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서열목록 제1서열의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 양파 웅성-가임(Male-fertility) 선별용 핵산분자
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서열목록 제2서열의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 양파 웅성-가임(Male-fertility) 선별용 핵산분자
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서열목록 제3서열의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 양파 웅성-가임(Male-fertility) 선별용 핵산분자
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서열목록 제4서열의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 양파 웅성-가임(Male-fertility) 선별용 핵산분자
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서열목록 제5서열의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 양파 웅성-가임(Male-fertility) 선별용 핵산분자
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다음의 단계를 포함하는 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임 판별방법:(a) 양파의 gDNA(genomic DNA)을 수득하는 단계; 및(b) 상기 gDNA 중 서열목록 제1서열 내지 서역목록 제5서열 중 어느 하나의 뉴클레오타이드 서열을 분석하는 단계;상기 서열목록 제1서열의 뉴클레오타이드 서열을 분석하는 경우, 서열목록 제6서열 및 제7서열의 프라이머 세트를 이용하여 PCR을 실시하고, PCR 산물에 DraⅠ을 처리하여 분해된 패턴을 분석하여 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임을 판별한다, (1-ⅰ) 상기 PCR 산물의 절단 후 크기가 888 bp(base pair)인 제1분해물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단하고, (1-ⅱ) 상기 PCR 산물의 절단 후 크기가 519 bp인 제2분해물 및 크기가 378 bp인 제3분해물이 존재하는 경우에는 웅성-불임으로 판단하며, (1-ⅲ) 상기 PCR 산물의 절단 후 상기 제1분해물, 상기 제2분해물 및 상기 제3분해물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단한다;상기 서열목록 제2서열의 뉴클레오타이드 서열을 분석하는 경우, 서열목록 제8서열 및 서열목록 제9서열의 프라이머 세트를 이용하여 PCR을 실시하고, PCR 산물에 TaqⅠ을 처리하여 분해된 패턴을 분석하여 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임을 판별한다, (2-ⅰ) 상기 PCR 산물의 절단 후 크기가 425 bp인 제4분해물 및 크기가 150 bp인 제5분해물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단하고, (2-ⅱ) 상기 PCR 산물의 절단 후 상기 제4분해물 및 크기가 341 bp인 제6분해물이 존재하는 경우에는 웅성-불임으로 판단하며, (2-ⅲ) 상기 PCR 산물의 절단 후 상기 제4분해물, 상기 제5분해물 및 상기 제6분해물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단한다;상기 서열목록 제3서열의 뉴클레오타이드 서열을 분석하는 경우, 서열목록 제10서열 및 서열목록 제11서열의 프라이머 세트를 이용하여 PCR을 실시하고, PCR 산물에 PvuⅡ을 처리하여 분해된 패턴을 분석하여 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임을 판별한다: (3-ⅰ) 상기 PCR 산물의 절단 후 크기가 251 bp인 제7분해물 및 크기가 117 bp인 제8분해물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단하고, (3-ⅱ) 상기 PCR 산물의 절단 후 크기가 368 bp인 제9분해물이 존재하는 경우에는 웅성-불임으로 판단하며, (3-ⅲ) 상기 PCR 산물의 절단 후 상기 제7분해물, 상기 제8분해물 및 상기 제9분해물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단한다;상기 서열목록 제4서열의 뉴클레오타이드 서열을 분석하는 경우, 서열목록 제12서열 및 서열목록 제13서열의 프라이머 세트를 이용하여 PCR을 실시하고, PCR 산물에 XhoⅠ을 처리하여 분해된 패턴을 분석하여 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임을 판별한다, (4-ⅰ) 상기 PCR 산물의 절단 후 크기가 575 bp인 제10분해물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단하고, (4-ⅱ) 상기 PCR 산물의 절단 후 크기가 427 bp인 제11분해물 및 크기가 148 bp인 제12분해물이 존재하는 경우에는 웅성-불임으로 판단하며, (4-ⅲ) 상기 PCR 산물의 절단 후 상기 제10분해물, 상기 제11분해물 및 상기 제12분해물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단한다;상기 서열목록 제5서열의 뉴클레오타이드 서열을 분석하는 경우, 서열목록 제14서열 및 서열목록 제15서열의 프라이머 세트를 이용하여 PCR을 실시하고, PCR 산물을 전기영동을 통해 밴드 패턴을 분석하여 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임을 판별한다, (5-ⅰ) 상기 PCR 산물의 절단 후 크기가 915 bp인 제13산물이 존재하는 경우에는 웅성-가임으로 판단하고, (5-ⅱ) 상기 제13산물이 존재하지 않는 경우에는 웅성-불임으로 판단한다
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제 6 항에 있어서, 상기 단계 (b)의 분석은 CAPS(Cleaved Amplified Polymorphic Sequence), PCR(Polymerase Chain Reaction), RAPD(Randomly Amplified Polymorphic DNA), AFLP(Amplified fragment length polymorphism), RFLP(Restriction Fragment Lennth Polymorphism), DAF(DNA Amplification Fingerprinting), AP-PCR(Arbitrarily primed PCR), PCR-SSCP(Single-strand Conformation Polymorphism), RT-PCR(Reverse transcriptase PCR), ISSR(Inter-simple Sequence Repeat Amplication), STS(Sequence Tagged Site), EST(Expressed sequence tag), SCAR(Sequence Characterized Amplified Regions), DNA 시퀀싱, 마이크로어레이(Microarray)에 의한 혼성화, 노던 블럿(Northern Blot) 또는 서던 블럿(Southern blot)인 것을 특징으로 하는 방법
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제 7 항에 있어서, 상기 단계 (b)의 분석은 CAPS 또는 PCR인 것을 특징으로 하는 방법
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(a) 서열목록 제1서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제1서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 정방향 프라이머; (b) 서열목록 제1서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제1서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 역방향 프라이머; 및 (c) 제한효소 DraⅠ을 포함하는 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임 판별용 키트
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제 11 항에 있어서, 상기 정??향 프라이머는 서열목록 제6서열이고, 상기 역방향 프라이머는 서열목록 제7서열인 것을 특징으로 하는 키트
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13
(a) 서열목록 제2서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제2서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 정방향 프라이머; (b) 서열목록 제2서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제2서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 역방향 프라이머; 및 (c) 제한효소 TaqⅠ을 포함하는 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임 판별용 키트
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제 13 항에 있어서, 상기 정??향 프라이머는 서열목록 제8서열이고, 상기 역방향 프라이머는 서열목록 제9서열인 것을 특징으로 하는 키트
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15
(a) 서열목록 제3서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제3서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 정방향 프라이머; (b) 서열목록 제3서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제3서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 역방향 프라이머; 및 (c) 제한효소 PvuⅡ을 포함하는 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임 판별용 키트
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제 15 항에 있어서, 상기 정??향 프라이머는 서열목록 제10서열이고, 상기 역방향 프라이머는 서열목록 제11서열인 것을 특징으로 하는 키트
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17
(a) 서열목록 제4서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제4서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 정방향 프라이머; (b) 서열목록 제4서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제4서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 역방향 프라이머; 및 (c) 제한효소 XhoⅠ을 포함하는 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임 판별용 키트
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제 17 항에 있어서, 상기 정??향 프라이머는 서열목록 제12서열이고, 상기 역방향 프라이머는 서열목록 제13서열인 것을 특징으로 하는 키트
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19
(a) 서열목록 제5서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제5서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 정방향 프라이머; 및 (b) 서열목록 제5서열의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열목록 제5서열의 상보적인 서열에 혼성화되는 역방향 프라이머를 포함하는 양파의 웅성-불임 또는 웅성-가임 판별용 키트
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제 19 항에 있어서, 상기 정??향 프라이머는 서열목록 제14서열이고, 상기 역방향 프라이머는 서열목록 제15서열인 것을 특징으로 하는 키트
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