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대사증후군 예측용 SNP 마커 및 이의 용도

  • 기술번호 : KST2015207822
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 사상체질 특이적 대사증후군 예측 또는 진단용 SNP(single nucleotide polymorphism) 마커에 관한 것으로, 보다 자세하게는 태음인, 소양인, 사음인 특이적 대사증후군 예측 또는 진단용 SNP 마커, 상기 마커를 검출할 수 있는 제제를 포함하는 조성물, 상기 조성물을 포함하는 키트 또는 마이크로어레이, 상기 마커를 이용한 사상체질 특이적 대사증후군 예측 또는 진단을 위한 정보의 제공 방법 및 사상체질 특이적 대사증후군 예측 또는 진단용 SNP를 선별하는 방법에 관한 것이다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)
CPC C12N 15/11(2013.01) C12N 15/11(2013.01) C12N 15/11(2013.01) C12N 15/11(2013.01) C12N 15/11(2013.01) C12N 15/11(2013.01)
출원번호/일자 1020150100062 (2015.07.14)
출원인 한국 한의학 연구원
등록번호/일자 10-1546070-0000 (2015.08.13)
공개번호/일자 10-2015-0090875 (2015.08.06) 문서열기
공고번호/일자 (20150821) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자 10-2013-0142402 (2013.11.21)
관련 출원번호 1020130142402
심사청구여부/일자 Y (2015.07.14)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국 한의학 연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 차성원 대한민국 대전광역시 유성구
2 박아연 대한민국 대전광역시 유성구
3 유현주 대한민국 대전광역시 유성구
4 김종열 대한민국 대전광역시 중구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 손민 대한민국 서울특별시 송파구 법원로 ***, *층(문정동)(특허법인한얼)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국 한의학 연구원 대한민국 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [분할출원]특허출원서
[Divisional Application] Patent Application
2015.07.14 수리 (Accepted) 1-1-2015-0682124-81
2 등록결정서
Decision to grant
2015.08.10 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2015-0535072-37
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번호 청구항
1 1
서열번호 33 내지 51의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드 세트를 포함하며, 상기 염기서열은 101 번째 염기를 SNP로서 포함하고, 상기 서열번호 33의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 34의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 35의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 36의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 37의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 38의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 39의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 40의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 41의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 42의 101번째 염기는 C이고, 서열번호 43의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 44의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 45의 101번째 염기는 C이고, 서열번호 46의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 47의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 48의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 49의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 50의 101번째 염기는 C이고, 서열번호 51의 101번째 염기는 C인, 사상체질 중 소양인 특이적 대사증후군 예측 또는 진단용 마이크로 어레이
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제1항에 있어서, 상기 대사증후군은 복부 비만, 고혈압, 고중성지방혈증, 저고밀도콜레스테롤혈증, 또는 고혈당증을 위험 인자로 하는 것인 마이크로어레이
3 3
제1항에 있어서, 상기 예측 또는 진단은 대사증후군을 진단하거나 위험을 예측하는 것인 마이크로어레이
4 4
서열번호 33 내지 51의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드 세트를 검출할 수 있는 프로브 또는 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머를 포함하고,상기 서열번호 33의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 34의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 35의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 36의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 37의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 38의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 39의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 40의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 41의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 42의 101번째 염기는 C이고, 서열번호 43의 101번째 염기는 G이고, 서열번호 44의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 45의 101번째 염기는 C이고, 서열번호 46의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 47의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 48의 101번째 염기는 T이고, 서열번호 49의 101번째 염기는 A이고, 서열번호 50의 101번째 염기는 C이고, 서열번호 51의 101번째 염기는 C인,사상체질 중 소양인 특이적 대사증후군 예측 또는 진단용 조성물
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제4항의 조성물을 포함하는 사상체질 중 소양인 특이적 대사증후군 예측 또는 진단용 키트
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제5항에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 DNA 칩 키트인 것인, 키트
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(a) 분리된 시료의 DNA로부터 서열번호 33 내지 51의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드 세트의 다형성 부위인 101번째 염기서열을 증폭하거나 프로브와 혼성화하는 단계; 및(b) 상기 (a) 단계의 증폭된 또는 혼성화된 다형성 부위의 염기를 결정하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 결정된 염기서열 중,서열번호 33으로 기재된 rs13130484에 있어서, 101번째 염기가 T인 경우; 서열번호 34로 기재된 rs1424233에 있어서, 101번째 염기가 A인 경우; 서열번호 35로 기재된 rs7561317에 있어서, 101번째 염기가 G인 경우; 서열번호 36로 기재된 rs2605100에 있어서, 101번째 염기가 A인 경우; 서열번호 37로 기재된 rs4149270에 있어서, 101번째 염기가 T인 경우; 서열번호 38로 기재된 rs6589566에 있어서, 101번째 염기가 G인 경우; 서열번호 39로 기재된 rs4420638에 있어서, 101번째 염기가 G인 경우; 서열번호 40으로 기재된 rs261332에 있어서, 101번째 염기가 G인 경우; 서열번호 41로 기재된 rs1566732에 있어서, 101번째 염기가 A인 경우; 서열번호 42로 기재된 rs6129647에 있어서, 101번째 염기가 C인 경우; 서열번호 43으로 기재된 rs10903129에 있어서, 101번째 염기가 G인 경우; 서열번호 44로 기재된 rs1436955에 있어서, 101번째 염기가 A인 경우; 서열번호 45로 기재된 rs7754840에 있어서, 101번째 염기가 C인 경우; 서열번호 46으로 기재된 rs7767391에 있어서, 101번째 염기가 T인 경우; 서열번호 47로 기재된 rs6475606에 있어서, 101번째 염기가 T인 경우; 서열번호 48로 기재된 rs4402960에 있어서, 101번째 염기가 T인 경우; 서열번호 49로 기재된 rs864745에 있어서, 101번째 염기가 A인 경우; 서열번호 50으로 기재된 rs5215에 있어서, 101번째 염기가 C인 경우; 및 서열번호 51로 기재된 rs163171에 있어서, 101번째 염기가 C인 경우, 사상체질 중 소양인 특이적 대사증후군으로 판단하는 단계를 포함하는, 사상체질 중 소양인 특이적 대사증후군 예측 또는 진단을 위한 정보의 제공 방법
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제7항에 있어서, 상기 (b) 단계의 염기 결정은 서열 분석, 마이크로어레이에 의한 혼성화, 대립 유전자 특이적인 PCR (allele specific PCR), 다이나믹 대립 유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization, DASH), PCR 연장 분석, PCR-SSCP (PCR-single strand conformation polymorphism), PCR-RFLP (PCR-restriction fragment length polymorphism) 및 TagMan 기법으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 방법에 의해 수행되는 것인 방법
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(a) 복부 비만, 고혈압, 고중성지방혈증, 저고밀도콜레스테롤혈증, 또는 고혈당증의 표현형과 연관성이 있는 SNP를 선별하는 단계;(b) 상기 (a) 단계의 선별된 SNP 중 다중 회귀 분석(multiple regression analysis)을 이용하여 대사증후군 표현형과 연관성이 있는 SNP를 선별하는 단계;(c) 상기 (b) 단계에서 선별된 SNP 중 다중 회귀 분석을 이용하여 대사증후군 표현형에 대해서 사상체질 중 소양인과 연관성이 있는 SNP를 선별하는 단계; 및(d) 상기 (c) 단계에서 선별된 SNP의 GRS(genetic risk score)를 계산하여 이를 독립변수로 다중 회귀 분석을 수행하여 사상체질 중 소양인 특이적 SNP를 선별하는 단계를 포함하는, 사상체질 중 소양인 특이적 대사증후군 예측 또는 진단용 SNP 선별 방법
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1 교육과학기술부 한국한의학연구원 바이오·의료기술개발사업 체질 형질 연구와 체질 질병 유전성 연구