, 상기 프로브 어셈블리를 구성하는 LPO(left probe oligonucleotide)가 포함하는 정방향 프라이머 결합 영역, 및 RPO(right probe oligonucleotide)가 포함하는 역방향 프라이머 결합 영역에 상보적으로 결합하는 프라이머 쌍을 사용하여 상기 형성된 프로브 어셈블리가 PCR 증폭되는 것을 특징으로 하는, 방법
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제 4 항에 있어서,상기 (4) 단계에서, 프로브 어셈블리를 주형으로 하여 PCR 증폭된 정도를 CE-SSCP(Capillary Electrophoresis-Single strand conformation polymorphism)를 이용하여 분리 및 검출하는 것을 특징으로 하는, 방법
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제 4 항에 있어서,상기 (1) 단계에서, 제3항의 스터퍼 서열을 가지지 않는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 검출용 프로브 세트를 사용하여 복수의 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스의 존재를 한번에 검출하는 것을 특징으로 하는, 방법
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제1항의 스터퍼 서열을 가지지 않는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 검출용 프로브, 또는 제 3항의 스터퍼 서열을 가지지 않는 프로브 세트를 포함하는 신종 인플루엔자 A/H1N1 바이러스 (novel swine-origin influenza A/H1N1 virus) 검출용 키트
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