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다음의 단계를 포함하는 펩타이드 서열의 동정방법:(a) 분석하고자 하는 펩타이드와 하기 화학식 1로 표시되는 화합물을 컨쥬게이션하는 단계:화학식 1 상기 화학식에서 R1은 직쇄 또는 분쇄의 C1-C4 알킬로 치환된 페닐이고, R2는 2,5-디옥소-1-피롤리디닐옥시, 2,5-디옥소-3-설포닐-1-피롤리디닐옥시, 2,3,4,5,6-펜타플루오로페녹시, 4-설포-2,3,5,6-테트라플루오로페녹시, 할라이드 또는 아자이드이다;(b) 상기 컨쥬게이션된 펩타이드를 음이온화하는 단계:(c) 상기 음이온화된 컨쥬게이션된 펩타이드를 충돌로 활성화시켜 라디칼 종을 포함하는 분자 이온 단편을 형성하는 단계;(d) 상기 분자 이온 단편의 질량을 분석하는 단계
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제 1 항에 있어서, 상기 단계 (b)는 상기 펩타이드의 아미노산 잔기를 단일 탈수소화(single-deprotonation)하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 단계 (a)는 상기 화학식 1로 표시되는 화합물을 펩타이드 N-말단의 아미노기 또는 라이신 잔기의 아민기에 컨쥬게이션하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 단계 (c)는 1회의 충돌 활성화를 통해 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 분자 이온 단편은 a-, c-, x-, z- 및 y-형 이온으로 구성되는 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 방법은 기체 상(gas phase)에서 수행하는 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 단계 (c)-(d)는 질량분석기(mass spectrometer)에서 실시되는 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 화학식 1의 R2는 2,5-디옥소-1-피롤리디닐옥시인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 화학식 1의 R1은 페닐메틸인 것을 특징으로 하는 방법
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제 9 항에 있어서, 상기 화학식 1의 화합물은 하기 화학식 2 또는 화학식 3으로 표시되는 화합물인 것을 특징으로 하는 방법:화학식 2 화학식 3
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