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단백질 수식화의 포괄적인 동정을 위한 이중 질량 분석기 스펙트럼의 MODa(modification alignment)를 통한 다중-무제한 변이 탐색 방법에 있어서,이중 질량 분석기로부터 MS/MS 스펙트럼 정보를 입력받아 복수의 아미노산 서열 태그를 유도하고, 데이터베이스에서 해당 서열태그들을 포함하는 후보 펩티드들에 대해 각각의 서열태그를 정렬하는 단계; 및상기 스펙트럼 정보와 상기 후보 펩티드들의 서열 간의 정렬을 위해 상기 각각의 서열태그가 정렬된 행렬에서 태그들의 위치 정보에 따라 이동 경로를 제한하는 동적 프로그래밍을 통해 각 펩티드 당 변이의 수에 제한 없이 후보 펩티드 내의 변이를 식별하는 단계를 포함하고,상기 동적 프로그래밍에서 상기 각각의 서열태그 정렬에 의해 행렬을 정의하고 상기 각각의 서열태그 중 두 태그로부터 유추된 변이의 질량만을 이용하여 상기 변이를 식별하기 위한 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제1항에 있어서, 상기 스펙트럼에서 일정 간격마다 복수의 피크를 선택하여 피크 크기의 순위에 따라 각 피크에 가중치를 부여한 후 스펙트럼의 convolution 수행을 통해 상기 스펙트럼의 어미이온의 질량을 보정하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제2항에 있어서,각각의 어미이온의 질량에 비례하게 각 어미이온 마다 다르게 정해지는 질량 보정 범위 중 해당 어미이온의 질량 보정 범위 내에서 상기 어미이온의 질량을 보정하여 상기 서열 태그를 유도하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제3항에 있어서,해당 범위 내에서 상기 어미이온의 질량 보정에 실패하면 그 범위를 확장하여 확장된 범위 내에서 상기 어미이온의 질량을 다시 보정하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제1항에 있어서, 단백질들의 서열을 저장하되 상기 데이터베이스에 태그들이 위치한 인덱스와 함께 저장한 선처리된 단백질 데이터베이스를 이용하여 상기 후보 펩티드들을 검색하여 선택하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제1항에 있어서,점수화된(PRM) 스펙트럼을 생성하기 위해, 상기 스펙트럼에서 일정 간격마다 복수의 피크를 선택하여 피크 크기의 순위에 따라 각 피크에 가중치를 부여하고, 각 피크에 가능한 단편 이온 형태를 가정하여 각 피크의 질량을 N-말단(N-terminus: 아미노 말단) 단편 질량인 prefix 단편 질량으로 변환하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제1항에 있어서, 상기 변이를 식별하는 단계는, 상기 후보 펩티드들과 정렬된 모든 서열태그에 대해서 서열태그 N-말단(N-terminus: 아미노 말단) 프랭킹 질량과 대응되는 펩티드 부분서열의 질량간의 차이를 델타로 정의하고, 두 서열태그 사이에서 발생 가능한 변이의 질량을 두 태그의 델타간의 차이로 표시하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제1항에 있어서, 상기 동적 프로그래밍에서 상기 각각의 서열태그 정렬에 의해 정의된 행렬에서의 이동 경로를 셀과 서열태그 간의 상대적인 위치와 서열태그 내의 셀 포함여부에 따라 제한하여 최적 경로를 찾는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제9항에 있어서, 상기 최적 경로를 찾기 위해, N-말단(N-terminus: 아미노 말단) 단편 질량인 prefix 단편 질량이 포함되도록 변환된 점수화된(PRM) 스펙트럼으로부터 각 경로 단편 질량들에 해당하는 위치의 스코어를 합산하여 각 경로의 스코어를 계산하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제10항에 있어서, 상기 최적 경로의 스코어에 하나의 피크에 대한 스코어가 중복적으로 반영된 경우 그 스코어가 한번만 반영되도록 보정하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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제9항에 있어서, 상기 최적 경로에 따른 펩티드 해석에 다중 변이가 포함되고 하나의 피크에 대한 점수가 중복적으로 반영된 경우 후보 펩티드에 대해 현재의 해석보다 적은 수의 변이를 가지는 경로를 추가로 탐색하여 비교하는 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 방법
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단백질 수식화의 포괄적인 동정을 위한 이중 질량 분석기 스펙트럼의 MODa(modification alignment)를 통한 다중-무제한 변이 탐색 장치에 있어서,이중 질량 분석기로부터 MS/MS 스펙트럼 정보를 입력받아 복수의 아미노산 서열태그를 유도하고, 데이터베이스에서 해당 서열태그들을 포함하는 후보 펩티드들에 대해 각각의 서열태그를 정렬하는 제1 수단; 및상기 스펙트럼 정보와 상기 후보 펩티드들의 서열 간의 정렬을 위해 상기 각각의 서열태그가 정렬된 행렬에서 태그들의 위치 정보에 따라 이동 경로를 제한하는 동적 프로그래밍을 통해 각 펩티드 당 변이의 수에 제한 없이 후보 펩티드 내의 변이를 식별하는 제2 수단을 포함하고,상기 동적 프로그래밍에서 상기 각각의 서열태그 정렬에 의해 행렬을 정의하고 상기 각각의 서열태그 중 두 태그로부터 유추된 변이의 질량만을 이용하여 상기 변이를 식별하기 위한 것을 특징으로 하는 다중-무제한 변이 탐색 장치
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