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DNA 유전자 샘플의 5'-말단(end) XIST(X(Inactive)-Specific Transcription) 유전자 서열에 존재하는 메틸화(methylation) 정도 측정방법에 있어서, 상기 DNA 유전자 샘플에 중아황산염(bisulfite)을 처리하는 단계; 상기 중아황산염이 처리된 DNA 유전자 샘플을 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 적합한 프라이머를 이용하여 PCR 방법으로 증폭시킴으로써 PCR 생산물(product)을 얻는 단계; 및 상기 PCR 생산물을 서열번호 1에 부합하는 유전자 서열을 갖는 시퀀싱프라이머(sequencing primer)를 이용하여 파이로시퀀싱(pyrosequencing)함으로써 메틸화 정도를 측정하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항에 있어서, 상기 서열번호 1은 중아황산염이 처리된 DNA 유전자 샘플 중에서 5'-말단(end) XIST 유전자 서열의 +931 위치부터 +946 위치까지의 16bp로 이루어진 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항에 있어서, 상기 서열번호 1에 부합하는 것은 서열번호 1과 일치하거나 상보적(complementary)인 것임을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항에 있어서, 상기 메틸화 정도를 측정하는 것은 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 CpG 아일랜드 부위의 메틸화 정도를 측정하는 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제4항에 있어서, 상기 CpG 아일랜드 부위는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열의 +947 위치와 +948 위치(CpG-1) 또는 +956 위치와 +957 위치(CpG-2) 또는 +971 위치와 +972 위치(CpG-3)에 존재하는 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항에 있어서, 상기 파이로시퀀싱은, 상기 PCR 생산물을 정제(purify)하는 단계; 및 상기 정제된 PCR 생산물의 한가닥(single strand)을 주형으로 하여 상기 시퀀싱프라이머와 어닐링(annealing) 시킨 뒤, 중아황산염이 처리된 PCR 생산물의 염기서열을 리딩(reading)하는 단계;를 포함하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항에 있어서, 상기 파이로시퀀싱은 PSQ(Pyrosequencing) 시스템에 의해 자동으로 시퀀싱되어 나온 시토신 피크를 이용하여 메틸화 백분율이 측정되는 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항에 있어서, 상기 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 적합한 프라이머는 서열번호 2 또는 서열번호 3에 부합하는 유전자 서열을 가지는 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항에 있어서, 상기 PCR 생산물은 5'-말단(end) XIST 유전자 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제8항에 있어서, 상기 PCR 생산물은 5'-말단(end) XIST 유전자 서열의 +871 위치부터 +1003 위치까지의 133개의 유전자 서열로 이루어진 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항에 있어서, 상기 중아황산염이 처리된 DNA 유전자 샘플은 상기 DNA 유전자 중에서 메틸화되어 있지 않은 시토신(cytosine) 유전자는 티민(thymine)으로 전환되고, 메틸화되어 있는 시토신(C) 유전자는 티민(T)으로 전환되지 않은 것을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 DNA 유전자 샘플은 인간의 혈액 또는 혈청으로부터 채취된 것임을 특징으로 하는 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화 정도 측정방법
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DNA 유전자 샘플의 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화(methylation) 정도를 측정하여 항암제의 항암활성을 측정하는 방법에 있어서, 상기 DNA 유전자 샘플에 항암제를 처리하는 단계; 상기 항암제가 처리된 DNA 유전자 샘플에 중아황산염(bisulfite)을 처리하는 단계; 상기 중아황산염이 처리된 DNA 유전자 샘플을 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 적합한 프라이머를 이용하여 PCR 방법으로 증폭시킴으로써 PCR 생산물(product)을 얻는 단계; 및 상기 PCR 생산물을 서열번호 1에 상보적(complementary)인 유전자 서열을 갖는 시퀀싱프라이머(sequencing primer)를 이용하여 파이로시퀀싱(pyrosequencing)함으로써 메틸화 정도를 측정하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암제의 항암활성을 측정하는 방법
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제15항에 있어서, 상기 항암제는 5-아자시티딘(5-Azacytidine), 5-데옥시-아자시티딘(5-deoxy-Azacytidine), 트리코스타틴 A(trichostatin A ; TSA), 데프시펩티드(depsipeptide), 발프로익산(valproic acid) 또는 5-플루오로우라실(5-Fluorouracil)인 것을 특징으로 하는 항암제의 항암활성을 측정하는 방법
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제15항에 있어서, 상기 항암제는 신규한 항암 후보 물질임을 특징으로 하는 항암제의 항암활성을 측정하는 방법
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DNA 유전자 샘플의 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 존재하는 메틸화(methylation) 정도 측정하기 위한 것으로, 상기 DNA 유전자 샘플에 중아황산염(bisulfite)을 처리하고, 상기 중아황산염이 처리된 DNA 유전자 샘플을 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 적합한 프라이머를 이용하여 PCR 방법으로 증폭시킴으로써 PCR 생산물(product)을 얻으며, 상기 PCR 생산물에 대하여 파이로시퀀싱(pyrosequencing)을 수행하기 위하여 서열번호 1에 상보적(complementary)인 유전자 서열을 갖는 시퀀싱프라이머(sequencing primer)를 포함하는 메틸화 측정 키트
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제18항에 있어서, 상기 5'-말단(end) XIST 유전자 서열에 적합한 프라이머로써 서열번호 2 또는 서열번호 3에 부합하는 유전자 서열을 가지는 프라이머를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 메틸화 측정 키트
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