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동중 원소 태그를 이용한 펩타이드의 정량 자료를 이용하여 잡음이 포함되지 않은 제1 스펙트럼을 추출하는 단계;상기 제1 스펙트럼에 대해 펩타이드 동정을 수행하는 단계;상기 추출된 제1 스펙트럼을 혼합하여 잡음이 포함된 제2 스펙트럼을 생성하는 단계;상기 제2 스펙트럼에 대해 펩타이드 동정을 수행하는 단계;상기 제1 스펙트럼 및 제2 스펙트럼 각각에 매칭되는 펩타이드들을 추출하여 비교하는 단계;상기 제1 스펙트럼 및 제2 스펙트럼에 대해 펩타이드 정량을 수행하는 단계;상기 제1 스펙트럼의 정량 결과와 제2 스펙트럼의 정량 결과를 비교하는 단계;상기 제1 스펙트럼의 정량 결과와 제2 스펙트럼의 정량 결과 간의 비교 결과에 따라 펩타이드의 발현 비율에 따른 제1종 오류 확률 또는 제2종 오류 확률을 제어할 수 있는 발현 차이 펩타이드(Differentially-Expressed Peptide: DEP)를 검출하기 위한 임계값을 결정하는 단계를 포함하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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제1항에 있어서,상기 제1 스펙트럼을 추출하는 단계는,적어도 하나의 펩타이드 동정 도구를 이용하여 동중 원소 태그를 통해 도출된 펩타이드의 스펙트럼을 동정하는 단계;전구체 분리 순도(Precursor Isolation Purity: PIP)에 기초하여 상기 동정을 통해 확인된 펩타이드들 중 잡음이 포함되지 않은 펩타이드들을 선택하는 단계; 및상기 선택된 펩타이드들의 전하량 및 리포터 이온을 고려하여 펩타이드 동정 도구를 통해 동정된 제1 스펙트럼을 추출하는 단계를 포함하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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제1항에 있어서,상기 제2 스펙트럼을 생성하는 단계는,전구체의 질량대 전하비가 분리 윈도우(isolation window)에 존재하는 2개의 제1 스펙트럼을 랜덤하게 선택하는 단계;상기 랜덤하게 선택된 2개의 제1 스펙트럼들을 가공하는 단계;제1 스펙트럼들을 미리 설정된 전구체 분리 순도에 대응하는 혼합 비율에 따라 상기 가공된 2개의 제1 스펙트럼들을 혼합하는 단계를 포함하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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제3항에 있어서,상기 2개의 제1 스펙트럼을 가공하는 단계는,상기 2개의 제1스펙트럼의 전체 이온 카운트(Total Ion Count)에 기초하여 상기 2개의 제1스펙트럼을 정규화하는 단계;상기 정규화된 2개의 제1스펙트럼의 피크들을 혼합하는 단계를 포함하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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제4항에 있어서,상기 피크들을 혼합하는 단계는,리포터 이온의 피크를 비닝하는 단계; 및상기 리포터 이온을 제외한 나머지 펩타이드 피크를 병합하는 단계를 포함하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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6
제5항에 있어서,상기 비닝하는 단계는,상기 리포터 이온들의 이론적인 질량을 기준으로 리포터 이온에 대해 미리 설정된 윈도우 내에 존재하는 리포터 이온의 피크를 하나의 피크로 병합하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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제5항에 있어서,상기 병합하는 단계는,상기 나머지 펩타이드 피크의 질량대전하비에 따라 두 개의 정규화된 제1 스펙트럼의 피크들을 병합하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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8
제1항에 있어서,상기 펩타이드 동정을 수행하는 단계는,MODa, MS-GF+, Proteome Discoverer 중 적어도 하나를 포함하는 펩타이드 동정 도구를 이용하여 펩타이드 동정을 수행하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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9
제1항에 있어서,상기 제1 스펙트럼의 정량 결과와 제2 스펙트럼의 정량 결과를 비교하는 단계는,상기 제1 스펙트럼의 정량 결과와 제2 스펙트럼의 정량 결과의 차이를 확률 분포로 출력하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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10
제1항에 있어서,상기 임계값을 결정하는 단계는,제1 스펙트럼의 발현 차이, 제2 스펙트럼의 발현 차이 및 제1 스펙트럼의 DEP를 검출하기 위한 임계값을 이용하여 제2 스펙트럼의 DEP를 검출하기 위한 임계값을 결정하는 펩타이드의 동정 및 정량 방법
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11
분석 시스템에 있어서,동중 원소 태그를 이용한 펩타이드의 정량 자료를 이용하여 잡음이 포함되지 않은 제1 스펙트럼을 추출하는 제1 스펙트럼 추출부;상기 제1 스펙트럼에 대해 펩타이드 동정을 수행하는 제1 펩타이드 동정부;상기 추출된 제1 스펙트럼을 혼합하여 잡음이 포함된 제2 스펙트럼을 생성하는 제2 스펙트럼 추출부;상기 제2 스펙트럼에 대해 펩타이드 동정을 수행하는 제2 펩타이드 동정부상기 제1 스펙트럼 및 제2 스펙트럼 각각에 매칭되는 펩타이드들을 추출하여 비교하는 펩타이드 비교부;상기 제1 스펙트럼 및 제2 스펙트럼에 대해 펩타이드 정량을 수행하는 펩타이드 정량부;상기 제1 스펙트럼의 정량 결과와 제2 스펙트럼의 정량 결과를 비교하는 정량 결과 비교부;상기 제1 스펙트럼의 정량 결과와 제2 스펙트럼의 정량 결과 간의 비교 결과에 따라 펩타이드의 발현 비율에 따른 제1종 오류 확률 또는 제2종 오류 확률을 제어할 수 있는 발현 차이 펩타이드(Differentially-Expressed Peptide: DEP)를 검출하기 위한 임계값을 결정하는 임계값 결정부를 포함하는 분석 시스템
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제11항에 있어서,상기 제1 스펙트럼 추출부는,적어도 하나의 펩타이드 동정 도구를 이용하여 동중 원소 태그를 통해 도출된 펩타이드의 스펙트럼을 동정하고,전구체 분리 순도(Precursor Isolation Purity: PIP)에 기초하여 상기 동정을 통해 확인된 펩타이드들 중 잡음이 포함되지 않은 펩타이드들을 선택하며,상기 선택된 펩타이드들의 전하량 및 리포터 이온을 고려하여 펩타이드 동정 도구를 통해 동정된 제1 스펙트럼을 추출하는 분석 시스템
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13
제11항에 있어서,상기 제2 스펙트럼 생성부는,전구체의 질량대 전하비가 분리 윈도우(isolation window)에 존재하는 2개의 제1 스펙트럼을 랜덤하게 선택하고,상기 랜덤하게 선택된 2개의 제1 스펙트럼들을 가공하며,제1 스펙트럼들을 미리 설정된 전구체 분리 순도에 대응하는 혼합 비율에 따라 상기 가공된 2개의 제1 스펙트럼들을 혼합하는 분석 시스템
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14
제11항에 있어서,상기 제2 스펙트럼 생성부는,상기 2개의 제1스펙트럼의 전체 이온 카운트(Total Ion Count)에 기초하여 상기 2개의 제1스펙트럼을 정규화하고, 상기 정규화된 2개의 제1스펙트럼의 피크들을 혼합하는 분석 시스템
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제14항에 있어서,상기 제2 스펙트럼 생성부는,리포터 이온의 피크를 비닝하고, 상기 리포터 이온을 제외한 나머지 펩타이드 피크를 병합하는 분석 시스템
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제15항에 있어서,상기 제2 스펙트럼 생성부는,상기 리포터 이온들의 이론적인 질량을 기준으로 리포터 이온에 대해 미리 설정된 윈도우 내에 존재하는 리포터 이온의 피크를 하나의 피크로 병합함으로써 리포터 이온의 피크를 비닝하는 분석 시스템
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제15항에 있어서,상기 제2 스펙트럼 생성부는,상기 나머지 펩타이드 피크의 질량대전하비에 따라 두 개의 정규화된 제1 스펙트럼의 피크들을 병합함으로써 펩타이드 피크를 병합하는 분석 시스템
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제11항에 있어서,상기 펩타이드 동정부는,MODa, MS-GF+, Proteome Discoverer 중 적어도 하나를 포함하는 펩타이드 동정 도구를 이용하여 펩타이드 동정을 수행하는 분석 시스템
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제11항에 있어서,상기 정량 결과 비교부는,상기 제1 스펙트럼의 정량 결과와 제2 스펙트럼의 정량 결과의 차이를 확률 분포로 출력하는 분석 시스템
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제11항에 있어서,상기 임계값 결정부는,제1 스펙트럼의 발현 차이, 제2 스펙트럼의 발현 차이 및 제1 스펙트럼의 DEP를 검출하기 위한 임계값을 이용하여 제2 스펙트럼의 DEP를 검출하기 위한 임계값을 결정하는 분석 시스템
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