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기능정보 융합과 ＭＡＳ활용을 위한 통합 유전마커시스템 ＳＳＲ－ＦＭＭ 과 이를 이용한 육종 방법

  • 기술번호 : KST2015170719
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 EST 클러스터링(EST clustering)과 콘티그 어셈블리(contig assembly)를 통해 생성된 컨센서스 서열(consensus sequence)과 mRNA 서열 전체 또는 RNA 전사체 서열 일부분에 존재하는 핵산 서열 패턴 SSR (Simple Sequence Repeat)과 단백질 서열로 번역하였을 때 도메인 서열 패턴 FM (Funtional Motif)이 존재하는 컨센서스 서열(consensus sequence) 또는 전사체 일부 또는 전체 마커를 포함하는 통합 유전마커 시스템 SSR-FMM에 관한 것이다. 본 발명에 따른 SSR-FMM 유전마커 시스템은 형질 기능 동정과정에 필요한 정보 (-omics 정보)와 유전마커를 통합 분석하여 형질 선발과 기능 분석을 동시에 효과적으로 수행할 수 있는 분자 유전마커 시스템으로 제공될 수 있다. MAS(Marker Assisted Selection), EST, 컨센서스, 전사체, SSR-FMM, 분자 유전마커
Int. CL C12Q 1/68 (2011.01) G06F 19/20 (2011.01)
CPC G16B 25/00(2013.01) G16B 25/00(2013.01)
출원번호/일자 1020070089632 (2007.09.04)
출원인 한국생명공학연구원
등록번호/일자 10-0797022-0000 (2008.01.16)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20080122) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020060116733   |   2006.11.24
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2007.09.04)
심사청구항수 8

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 허철구 대한민국 대전 유성구
2 백효정 대한민국 대전 유성구
3 권석윤 대한민국 대전 유성구
4 문제선 대한민국 대전 유성구
5 최도일 대한민국 서울 강남구
6 김병동 대한민국 서울 서초구
7 한정헌 대한민국 경기 안양시 동안구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 최규환 대한민국 대전광역시 서구 한밭대로 ***, **층 그린국제특허법률사무소 (둔산동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2007.09.04 수리 (Accepted) 1-1-2007-0643901-15
2 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2007.09.06 수리 (Accepted) 1-1-2007-0649477-97
3 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2007.11.12 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2007-0604530-78
4 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2007.12.27 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2007-0936943-16
5 [지정기간단축]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Reduction of Designated Period] Request for Extension of Period (Reduction, Expiry Reconsideration)		 2007.12.27 수리 (Accepted) 1-1-2007-0936719-06
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2007.12.27 수리 (Accepted) 1-1-2007-0936928-31
7 등록결정서
Decision to grant		 2008.01.16 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0019813-62
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2008.04.10 수리 (Accepted) 4-1-2008-5054980-73
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.05 수리 (Accepted) 4-1-2015-0007152-08
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
SSR (Simple Sequence Repeat)과, 단백질 도메인 서열 자체, 서열기능이 알려진 단백질과의 비교를 통한 상동성 단백질, 또는 단백질의 기능적 활성을 위한 특정 패턴을 포함하는 FM (Funtional Motif)이 존재하는 컨센서스 마커를 포함하며, SSR-FMM 서열에 대한 인 실리코 유전자 해석 (in silico gene annotation) 정보를 통합한 것을 활용한 생물정보학 데이터 베이스가 통합된 것을 특징으로 하는 통합 유전마커 시스템 SSR-FMM(Simple Sequence Repeat-Functional Motif Marker)
2 2
제1항에 있어서, SSR (Simple Sequence Repeat)과 FM (Funtional Motif)은 EST 클러스터링(EST clustering)과 콘티그 어셈블리(contig assembly)를 통해 생성된 컨센서스 서열(consensus sequence)과 mRNA 서열 전체 또는 RNA 전사체 서열 일부분에 존재하는 것을 특징으로 하는 통합 유전마커 시스템 SSR-FMM(Simple Sequence Repeat-Functional Motif Marker)
3 3
제1항에 있어서, 통합 유전마커 시스템 SSR-FMM은 맵핑 집단 (mapping population) 내의 다형성의 SSR-FMM의 서열 특성을 이용하여 유전 스크리닝 (genetic screening)을 수행함으로써 최종 형질에 대한 기능 동정이 가능하게 하는 것을 특징으로 하는 통합 유전마커 시스템 SSR-FMM(Simple Sequence Repeat-Functional Motif Marker)
4 4
제1항에 있어서, 상기 통합 유전마커 시스템 SSR-FMM은 EST 또는 전사체 기반의 어류, 동물, 또는 식물을 대상으로 하는 것을 특징으로 하는 SSR-FMM
5 5
삭제
6 6
삭제
7 7
제1항에 있어서, 생물정보학 데이터 베이스는 SSR-FMM 서열에 대한 Uniprot, GO, MIPS, KEGG, STRING, 조직 특이적 정보 또는 어레이 발현 프로필인 것을 특징으로 하는 통합 유전 마커 시스템 SSR-FMM
8 8
삭제
9 9
제 1항에 있어서, SSR-FMM 서열은 cDNA 라이브러리 또는 게놈 DNA 라이브러리 스크리닝과 시퀀싱 수행을 통한 유전 마커 개발에 이용되는 것을 특징으로 하는 통합 유전 마커 시스템 SSR-FMM
10 10
(a) SSR과 FM이 존재하는 컨센서스, 전사체 또는 코딩 영역 마커를 선발하여 통합 유전 마커 시스템을 구축하는 단계;(b) 멤버 EST(member EST) 또는 컨센서스 서열 또는 코딩 영역 서열과 SSR-FMM에 대응되는 게놈 서열을 기준으로 게놈 DNA의 유전 스크리닝 (genetic screening)을 수행하는 단계로서, 상기 게놈 DNA의 유전 스크리닝의 수행 방법은 SSR-FMM 서열 중 SSR 패턴의 PCR을 통한 길이 다형성 (length polymorphism)의 확인, SSR-FMM 서열을 프로브로 혼성화 방법을 이용한 RFLP 타입의 다형성 확인, 효소 절단을 통한 CAPS (Cleaved amplified polymorphic sequence) 마커로의 활용, AFLP (Amplified fragment length polymorphism) 또는 SCAR (Sequence characterized amplified region) 마커 타입의 활용, SSR-FMM 의 서열적 특성과, SSR-FMM 과 대응되는 게놈 DNA의 인트론 영역 특성을 이용한 다형성 확인으로 이루어진 군으로부터 선택된 방법을 통해 수행하며;(c) 상기 (b) 단계에서 다형성 (polymorphism)이 확인된 SSR-FMM 서열을 이용하여 MAS를 수행하는 단계; 및(d) 기능 정보와 통합된 SSR-FMM을 검색하는 단계를 포함하는 기능 유전체학과 MAS (marker assisted selection) 기반의 분자 육종 방법
11 11
삭제
12 12
제10항에 있어서, 기존 DNA 마커 서열, 또는 유전체 (genome) 서열과 SSR-FMM 과의 상동성 비교를 통해, SSR-FMM 서열의 일치를 검색하고; 전 단계의 일치성 검증을 통해 SSR-FMM 마커 시스템의 분석 정보를 형질 (trait) 기능 검증에 이용하는 것을 특징으로 하는 기능 유전체학과 MAS (marker assisted selection) 기반의 분자 육종 방법
13 13
삭제
지정국 정보가 없습니다
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 WO2009031740 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
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