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ＰＣＲ 앰플리콘의 희석 단계를 포함하는 ＤＮＡ 용융 분석을 이용한 ＳＮＰ 지노타이핑 방법

  • 기술번호 : KST2015207763
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 PCR 앰플리콘의 희석 단계를 포함하는 DNA 용융(melting) 분석을 이용한 SNP 지노타이핑(genotyping) 방법에 관한 것으로, SNP 지노타이핑을 위한 DNA 용융 분석에서 PCR 앰플리콘의 희석에 의해 비표지 프로브(unlabeled probe)의 결합 효율 및 대립 유전자(allelic identities)의 식별력(discrimination)을 높이고 SNP 판별용 프로브의 3’-말단 변형(modification)의 필요성을 없앨 수 있는 장점이 있다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/52 (2006.01)
CPC C12Q 1/6827(2013.01) C12Q 1/6827(2013.01) C12Q 1/6827(2013.01)
출원번호/일자 1020110132034 (2011.12.09)
출원인 한국 한의학 연구원
등록번호/일자 10-1357237-0000 (2014.01.23)
공개번호/일자 10-2013-0065258 (2013.06.19) 문서열기
공고번호/일자 (20140206) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2011.12.09)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국 한의학 연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 정상균 대한민국 대전광역시 유성구
2 유현주 대한민국 대전광역시 유성구
3 김종열 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 양부현 대한민국 서울특별시 송파구 오금로 **, 태원빌딩 **층, 특허팀(주식회사씨젠)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국 한의학 연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2011.12.09 수리 (Accepted) 1-1-2011-0980806-74
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2012.07.18 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2012.08.21 수리 (Accepted) 9-1-2012-0065188-81
4 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.06.11 수리 (Accepted) 4-1-2013-0024945-61
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2013.07.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0503962-94
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2013.09.23 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2013-0860161-11
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2013.09.23 수리 (Accepted) 1-1-2013-0860158-84
8 등록결정서
Decision to grant		 2014.01.16 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0034107-40
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번호 청구항
1 1
다음 단계들을 포함하고, 하기 1)의 PCR증폭단계에서 비표지 올리고뉴클레오티드 프로브를 함께 넣어주지 않고 PCR 증폭후에 따로 넣어주는 것을 특징으로 하는 DNA 용융 분석을 이용한 SNP 지노타이핑(genotyping) 방법:1) SNP 부위를 포함하는 표적 서열을 PCR 증폭하는 단계;2) 상기 증폭된 PCR 앰플리콘을 희석(dilution)하는 단계;3) 상기 희석된 PCR 앰플리콘을 형광 DNA 결합 염료(dye)의 존재하에 비표지 올리뉴클레오티드 프로브(unlabeled oligonucleotide probe)와 결합시키는 단계;4) 상기 결합된 산물의 온도를 점차 올려가면서 상기 프로브가 용융함에 따라 변해가는 형광강도를 측정(DNA 용융 분석)하는 단계,5) 상기 온도변화에 따른 형광강도의 변화곡선의 미분곡선을 얻은뒤, SNP의 각 타입을 대표하는 피크(peak)의 존재유무에 따라 SNP를 타이핑(typing)하는 단계
2 2
삭제
3 3
제1항에 있어서, 상기 2) 단계에서 상기 PCR 앰플리콘은 증류수 또는 PCR 반응버퍼에 2~10 배 희석하는 것을 특징으로 하는 SNP 지노타이핑 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 3) 단계에서 프로브 용액과 섞은 후 최종 PCR 산물의 희석배수가 6배 내지 96배인 것을 특징으로 하는 SNP 지노타이핑 방법
5 5
제1항에 있어서, 상기 2) 단계에서 상기 PCR 앰플리콘의 희석에 의해 비표지 프로브의 결합 효율을 높이고 SNP간의 식별력(discrimination)을 높이는 것을 특징으로 하는 SNP 지노타이핑 방법
6 6
제1항에 있어서, 상기 3) 단계에서 probe는 특정 고상 매질에 물리 또는 화학적으로 고정되어 있는 것을 특징으로 하는 SNP 지노타이핑 방법
7 7
제1항에 있어서, 상기 1) 단계에서 상기 PCR 증폭은 다중 SNPs를 한꺼번에 증폭하는 멀티플렉싱(multiplexing) PCR 인 것을 특징으로 하는 SNP 지노타이핑 방법
8 8
제1항에 있어서, 상기 2) 단계에서 상기 PCR 앰플리콘의 희석에 의해 폴리머라제의 불활성화를 통해 프로브의 3’-말단 변형(modification)의 필요성을 없애는 것을 특징으로 하는 SNP 지노타이핑 방법
9 9
제1항에 있어서, 상기 3) 단계에서 상기 희석된 PCR 앰플리콘을 형광 DNA 결합 염료와 상기 SNP에 상보적인 서열을 갖는 비표지 올리고뉴클레오티드 프로브 용액과 혼합한 다음, 상기 혼합물을 가열하여 이중나선 PCR 산물의 변성을 유도한후 프로브의 TM보다 낮은 온도에 방치하여 프로브가 표적 SNP 부위에 결합하도록 하는 것을 특징으로 하는 SNP 지노타이핑 방법
10 10
제1항에 있어서, 상기 4) 단계에서 DNA 용융 분석은 실시간 열순환기(Realtime thermal cycler)를 이용하여 실시하는 것을 특징으로 하는 SNP 지노타이핑 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 한국한의학연구원 바이오의료기술개발사업 체질정보 통합분석 및 체질질병 유정성 연구