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다음의 단계를 포함하는 수용체 타이로신 키나아제(receptor tyrosine kinase: RTK) 타겟에 특이적으로 결합하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더(RTK-BPB)의 제조방법:(a) (i) 가닥간(interstrand) 비공유결합이 형성되는 패러럴(parallel), 안티패러럴(antiparallel) 또는 패러럴(parallel)과 안티패러럴(antiparallel) 아미노산 가닥들을 포함하는 구조 안정화 부위(structure stabilizing region); (ii) 상기 구조 안정화 부위의 양 말단에 결합되어 있고 무작위적으로 선택적 각각 n 및 m 개의 아미노산을 포함하는 RTK-타겟 결합 부위 I(RTK-target binding region I) 및 RTK-타겟 결합 부위 II(RTK-target binding region II)를 포함하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더(RTK-BPB)의 라이브러리를 제공하는 단계;(b) 상기 라이브러리와 타겟으로서의 RTK 을 접촉시키는 단계; 그리고,(c) 상기 RTK 과 결합된 RTK-바이포달 펩타이드 바인더(RTK-BPB)를 선택하는 단계
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제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위에 형성되는 가닥간 비공유결합은 수소결합, 정전기적 상호작용, 소수성상호작용, 반데르 발스 상호작용, 파이-파이 상호작용, 양이온-파이 상호작용 또는 이들의 조합인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위의 아미노산 가닥들은 링커로 연결된 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위는 β-헤어핀, 링커로 연결된 β-쉬트, 루이신 지퍼, 링커로 연결된 루이신 지퍼, 루이신 리치 모티프 또는 링커로 연결된 루이신 리치 모티프인 것을 특징으로 하는 방법
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제 4 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위는 β-헤어핀인 것을 특징으로 하는 방법
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 서열목록 제 1 서열 내지 제 19 서열로 구성된 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
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제 6 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 서열목록 제 2 서열, 제 14 서열 또는 제 18 서열로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 I 로 표시되는 것을 특징으로 하는 방법:일반식 IX1 은 Ser 또는 Gly-Glu 이고, X2 및 X'2 는 서로 독립적으로 Thr, His, Val, Ile, Phe 또는 Tyr 이며, X3 는 Trp 또는 Tyr 이고, X4 는 타입 I, 타입 I', 타입 II, 타입 II' 또는 타입 III 또는 타입 III' 턴 서열이고, X5 는 Trp 또는 Phe 이며, X6 는 Trp 또는 Val 이고, X7 는 Lys 또는 Thr-Glu 이다
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 II로 표시되는 것을 특징으로 하는 방법:일반식 IIX1 은 Arg, Gly-Glu 또는 Lys-Lys 이고, X2 는 Gln 또는 Thr 이며, X3 는 타입 I, 타입 I', 타입 II, 타입 II' 또는 타입 III 또는 타입 III' 턴 서열이고, X4 는 Gln, Thr-Glu 또는 Gln-Glu 이다
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 III으로 표시되는 것을 특징으로 하는 방법:일반식 IIIX1 은 Lys 또는 Lys-Lys 이고, X2 는 Trp 또는 Tyr 이고, X3 는 Val 또는 Thr 이며, X4 는 타입 I, 타입 I', 타입 II, 타입 II' 또는 타입 III 또는 타입 III' 턴 서열이고, X5 는 Trp 또는 Ala 이며, X6 는 Trp 또는 Val 이고, X7 은 Glu 또는 Gln-Glu 이다
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 IV로 표시되는 것을 특징으로 하는 방법:일반식 IVX1 은 Lys-Thr 또는 Gly 이고, X2 는 Trp 또는 Tyr 이고, X3 는 타입 I, 타입 I', 타입 II, 타입 II' 또는 타입 III 또는 타입 III' 턴 서열이고, X4 는 Thr-Glu 또는 Gly 이다
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제 8 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 상기 일반식 I 에서 X1 은 Ser 또는 Gly-Glu 이고, X2 및 X'2 는 서로 독립적으로 Thr, His 또는 Val 이며, X3 는 Trp 또는 Tyr 이고, X4 는 타입 I, 타입 I', 타입 II 또는 타입 II' 서열이고, X5 는 Trp 또는 Phe 이며, X6 는 Trp 또는 Val 이고, X7 는 Lys 또는 Thr-Glu 이다
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제 1 항에 있어서, 상기 RTK-타겟 결합 부위 I 의 아미노산 개수 n 은 2-20 인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 RTK-타겟 결합 부위 II의 아미노산 개수 m 은 2-20 인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 라이브러리는 플라스미드, 박테리오파아지, 파아지미드로, 이스트 또는 박테리아로부터 제작된 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 RTK-타겟 결합 부위 I 및 RTK-타겟 결합 부위 II는 RTK 에 공동으로 작용하여 결합하는 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위, RTK-타겟 결합 부위 I 또는 RTK-타겟 결합 부위 II에 추가적으로 기능성 분자가 결합되어 있는 것을 특징으로 하는 방법
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제 17 항에 있어서, 상기 기능성 분자는 검출가능한 신호를 발생시키는 레이블, 화학약물, 바이오약물, 세포막투과 펩타이드(CPP) 또는 나노입자인 것을 특징으로 하는 방법
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(a) 가닥간(interstrand) 비공유결합이 형성된 패러럴(parallel), 안티패러럴(antiparallel) 또는 패러럴(parallel)과 안티패러럴(antiparallel) 아미노산 가닥들을 포함하는 구조 안정화 부위(structure stabilizing region); 및(b) 상기 구조 안정화 부위의 양 말단에 결합되어 있고 무작위적으로 선택된 각각 n 및 m 개의 아미노산을 포함하는 RTK-타겟 결합 부위 I(RTK-target binding region I) 및 RTK-타겟 결합 부위 II(RTK-target binding region II)를 포함하는 RTK 에 특이적으로 결합하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 19 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위에 형성된 가닥간 비공유결합은 수소결합, 정전기적 상호작용, 소수성상호작용, 반데르 발스 상호작용, 파이-파이 상호작용, 양이온-파이 상호작용 또는 이들의 조합인 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 19 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위의 아미노산 가닥들은 링커로 연결된 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 19 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위는 β-헤어핀, 링커로 연결된 β-쉬트, 루이신 지퍼 또는 링커로 연결된 루이신 지퍼, 루이신 리치 모티프인 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 19 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위는 β-헤어핀인 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 23 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 서열목록 제 1 서열 내지 제 19 서열로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 24 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 서열목록 제 2 서열, 제 14 서열 또는 제 18 서열로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 23 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 I 로 표시되는 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더:일반식 IX1 은 Ser 또는 Gly-Glu 이고, X2 및 X'2 는 서로 독립적으로 Thr, His, Val, Ile, Phe 또는 Tyr 이며, X3 는 Trp 또는 Tyr 이고, X4 는 타입 I, 타입 I', 타입 II, 타입 II' 또는 타입 III 또는 타입 III' 턴 서열이고, X5 는 Trp 또는 Phe 이며, X6 는 Trp 또는 Val 이고, X7 는 Lys 또는 Thr-Glu 이다
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제 23 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 II로 표시되는 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더:일반식 IIX1 은 Arg, Gly-Glu 또는 Lys-Lys 이고, X2 는 Gln 또는 Thr 이며, X3 는 타입 I, 타입 I', 타입 II, 타입 II' 또는 타입 III 또는 타입 III' 턴 서열이고, X4 는 Gln, Thr-Glu 또는 Gln-Glu 이다
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제 23 항에 있어서
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제 23 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 IV로 표시되는 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더:일반식 IVX1 은 Lys-Thr 또는 Gly 이고, X2 는 Trp 또는 Tyr 이고, X3 는 타입 I, 타입 I', 타입 II, 타입 II' 또는 타입 III 또는 타입 III' 턴 서열이고, X4 는 Thr-Glu 또는 Gly 이다
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제 24 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 상기 일반식 I 에서 X1 은 Ser 또는 Gly-Glu 이고, X2 및 X'2 는 서로 독립적으로 Thr, His 또는 Val 이며, X3 는 Trp 또는 Tyr 이고, X4 는 타입 I, 타입 I', 타입 II 또는 타입 II' 서열이고, X5 는 Trp 또는 Phe 이며, X6 는 Trp 또는 Val 이고, X7 는 Lys 또는 Thr-Glu 인 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 19 항에 있어서, 상기 RTK-타겟 결합 부위 I 의 아미노산 개수 n 은 2-20 인 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 19 항에 있어서, 상기 RTK-타겟 결합 부위 II의 아미노산 개수 m 은 2-20 인 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 19 항에 있어서, 상기 RTK-타겟 결합 부위 I 및 RTK-타겟 결합 부위 II는 RTK 에 공동으로 작용하여 결합하는 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 19 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위, RTK-타겟 결합 부위 I 또는 RTK-타겟 결합 부위 II에 추가적으로 기능성 분자가 결합되어 있는 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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제 34 항에 있어서, 상기 기능성 분자는 검출가능한 신호를 발생시키는 레이블, 화학약물, 바이오약물, 세포막투과 펩타이드(CPP) 또는 나노입자인 것을 특징으로 하는 RTK-바이포달 펩타이드 바인더
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상기 제 19 항 내지 제 35 항 중 어느 한 항의 바이포달 펩타이드 바인더를 코딩하는 핵산 분자
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상기 제 36 항의 핵산 분자를 포함하는 바이포달 펩타이드 바인더의 발현용 벡터
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