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상호작용면체를 기반으로 한 단백질과 상호작용하는 물질의검색 시스템 및 방법과 이를 위한 기록매체

  • 기술번호 : KST2015170651
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 상호작용면체를 기반으로 한 단백질과 상호작용하는 물질을 검색하기 위한 것으로서, 검색 대상 단백질의 아미노산 서열이 입력됨에 따라, 검색 대상 단백질의 3차원 구조를 생성하고, 표면 구조를 추출한 후 데이터베이스에 저장된 상호작용면체와 매칭하여 지정된 값 이상으로 매칭하는 상호작용면체를 검색 대상 단백질의 상호작용면체로 추출하고, 데이터베이스로부터 검색 대상 단백질의 상호작용면체에 대응되는 상호작용면체를 가진 물질을 검색 대상 단백질과 상호작용하는 물질로 추출하고/거나, 검색 대상 단백질의 상호작용면체에 데이터베이스로부터 선택한 물질을 도킹하고 도킹시 에너지 값이 지정된 값 이하인 화합물을 검색 대상 단백질과 상호작용하는 물질로 추출하기 위한 검색 시스템, 방법 및 기록매체에 관한 것이다.상호작용면체, 선도물질, 매칭, 도킹
Int. CL G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01)
CPC G01N 33/6845(2013.01) G01N 33/6845(2013.01) G01N 33/6845(2013.01)
출원번호/일자 1020060062631 (2006.07.04)
출원인 한국생명공학연구원, 오브젝트인터랙션테크놀로지스(주)
등록번호/일자 10-0773055-0000 (2007.10.29)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20071102) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2006.07.04)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구
2 (주)한국바이오정보 대한민국 서울특별시 서초구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 박종화 대한민국 대전 유성구
2 공성삼 대한민국 경남 통영시
3 박대의 대한민국 대전 중구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이세진 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 *길 **, 신관 *층~*층, **층(역삼동, 광성빌딩)(특허법인다나)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 주식회사 원오믹스 서울특별시 마포구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2006.07.04 수리 (Accepted) 1-1-2006-0480559-34
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2007.03.09 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2007.04.12 수리 (Accepted) 9-1-2007-0021415-79
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2007.06.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0323362-35
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2007.08.13 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2007-0583930-43
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2007.08.13 수리 (Accepted) 1-1-2007-0583926-60
7 등록결정서
Decision to grant		 2007.09.07 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0487275-62
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2008.04.10 수리 (Accepted) 4-1-2008-5054980-73
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.05 수리 (Accepted) 4-1-2015-0007152-08
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.03.29 수리 (Accepted) 4-1-2019-0023661-49
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
제어부; 단백질에 대한 정보, 상호작용면체에 대한 정보, 화합물에 대한 정보를 저장하고 있는 데이터베이스; I/O 인터페이스; 검색 대상 단백질의 아미노산 서열이 입력됨에 따라 데이터베이스를 참조하여 상기 단백질의 3차원 구조를 생성하고, 이로부터 표면 구조를 추출한 후 상기 표면 구조와 데이터베이스에 저장된 각 상호작용면체를 매칭하여 지정된 값 이상으로 매칭하는 상호작용면체를 상기 단백질의 상호작용면체로 추출하는 상호작용면체 추출 장치; 데이터베이스로부터 검색 대상 단백질의 상호작용면체에 대응하는 상호작용면체를 가진 물질을 추출하는 상호작용물질 추출 장치; 및 검색 대상 단백질의 상호작용면체와 데이터베이스로부터 선택한 물질을 도킹하고 도킹시의 에너지를 계산하는 도킹 에너지 계산 장치; 및 저장수단을 포함하여 구성되는 상호작용면체를 기반으로 한 단백질과 상호작용하는 물질의 검색 장치
2 2
제 1항에 있어서, 데이터베이스로부터 도킹하고자 하는 일련의 물질을 선별하는 선도물질 선별 장치를 추가로 포함하여 구성되는 것을 특징으로 하는 상호작용면체를 기반으로 한 단백질과 상호작용하는 물질의 검색 장치
3 3
제 1항에 있어서, 상호작용면체 추출 장치는 접근 가면 알고리즘을 이용하여 검색 대상 단백질의 3차원 구조로부터 표면 구조를 추출하는 것을 특징으로 하는 검색 장치
4 4
제 1항에 있어서, 상호작용면체 추출 장치는 구조 비교 알고리즘을 이용하여 검색 대상 단백질의 상호작용면체를 추출하는 것을 특징으로 하는 검색 장치
5 5
제 1항에 있어서, 도킹 에너지 계산 장치는 다음 수학식 [1] Ebind = Evdw + Eelec을 이용하여 검색 대상 단백질의 상호작용면체와 데이터베이스로부터 선택된 물질 간의 도킹시 에너지를 계산하는 것을 특징으로 하는 검색 장치
6 6
검색 대상 단백질의 아미노산 서열을 입력하는 단계; 상기 단백질의 3차원 구조를 생성하는 단계; 상기 생성된 3차원 구조로부터 표면 구조를 추출하는 단계; 상기 표면 구조와 데이터베이스에 저장된 각 상호작용면체를 매칭하는 단계; 지정된 값 이상으로 매칭하는 상호작용면체를 상기 단백질의 상호작용면체를 추출하는 단계; 데이터베이스로부터 검색 대상 단백질의 상호작용면체에 대응되는 상호작용면체를 가진 물질을 추출하는 단계; 및 검색 대상 단백질의 상호작용면체와 데이터베이스로부터 선택한 물질을 도킹하고 도킹시의 에너지를 계산하여 지정된 에너지 이하로 도킹하는 물질을 선택하는 단계를 포함한 상호작용면체를 기반으로 한 단백질과 상호작용하는 물질의 검색 방법
7 7
제 6항에 있어서, 검색 대상 단백질의 상호작용면체와 데이터베이스로부터 선택한 물질을 도킹하고 도킹시의 에너지를 계산하여 지정된 에너지 이하로 도킹하는 물질을 선택하는 단계에 앞서 데이터베이스로부터 도킹하고자 하는 일련의 화합물을 선별하는 단계를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 검색 방법
8 8
검색 대상 단백질의 아미노산 서열이 입력됨에 따라 데이터베이스를 참조하여 3차원 구조를 생성하는 기능; 상기 생성된 3차원 구조로부터 표면 구조를 추출하는 기능; 상기 표면 구조와 데이터베이스에 저장된 각 상호작용면체를 매칭하는 기능; 지정된 값 이상으로 매칭하는 상호작용면체를 상기 단백질의 상호작용면체를 추출하는 기능; 데이터베이스로부터 검색 대상 단백질의 상호작용면체에 대응되는 상호작용면체를 가진 물질을 추출하는 기능; 및 검색 대상 단백질의 상호작용면체와 데이터베이스로부터 선택된 물질을 도킹하고 도킹시의 에너지를 계산하여 지정된 에너지 이하로 도킹하는 물질을 선택하는 기능을 순차적으로 실행하기 위한 프로그램이 기록된 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
9 9
제 8항에 있어서, 검색 대상 단백질의 상호작용면체와 데이터베이스로부터 선택된 물질을 도킹하고 도킹시의 에너지를 계산하여 지정된 에너지 이하로 도킹하는 물질을 선택하는 기능에 앞서 데이터베이스로부터 도킹하고자 하는 일련의 화합물을 선별하는 기능을 추가로 실행하는 것을 특징으로 하는 기록매체
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.