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유전체 시퀀스 내 코돈 상관 관계 패턴 계산 방법 및 장치

  • 기술번호 : KST2015206666
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명의 일 실시예에 따르면, 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 방법은 입력된 유전체 시퀀스(Sequence)를 코돈(codon) 단위로 나누는 단계, 상기 코돈 단위로 나누어진 데이터를 입력받고, 처음 입력된 코돈을 대상 코돈으로 지정한 뒤, 향후 입력된 코돈들을 순차적으로 탐색하여 해당 유전체 시퀀스에 포함된 대상 코돈의 동의 코돈을 탐색하는 단계, 상기 탐색 결과를 유사코돈 관련성 매트릭스(synonymous codon associations matrix, SCAM)에 기록하는 단계 및 상기 유사코돈 관련성 매트릭스를 유사코돈 트랜지션 매트릭스(synonymous codon transition matrix, SCTM)로 변환하는 단계를 포함할 수 있다.
Int. CL G06F 17/10 (2006.01) G06F 19/10 (2011.01)
CPC G06F 19/12(2013.01) G06F 19/12(2013.01) G06F 19/12(2013.01) G06F 19/12(2013.01)
출원번호/일자 1020110099402 (2011.09.29)
출원인 한국과학기술정보연구원
등록번호/일자 10-1263806-0000 (2013.05.07)
공개번호/일자 10-2013-0035127 (2013.04.08) 문서열기
공고번호/일자 (20130513) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2011.09.29)
심사청구항수 10

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술정보연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 안인성 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 김용인 대한민국 서울특별시 송파구 올림픽로 ** (잠실현대빌딩 *층)(특허법인(유한)케이비케이)
2 박영복 대한민국 서울특별시 강남구 논현로**길 **, *층(역삼동, 삼화빌딩)(특허법인 두성)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술정보연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2011.09.29 수리 (Accepted) 1-1-2011-0764408-05
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2012.09.26 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2012.10.24 수리 (Accepted) 9-1-2012-0080000-14
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2012.11.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0715686-13
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2013.01.23 수리 (Accepted) 1-1-2013-0067147-47
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2013.01.23 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2013-0067146-02
7 등록결정서
Decision to grant
2013.04.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0297302-58
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
입력된 유전체 시퀀스(Sequence)를 코돈(codon) 단위로 나누는 데이터 입력모듈;상기 코돈 단위로 나누어진 데이터를 입력받고, 처음 입력된 코돈을 대상 코돈으로 지정한 뒤, 향후 입력된 코돈들을 순차적으로 탐색하여 해당 유전체 시퀀스에 포함된 대상 코돈의 동의 코돈을 탐색하는 유사코돈 탐색모듈;상기 탐색 결과를 유사코돈 관련성 매트릭스(synonymous codon associations matrix, SCAM)에 기록하는 기록변환 모듈; 및상기 유사코돈 관련성 매트릭스(SCAM)를 유사코돈 트랜지션 매트릭스(synonymous codon transition matrix, SCTM)로 변환하는 데이터 변환 모듈을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 장치
2 2
제 1항에 있어서, 상기 유사코돈 탐색 모듈은,상기 대상 코돈의 동의 코돈을 전부 탐색한 뒤에는, 두번째로 입력된 코돈을 새로운 대상 코돈으로 지정하여 다시 새로운 대상 코돈의 동의 코돈을 탐색하는 것을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 장치
3 3
제 1항에 있어서, 상기 유사코돈 관련성 매트릭스는 61 by 61 매트릭스 인 것을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 장치
4 4
제 1항에 있어서, 상기 데이터 변환모듈은,상기 유사코돈 관련성 매트릭스의 각 셀의 값을 해당 행의 합으로 나눈 상대값을 유사코돈 트랜지션 매트릭스의 각 셀에 나타내는 것을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 장치
5 5
제 4항에 있어서, 상기 데이터 변환모듈은, 상기 유사코돈트랜지션 매트릭스의 각 셀에 상기 상대값을 구별하기 위한 특정색으로 상기 상대값을 처리하여 표시하는 것을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 장치
6 6
입력된 유전체 시퀀스(Sequence)를 코돈(codon) 단위로 나누는 단계;상기 코돈 단위로 나누어진 데이터를 입력받고, 처음 입력된 코돈을 대상 코돈으로 지정한 뒤, 향후 입력된 코돈들을 순차적으로 탐색하여 해당 유전체 시퀀스에 포함된 대상 코돈의 동의 코돈을 탐색하는 단계;상기 탐색 결과를 유사코돈 관련성 매트릭스(synonymous codon associations matrix, SCAM)에 기록하는 단계; 및상기 유사코돈 관련성 매트릭스를 유사코돈 트랜지션 매트릭스(synonymous codon transition matrix, SCTM)로 변환하는 단계;를 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 방법
7 7
제 6항에 있어서, 상기 코돈 단위로 나누어진 데이터를 입력받고, 처음 입력된 코돈을 대상 코돈으로 지정한 뒤, 향후 입력된 코돈들을 순차적으로 탐색하여 해당 유전체 시퀀스에 포함된 대상 코돈의 동의 코돈을 탐색하는 단계는,상기 대상 코돈의 동의 코돈을 전부 탐색한 뒤에는, 두번째로 입력된 코돈을 새로운 대상 코돈으로 지정하여 다시 새로운 대상 코돈의 동의 코돈을 탐색하는 것을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 방법
8 8
제 6항에 있어서, 상기 유사코돈 관련성 매트릭스는 61 by 61 매트릭스 인 것을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 방법
9 9
제 6항에 있어서, 상기 유사코돈 관련성 매트릭스를 유사코돈 트랜지션 매트릭스(synonymous codon transition matrix, SCTM)로 변환하는 단계는,상기 유사코돈 관련성 매트릭스의 각 셀의 값을 해당 행의 합으로 나눈 상대값을 유사코돈 트랜지션 매트릭스의 각 셀에 나타내는 것을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 방법
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제 9항에 있어서, 상기 상대값은 상기 유사코돈트랜지션 매트릭스의 각 셀에 상기 상대값을 구별하기 위한 특정색으로 처리되어 표시되는 것을 포함하는 유전체 시퀀스 내 코돈 상관관계 패턴 계산 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.