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미배양 미생물의 단일세포 유래 게놈을 디지털 다중 분리증폭법을 이용하여 증폭하여 게놈 마이크로어레이를제작하는 방법

  • 기술번호 : KST2015170684
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 미배양 미생물의 단일세포의 게놈을 디지털 다중 분리 증폭법(MDA: multiple displacement amplification)을 통해 증폭하여 게놈 마이크로어레이를 제작하는 방법에 관한 것으로서, 보다 구체적으로 본 발명은 희석된 미배양 미생물의 단일세포를 이용하여 디지털 MDA 방식으로 각 세포의 게놈을 증폭하여 별도의 클로닝 단계를 거치지 않고 직접적으로 프린팅하여 마이크로어레이를 제작하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 방법은 기존의 GPM(Genome-Probing Microarray)의 가장 큰 약점인 미배양 미생물의 게놈을 프린팅할 수 없었던 단점을 극복하여 미배양 미생물을 정확하고 보다 간편하게 분류 및 검출하는게 유용하게 이용할 수 있다. 디지털 MDA(multiple displacement amplification), GPM(genome-probing microarray), 미배양 미생물(uncultivated microorgani는), 단일세포.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01)
CPC C12Q 1/6837(2013.01) C12Q 1/6837(2013.01) C12Q 1/6837(2013.01) C12Q 1/6837(2013.01) C12Q 1/6837(2013.01)
출원번호/일자 1020070011627 (2007.02.05)
출원인 한국생명공학연구원
등록번호/일자 10-0759390-0000 (2007.09.11)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20070919) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2007.02.05)
심사청구항수 7

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 배진우 대한민국 대전 유성구
2 장호원 대한민국 대구 동구
3 성열붕 대한민국 대전 유성구
4 김경호 대한민국 대전 유성구
5 남영도 대한민국 대전 유성구
6 이정숙 대한민국 대전 유성구
7 노성운 대한민국 서울 금천구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2007.02.05 수리 (Accepted) 1-1-2007-0106820-19
2 우선심사신청서
Request for Accelerated Examination		 2007.03.06 수리 (Accepted) 1-1-2007-0184955-81
3 서지사항보정서
Amendment to Bibliographic items		 2007.03.08 수리 (Accepted) 1-1-2007-0190388-99
4 서지사항보정서
Amendment to Bibliographic items		 2007.03.20 수리 (Accepted) 1-1-2007-0220350-14
5 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2007.03.22 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
6 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2007.04.12 수리 (Accepted) 9-1-2007-0022522-24
7 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2007.05.10 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0255599-19
8 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2007.07.10 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2007-0501652-55
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2007.07.10 수리 (Accepted) 1-1-2007-0501653-01
10 등록결정서
Decision to grant		 2007.09.10 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0489530-57
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2008.04.10 수리 (Accepted) 4-1-2008-5054980-73
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.05 수리 (Accepted) 4-1-2015-0007152-08
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번호 청구항
1 1
1) 미배양 미생물을 환경에서 채취 및 희석하여 단일세포로 분주하는 단계;2) 단계 1)의 미배양 미생물의 단일세포의 세포벽 및 세포막을 변성화시키는 단계;3) 단계 2)의 변성화된 미배양 미생물의 게놈(genome)을 다중 분리 증폭법(MDA: multiple displacement amplification) 방식으로 증폭하는 단계;4) PCR 시퀀싱(sequencing), DNA 지문(fingerprint) 분석, DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis) 또는 tRFLP(terminal restriction fragment length polymorphism) 방법 중 어느 한 가지 방법을 통해 염기서열 분석 결과가 단일 크로마토그램으로 나오는지 여부를 판정함으로써 단계 3)의 MDA 증폭 산물이 단일세포로부터 유래된 것인지 여부를 확인하는 단계; 및5) 단계 4)에서 단일세포에서 유래한 것으로 확인된 MDA 증폭 산물을 지지체에 점적하는 단계를 포함하는 미배양 미생물 검출용 마이크로어레이 제조방법
2 2
제 1항에 있어서, 단계 1)의 미배양 미생물은 수계, 해양, 토양, 공기, 식품, 폐수, 인체를 포함한 동식물 장내 및 인체를 포함한 동식물 조직 중 어느 하나 이상에서 채취되는 것을 특징으로 하는 제조방법
3 3
제 1항에 있어서, 단계 5)의 MDA 증폭 산물은 형광 색소와 결합된 것을 특징으로 하는 제조방법
4 4
제 3항에 있어서, 상기 형광 색소는 Cy3 또는 Cy5를 사용하는 것을 특징으로 하는 제조방법
5 5
6 6
1) 다중 분리 증폭(MDA) 방식으로 증폭된 표적 생물의 게놈 DNA를 표지화 물질로 표지하는 단계; 2) 제 5항의 마이크로어레이과 단계 1)의 표지화된 표적시료를 혼성화하고 세척하는 단계; 및 3) 단계 2)의 혼성화된 마이크로어레이로부터 표지화 물질의 존재를 검출하는 단계를 포함하는 미배양 미생물 검출 방법
7 7
제 1항에 있어서, 단계 2)의 세포벽 변성화는 라이소자임(lysozyme)에 의하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 미배양 미생물 검출용 마이크로어레이 제조방법
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1 WO2008096923 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

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1 WO2008096923 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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