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생물학적 샘플을 비행시간이차이온질량분광법(TOF-SIMS; Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry)으로 분석하여 얻어지는 이차이온질량(m/z)과 이차이온질량(m/z)에서의 강도로 구성된 분광패턴을 이용한 지표의 추출 방법으로,
특정 질병을 보유하지 않은 정상인의 생물학적 샘플의 분광패턴인 정상패턴을 얻고, 특정 질병을 보유한 환자의 생물학적 샘플의 분광패턴인 질병패턴을 얻는 단계;
상기 정상패턴 및 질병패턴 각각을 분위수 정규화법(quantile normalization)으로 표준화(normalization) 하여 표준화된 정상패턴 및 표준화된 질병패턴을 얻는 단계;
상기 표준화된 정상패턴 및 표준화된 질병패턴으로부터 다변량 통계 분석법을 이용하여 특정 질병의 보유 유무를 판별하는 지표를 추출하는 단계;
를 포함하여 수행되는 지표의 추출 방법
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생물학적 샘플을 비행시간이차이온질량분광법(TOF-SIMS; Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry)으로 분석하여 얻어지는 이차이온질량(m/z)과 이차이온질량(m/z)에서의 강도로 구성된 분광패턴을 이용한 지표의 추출 방법으로,
특정 질병을 보유하지 않은 정상인의 생물학적 샘플의 분광패턴인 정상패턴을 얻고, 특정 질병을 보유한 환자의 생물학적 샘플의 분광패턴인 질병패턴을 얻고, 상기 특정 질병과 상이한 질병인 유사질병을 보유한 환자의 생물학적 샘플의 분광패턴인 유사질병패턴을 얻는 단계;
상기 정상패턴, 질병패턴 및 유사질병패턴 각각을 분위수 정규화법(quantile normalization)으로 표준화(normalization) 하여 표준화된 정상패턴, 표준화된 질병패턴 및 표준화된 유사질병패턴을 얻는 단계;
상기 표준화된 정상패턴, 표준화된 질병패턴 및 표준화된 유사질병패턴으로부터 다변량 통계 분석법을 이용하여 상기 특정 질병과 상기 유사질병에 대한 보유 유무를 판별하는 지표를 추출하는 단계;
를 포함하여 수행되는 지표의 추출 방법
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생물학적 샘플을 비행시간이차이온질량분광법(TOF-SIMS; Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry)으로 분석하여 얻어지는 이차이온질량(m/z)과 이차이온질량(m/z)에서의 강도로 구성된 분광패턴을 이용한 지표의 추출 방법으로,
특정 질병을 보유하지 않은 정상인의 생물학적 샘플의 분광패턴인 정상 패턴을 얻고, 대장암을 보유한 환자의 생물학적 샘플의 분광패턴인 대장암패턴을 얻는 단계;
상기 정상패턴 및 대장암패턴 각각을 분위수 정규화법(quantile normalization)으로 표준화(normalization) 하여 표준화된 정상패턴 및 표준화된 대장암패턴을 얻는 단계;
상기 표준화된 정상패턴 및 표준화된 대장암패턴으로부터 다변량 통계 분석법을 이용하여 대장암의 보유 유무를 판별하는 지표를 추출하는 단계;
를 포함하여 수행되는 지표의 추출 방법
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생물학적 샘플을 비행시간이차이온질량분광법(TOF-SIMS; Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry)으로 분석하여 얻어지는 이차이온질량(m/z)과 이차이온질량(m/z)에서의 강도로 구성된 분광패턴을 이용한 지표의 추출 방법으로,
특정 질병을 보유하지 않은 정상인의 생물학적 샘플의 분광패턴인 정상패턴을 얻고, 대장암을 보유한 환자의 생물학적 샘플의 분광패턴인 대장암패턴을 얻고, 대장암 이외의 장 질환을 보유한 환자의 생물학적 샘플의 분광패턴인 장질환패턴을 얻는 단계;
상기 정상패턴, 대장암패턴 및 장질환패턴 각각을 분위수 정규화법(quantile normalization)으로 표준화(normalization) 하여 표준화된 정상패턴, 표준화된 대장암패턴 및 표준화된 장질환패턴을 얻는 단계;
상기 표준화된 정상패턴, 표준화된 대장암패턴 및 표준화된 장질환패턴으로부터 다변량 통계 분석법을 이용하여 대장암과 장질환의 보유 유무를 판별하는 지표를 추출하는 단계;
를 포함하여 수행되는 지표의 추출 방법
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제 4항에 있어서,
상기 장질환패턴은 대장선종을 보유한 환자의 생물학적 샘플의 분광패턴인 대장선종패턴; 염증성 장질환을 보유한 환자의 생물학적 샘플의 분광패턴인 염증질환패턴; 또는 상기 대장선종패턴과 상기 염증질환패턴의 두 분광패턴;인 것을 특징으로 하는 지표의 추출 방법
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제 1항 내지 제 5항에서 선택된 어느 한 항에 있어서,
상기 표준화(normalization)는 이차이온질량(m/z)이 1에서 800인 분석 영역에서 수행되는 것을 특징으로 하는 지표의 추출 방법
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제 6항에 있어서,
상기 표준화는 상기 분석영역의 이차이온질량(m/z)을 구간화하는 단계;
구간화된 이차이온질량의 각 구간 별로 누적 강도를 얻는 단계; 및
지표의 추출에 사용되는 모든 분광패턴이 동일한 누적 강도의 분포를 갖도록 누적 강도의 분포를 정규화하는 단계;
를 포함하여 수행되는 것을 특징으로 하는 지표의 추출 방법
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제 1항 내지 제 4항에서 선택된 어느 한 항에 있어서,
상기 다변량 통계 분석법은 다변량 통계 회귀 분석법인 것을 특징으로 하는 지표의 추출 방법
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9
제 8항에 있어서,
상기 다변량 통계 회귀 분석법은 PCR(Principal Component Regression), PLS(Partial Least Square) 또는 KPLS(Kernel Partial Least Square)인 것을 특징으로 하는 지표의 추출 방법
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10
제 7항에 있어서,
상기 다변량 통계 회귀 분석법은 PLS(Partial Least Square)이며, VIP(Variable Importance in the Projection) 값을 이용하여 지표를 추출하는 것을 특징으로 하는 지표의 추출 방법
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11
제 3항에 있어서,
상기 생물학적 샘플은 분변과 물을 혼합 교반한 후 원심분리에 의해 분리된 액인 분변액이며,
상기 지표는 대장암 보유 유무를 판별하는 지표로, 8
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12
제 5항에 있어서,
상기 생물학적 샘플은 분변과 물을 혼합 교반한 후 원심분리에 의해 분리된 액인 분변액이며,
상기 지표는 대장암, 대장선종 및 염증성 장질환 각각의 보유 유무를 판별하는 지표로, 10
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13
제 1항 내지 제 4항에서 선택된 어느 한 항에 있어서,
상기 생물학적 샘플은 분변; 소변; 눈물; 타액; 피부, 호흡관, 장관, 소화관들의 외부 분비물; 혈장; 혈청; 혈액; 척수액; 림프액; 체액; 조직; 조직 균질물; 조직의 부분; 세포; 세포 추출물; 또는 체외 세포 배양물;인 것을 특징으로 하는 지표의 추출 방법
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질병 보유 가능자의 생물학적 샘플을 비행시간이차이온질량분광법(TOF-SIMS; Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry)으로 분석하여 얻어지는 이차이온질량(m/z)과 이차이온질량(m/z)에서의 강도로 구성된 시험패턴을 입력받는 입력부;
제 1항 내지 제 4항에서 선택된 어느 한 항의 지표의 추출 방법으로 추출된 지표가 저장된 컴퓨터 판독 가능한 저장매체;
상기 입력부를 통해 입력된 시험패턴을 분위수 정규화법(quantile normalization)으로 표준화(normalization)하여 표준화된 시험패턴을 생성하고, 상기 저장매체에 저장된 지표 및 상기 표준화된 시험패턴을 이용하여 질병 보유 가능자의 질병 보유 유무 또는 질병의 종류를 판별하는 처리부; 및
상기 처리부에서 판별된 질병 보유 유무 또는 질병의 종류를 출력하는 출력부;
를 포함하여 구성된 질병 진단장치
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