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마이크로어레이 데이터 통합 시스템 및 그 방법

  • 기술번호 : KST2015208303
  • 담당센터 : 인천기술혁신센터
  • 전화번호 : 032-420-3580
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 하나의 질병에 대해서 공통적으로 중요한 역할을 수행하는 miRNA 및 유전자를 추정하며, 추정된 miRNA와 연관된 단백질 및 이와 관련된 질병정보까지 확장시킬 수 있는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템 및 그 방법에 관한 것이다. 이를 구현하기 위해, 본 발명은 유전자발현 데이터베이스에서 동일한 질병에 대해서 서로 상이한 프로브로 서로 상이한 RNA가 검출된 복수의 샘플을 선택하는 샘플 선택 모듈과, 샘플 선택 모듈에서 선택된 복수의 샘플을 전처리하여 일정 신뢰도의 RNA를 검출하는 전처리 모듈과, 전처리된 복수의 샘플을 맵핑하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 맵핑 모듈을 포함하는 시스템 및 이를 이용한 방법을 제공한다. 이에 따라, 본 발명은 동일한 질병에 대해서 서로 다른 프로브를 통해 생성된 복수의 샘플을 맵핑을 통해 유전자 관계의 흐름을 파악하여 하나의 질병에 대해서 공통적으로 중요한 역할을 수행하는 miRNA 및 유전자를 추정함으로써 동일한 질병에 대한 마이크로어레이 데이터들 사이의 의미관계를 쉽게 파악할 수 있다. 또한, 질병의 주요 인자와 PPI 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보를 연동하여 확장시킬 수 있으며, 특정 질병에 대한 주요 인자를 질병정보로 까지 확장시킬 수 있다.
Int. CL G06F 19/22 (2011.01) C12Q 1/68 (2006.01)
CPC C12Q 1/6883(2013.01) C12Q 1/6883(2013.01) C12Q 1/6883(2013.01) C12Q 1/6883(2013.01)
출원번호/일자 1020120131556 (2012.11.20)
출원인 가천대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2014-0065694 (2014.05.30) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 거절
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2012.11.20)
심사청구항수 20

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 가천대학교 산학협력단 대한민국 경기도 성남시 수정구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 임진묵 대한민국 서울 강북구
2 하경식 대한민국 경기도 성남시 분당구
3 김홍기 대한민국 서울특별시 종로구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인다나 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 *길 **, 신관 *층~*층, **층(역삼동, 광성빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2012.11.20 수리 (Accepted) 1-1-2012-0954756-69
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2013.01.10 수리 (Accepted) 4-1-2013-5005541-78
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2013.08.14 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2013.10.10 수리 (Accepted) 9-1-2013-0086348-61
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2014.02.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0138264-16
6 거절결정서
Decision to Refuse a Patent
2014.05.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0340022-13
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번호 청구항
1 1
유전자발현 데이터베이스에서 동일한 질병에 대해서 서로 상이한 프로브로 서로 상이한 RNA가 검출된 복수의 샘플을 선택하는 샘플 선택 모듈과,상기 샘플 선택 모듈에서 선택된 복수의 샘플을 전처리하여 일정 신뢰도의 RNA를 검출하는 전처리 모듈과,상기 전처리된 복수의 샘플을 맵핑하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 맵핑 모듈을 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
2 2
청구항 1에 있어서,상기 서로 상이한 RNA는 miRNA와 mRNA를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
3 3
청구항 2에 있어서,상기 복수의 샘플은 GEO(Gene Expression Omnibus) 샘플을 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
4 4
청구항 1에 있어서,상기 전처리 모듈은,상기 mRNA가 검출된 샘플을 정규화하는 정규화 모듈과,상기 miRNA와 정규화된 mRNA에 대해서 T-test를 수행하는 T-test 모듈을 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
5 5
청구항 4에 있어서,상기 정규화 모듈은 RMA 방법(Robust Multi-array Average Method)을 적용하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
6 6
청구항 1에 있어서,상기 맵핑 모듈은 miRBase로 상기 전처리된 복수의 샘플을 맵핑하여 상기 miRNA와 상기 mRNA의 연결 관계를 추정하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
7 7
청구항 6에 있어서,상기 miRBase의 결과 값은 Mature 시퀀스 5p와 Mature 시퀀스 3p를 사용하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
8 8
청구항 1에 있어서,상기 주요 인자에 대해서 PPI(Protein-Protein Interaction) 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보와 연동시키는 확장 모듈을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
9 9
청구항 8에 있어서,상기 주요 인자와 연동된 PPI 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보를 해당 단백질 상호작용 정보에 해당하는 질병정보로 확장시키는 질병정보 확장 모듈을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
10 10
청구항 1에 있어서,상기 주요 인자를 해당 단백질 상호작용 정보에 해당하는 질병정보로 확장시키는 질병정보 확장 모듈을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
11 11
샘플 선택 모듈이 유전자발현 데이터베이스에서 동일한 질병에 대해서 서로 상이한 프로브로 서로 상이한 RNA가 검출된 복수의 샘플을 선택하는 단계와,상기 선택된 복수의 샘플을 전처리 모듈로 전처리하여 일정 신뢰도의 RNA를 검출하는 단계와,상기 전처리된 복수의 샘플을 맵핑 모듈로 맵핑하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
12 12
청구항 11에 있어서,상기 서로 상이한 RNA는 miRNA와 mRNA를 포함하는 것을 특징으로 하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
13 13
청구항 12에 있어서,상기 복수의 샘플은 GEO(Gene Expression Omnibus) 샘플을 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
14 14
청구항 12에 있어서,상기 선택된 복수의 샘플을 전처리 모듈로 전처리하여 일정 신뢰도의 RNA를 검출하는 단계는,상기 mRNA가 검출된 샘플을 정규화 모듈로 정규화하는 단계와,상기 miRNA와 상기 정규화된 mRNA에 대해서 T-test 모듈로 T-test를 수행하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
15 15
청구항 14에 있어서,상기 mRNA가 검출된 샘플을 정규화 모듈로 정규화하는 단계는,상기 mRNA가 검출된 샘플을 RMA 방법(Robust Multi-array Average Method)을 적용한 정규화 모듈로 정규화하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
16 16
청구항 15에 있어서,상기 전처리된 복수의 샘플을 맵핑 모듈로 맵핑하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 단계는,상기 전처리된 복수의 샘플을 miRBase로 맵핑하여 상기 miRNA와 상기 mRNA의 연결 관계를 추정하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
17 17
청구항 16에 있어서,상기 miRBase의 결과 값은 Mature 시퀀스 5p와 Mature 시퀀스 3p를 사용하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
18 18
청구항 11 또는 청구항 16에 있어서,상기 주요 인자에 대해서 확장 모듈로 PPI(Protein-Protein Interaction) 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보와 연동시키는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
19 19
청구항 18에 있어서,상기 주요 인자와 연동된 PPI 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보를 질병정보 확장 모듈로 해당 단백질 상호작용 정보에 해당하는 질병정보로 확장시키는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
20 20
청구항 11에 있어서,상기 주요 인자를 질병정보 확장 모듈로 해당 단백질 상호작용 정보에 해당하는 질병정보로 확장시키는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 지식경제부 가천대학교 산학협력단 2012 년 IT 융합 고급인력과정 지원사업 고령자 건강 및 질환 관리 시스템 개발