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펩티드 질량 지문 추적법을 사용한 알터네이티브스플라이싱 아이소폼을 동정하기 위한 스코어링 알고리즘을포함한 시스템 및 방법과 상기 방법을 수행하기 위한프로그램을 갖는 기록매체

  • 기술번호 : KST2015170791
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 펩티드 질량 지문 추적법을 사용하여 알터네이티브 스플라이싱 아이소폼(alternative splicing isoform)을 동정하기 위한 스코어링 알고리즘을 포함한 시스템 및 방법과 상기 방법을 수행하기 위한 컴퓨터로 판독 가능한 프로그램을 기록한 기록매체에 관한 것이다.본 발명은 어떤 유전자의 알터네이티브 스플라이싱 아이소폼을 효과적으로 구별하는 알고리즘과 조직 특이적인 유전자의 정보를 포함한 데이터베이스를 사용함으로써, 알터네이티브 스플라이싱 아이소폼을 효과적으로 식별 및 동정하고 조직 특이적 아이소폼을 확인할 수 있다. 알터네이티브 스플라이싱 아이소폼(alternative splicing isoform), Mass Spectrometry (MS), 단백질 동정, 질량분석, 펩티드 질량 지문 추적법(peptide mass fingerprinting; PMF)
Int. CL G06F 17/30 (2011.01) G06F 19/28 (2011.01) G06F 19/00 (2011.01) G01N 33/48 (2011.01)
CPC G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01)
출원번호/일자 1020080023411 (2008.03.13)
출원인 한국생명공학연구원
등록번호/일자 10-0856526-0000 (2008.08.28)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20080904) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2008.03.13)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 허철구 대한민국 대전 유성구
2 이승원 대한민국 대전 유성구
3 최재필 대한민국 대전 중구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 최규환 대한민국 대전광역시 서구 한밭대로 ***, **층 그린국제특허법률사무소 (둔산동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국생명공학연구원 대한민국 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2008.03.13 수리 (Accepted) 1-1-2008-0183951-65
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2008.04.10 수리 (Accepted) 4-1-2008-5054980-73
3 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2008.04.28 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2008-0301374-66
4 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2008.06.19 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
5 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2008.07.15 수리 (Accepted) 9-1-2008-0044075-66
6 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2008.08.07 수리 (Accepted) 1-1-2008-0566899-16
7 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2008.08.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0436833-90
8 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2008.08.25 수리 (Accepted) 1-1-2008-0603329-16
9 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2008.08.25 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2008-0603360-22
10 등록결정서
Decision to grant		 2008.08.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2008-0447135-97
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.05 수리 (Accepted) 4-1-2015-0007152-08
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
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단백질의 가수분해로 얻어진 펩티드 조각들의 측정된 질량 데이터를 입력하는 입력부;단백질 서열의 질량, 등전위값, 단백질 변형에 관여할 가능성이 있는 아미노산 위치에 대한 정보와 단백질 서열에 효소처리 후 생산되는 펩티드 서열 정보를 포함하는 데이터베이스; 데이터베이스를 검색하는 검색부; 데이터베이스에 일치된 질량들을 포함한 알터네이티브 스플라이싱 아이소폼 (alternative splicing isoform)에 대해 검색된 후보들의 가능성을 점수화하는 알고리즘; 및점수에 따라 후보 아이소폼을 정렬하는 출력부를 포함하는 펩티드 질량 지문 추적법을 이용한 알터네이티브 스플라이싱 아이소폼을 동정하기 위한 시스템
2 2
삭제
3 3
제1항에 있어서, 상기 알고리즘은 실험을 통하여 측정된 질량 데이터를 데이터베이스에 검색 후 결과를 각 아이소폼별로 매치된 질량에 대해 하기 식 1, 식 2 및 식 3에 의해 계산하여 후보의 우선순위를 결정하는 알고리즘인 것을 특징으로 하는 시스템:(상기 식에서,측정된 질량값들은 m = { m1, m2,
4 4
알터네이티브 스플라이싱 아이소폼을 검색하기 위한 데이터베이스를 구축하는 단계;단백질의 가수분해로 얻어진 펩티드 조각들의 측정된 질량 데이터를 상기 데이터베이스에서 검색하는 단계; 데이터베이스에 일치된 질량들을 포함한 알터네이티브 스플라이싱 아이소폼 (alternative splicing isoform)에 대해 검색된 후보들의 가능성을 점수화하는 알고리즘을 사용하여 점수화하는 단계; 및점수에 따라 후보 아이소폼을 정리하여 아이소폼을 동정하는 단계를 포함하는 펩티드 질량 지문 추적법을 이용한 알터네이티브 스플라이싱 아이소폼을 동정하는 방법
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제4항에 있어서, 상기 알고리즘은 실험을 통하여 측정된 질량 데이터를 데이터베이스에 검색 후 결과를 각 아이소폼별로 매치된 질량에 대해 하기 식 1, 식 2 및 식 3에 의해 계산하여 후보의 우선순위를 결정하는 알고리즘인 것을 특징으로 하는 방법:(식 1, 2 및 3에서 사용된 기호들은 제3항에 정의된 바와 같다)
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제5항에 있어서, 상기 알고리즘의 구현 방법은 입력부로부터 입력받은 질량 데이터와 질량오차로부터 측정된 질량에 질량오차 범위로 데이터베이스에 검색하고, 그 결과를 아이소폼별로 정리한 후 알고리즘을 사용하여 점수화하고, 오름차순으로 정리하여 후보의 우선순위를 결정하는 방법
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제4항 내지 제6항 중 어느 한 항의 방법을 수행하기 위한 컴퓨터로 판독 가능한 프로그램을 기록한 기록매체
지정국 정보가 없습니다
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 WO2009113752 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

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1 WO2009113752 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.