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유전자발현 데이터베이스에서 동일한 질병에 대해서 서로 상이한 프로브로 서로 상이한 RNA가 검출된 복수의 샘플을 선택하는 샘플 선택 모듈과,상기 샘플 선택 모듈에서 선택된 복수의 샘플을 전처리하여 일정 신뢰도의 RNA를 검출하는 전처리 모듈과,상기 전처리된 복수의 샘플을 맵핑하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 맵핑 모듈을 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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청구항 1에 있어서,상기 서로 상이한 RNA는 miRNA와 mRNA를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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청구항 2에 있어서,상기 복수의 샘플은 GEO(Gene Expression Omnibus) 샘플을 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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4
청구항 1에 있어서,상기 전처리 모듈은,상기 mRNA가 검출된 샘플을 정규화하는 정규화 모듈과,상기 miRNA와 정규화된 mRNA에 대해서 T-test를 수행하는 T-test 모듈을 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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5 |
5
청구항 4에 있어서,상기 정규화 모듈은 RMA 방법(Robust Multi-array Average Method)을 적용하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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6
청구항 1에 있어서,상기 맵핑 모듈은 miRBase로 상기 전처리된 복수의 샘플을 맵핑하여 상기 miRNA와 상기 mRNA의 연결 관계를 추정하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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7 |
7
청구항 6에 있어서,상기 miRBase의 결과 값은 Mature 시퀀스 5p와 Mature 시퀀스 3p를 사용하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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8
청구항 1에 있어서,상기 주요 인자에 대해서 PPI(Protein-Protein Interaction) 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보와 연동시키는 확장 모듈을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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9
청구항 8에 있어서,상기 주요 인자와 연동된 PPI 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보를 해당 단백질 상호작용 정보에 해당하는 질병정보로 확장시키는 질병정보 확장 모듈을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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10
청구항 1에 있어서,상기 주요 인자를 해당 단백질 상호작용 정보에 해당하는 질병정보로 확장시키는 질병정보 확장 모듈을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 시스템
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11
샘플 선택 모듈이 유전자발현 데이터베이스에서 동일한 질병에 대해서 서로 상이한 프로브로 서로 상이한 RNA가 검출된 복수의 샘플을 선택하는 단계와,상기 선택된 복수의 샘플을 전처리 모듈로 전처리하여 일정 신뢰도의 RNA를 검출하는 단계와,상기 전처리된 복수의 샘플을 맵핑 모듈로 맵핑하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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12
청구항 11에 있어서,상기 서로 상이한 RNA는 miRNA와 mRNA를 포함하는 것을 특징으로 하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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청구항 12에 있어서,상기 복수의 샘플은 GEO(Gene Expression Omnibus) 샘플을 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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14
청구항 12에 있어서,상기 선택된 복수의 샘플을 전처리 모듈로 전처리하여 일정 신뢰도의 RNA를 검출하는 단계는,상기 mRNA가 검출된 샘플을 정규화 모듈로 정규화하는 단계와,상기 miRNA와 상기 정규화된 mRNA에 대해서 T-test 모듈로 T-test를 수행하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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15
청구항 14에 있어서,상기 mRNA가 검출된 샘플을 정규화 모듈로 정규화하는 단계는,상기 mRNA가 검출된 샘플을 RMA 방법(Robust Multi-array Average Method)을 적용한 정규화 모듈로 정규화하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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16
청구항 15에 있어서,상기 전처리된 복수의 샘플을 맵핑 모듈로 맵핑하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 단계는,상기 전처리된 복수의 샘플을 miRBase로 맵핑하여 상기 miRNA와 상기 mRNA의 연결 관계를 추정하여 상기 질병의 주요 인자를 추정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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17
청구항 16에 있어서,상기 miRBase의 결과 값은 Mature 시퀀스 5p와 Mature 시퀀스 3p를 사용하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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청구항 11 또는 청구항 16에 있어서,상기 주요 인자에 대해서 확장 모듈로 PPI(Protein-Protein Interaction) 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보와 연동시키는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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청구항 18에 있어서,상기 주요 인자와 연동된 PPI 데이터베이스의 단백질 상호작용 정보를 질병정보 확장 모듈로 해당 단백질 상호작용 정보에 해당하는 질병정보로 확장시키는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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청구항 11에 있어서,상기 주요 인자를 질병정보 확장 모듈로 해당 단백질 상호작용 정보에 해당하는 질병정보로 확장시키는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 데이터 통합 방법
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