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PC 클러스터 기반 BLAST 고속 검색을 위한 파티셔닝방법

  • 기술번호 : KST2015185087
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 개선된 시퀀스 데이터 분할 기법과 질의 처리 기법을 이용하여 다수의 PC를 이용하여 저비용으로 대용량 BLAST 데이터베이스 검색의 성능을 향상시키는 클러스터 시스템을 개발하기 위한 PC 클러스터 기반 BLAST 고속 검색을 위한 파티셔닝 방법이 개시된다. 본 발명은 데이터베이스를 각 노드의 메모리 사양과 성능에 맞추어 배치하여 저가의 PC를 활용하여 생명공학 분야에서 가장 널리 사용되는 BLAST 처리용 고성능 클러스터 컴퓨터 구축할 수 있으며, 경영학 분야의 대용량 OLAP 분석 처리용 고성능 클러스터 컴퓨터 구축할 수 있는 효과가 있다.
Int. CL G06F 9/00 (2006.01) G06F 15/00 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01)
CPC G06F 15/161(2013.01) G06F 15/161(2013.01) G06F 15/161(2013.01)
출원번호/일자 1020090026176 (2009.03.27)
출원인 충북대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-0989904-0000 (2010.10.19)
공개번호/일자 10-2010-0107857 (2010.10.06) 문서열기
공고번호/일자 (20101026) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2009.03.27)
심사청구항수 2

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 충북대학교 산학협력단 대한민국 충청북도 청주시 서원구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김태경 대한민국 충청북도 청주시 흥덕구
2 정승현 대한민국 충청북도 청주시 흥덕구
3 오상근 대한민국 충청북도 청주시 흥덕구
4 조완섭 대한민국 충청북도 청주시 흥덕구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 윤의상 대한민국 충청북도 청주시 흥덕구 풍산로 **, 충북중소기업종합지원센타 *층 한울국제특허법률사무소 (가경동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 주식회사 아이웍스 경상남도 창원시 성산구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2009.03.27 수리 (Accepted) 1-1-2009-0184329-99
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2010.07.08 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2010.08.16 수리 (Accepted) 9-1-2010-0051329-81
4 등록결정서
Decision to grant
2010.09.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2010-0438613-57
5 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.08.28 수리 (Accepted) 4-1-2014-5103343-45
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.06.17 수리 (Accepted) 4-1-2015-5081402-70
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2018.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2018-5086612-26
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.07.06 수리 (Accepted) 4-1-2020-5149268-82
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
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다수개의 PC(120a~120n)에 원격부팅을 위한 랜 리눅스 PCI 카드(122a~122n)를 장착시킨 다음 서버(100)에 커널, 시스템 영역, 사용자 영역등의 PC노드를 위한 영역인 클러스터 미들웨어(110)를 구성하며, 상기 PC 부팅 시 원격부팅 모드를 선택하도록 하는 시스템 구성단계; 상기 서버(100)에는 검색할 서열 데이터베이스를 배치하고, PC(120a~120n)노드는 NFS(130)로 접근하여 상기 서열 데이터베이스를 상기 PC노드의 개수로 나누어 분할된 데이터베이스를 각 PC(120a~120n)노드의 캐쉬 메모리에 배치시키며, 상기 클러스터 미들웨어는 사용자 질의를 PC 노드에 분배하고, 각 노드 PC 별로 검색을 실행한 후, 그 결과를 다시 통합하여 최종결과를 생성하는 결과 생성단계; 상기 서버는 PC 노드의 검색 결과를 서버의 하드 디스크에 보관하고, 각 PC 노드는 검색 결과를 마스터 서버에 NFS를 이용하여 전송하고, 클러스터 미들웨어는 각 PC에서 전송된 결과를 통합하는 결과 통합단계로 구성된 PC 클러스터 기반 BLAST 고속 검색을 위한 파티셔닝 방법
2 2
제 1 항에 있어서, 상기 결과 생성단계에서 각 PC 노드에 분할된 데이터베이스가 캐쉬 메모리보다 클 경우 재분배 과정을 거쳐 데이터 베이스를 완전히 캐쉬 메모리에 배치할 수 있는 상태로 변경하는 과정이 추가되는 것을 특징으로 하는 PC 클러스터 기반 BLAST 고속 검색을 위한 파티셔닝 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육인적자원부 한국기계연구원 충북BIT연구중심대학육성사업 질병에서 단백질 상호작용의 달백질-단백질 네트워크 분석도구 개발