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다음의 단계를 포함하는 아미노산 변이로 인한 단백질의 수화 자유에너지(hydration free energy, Ghyd) 변화(ΔGhyd)를 측정하는 방법: (a) 변이된 아미노산 잔기에 의한 수화 자유에너지 변화(ΔGmut); 전하를 띄는 아미노산 잔기에 의한 수화 에너지의 변화(ΔGch); 및 전하를 띄지 않는 아미노산 잔기에 의한 수화 에너지의 변화(ΔGn-ch)를 측정하는 단계; 및 (b) 상기 ΔGmut, ΔGch 및 ΔGn-ch 값을 합산하는 단계
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제 1 항에 있어서, 상기 전하를 띄는 아미노산 잔기에 의한 수화 에너지의 변화(ΔGch)는 하기 수학식을 이용하여 측정하는 것을 특징으로 하는 방법:상기 식에서, ΔQ는 아미노산 변이로 인한 단백질 총 전하의 변화이고, Q(wt)는 야생형 단백질의 총 전하이며, 는 아미노산 변이로 인한 하전된 아미노산 측쇄의 용매 접근가능 표면적 변화이고, 는 야생형 단백질의 하전된 아미노산 측쇄의 용매 접근가능 표면적이며, A 및 B는 무차원 계수(dimensionless coefficient)이다
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제 1 항에 있어서, 상기 전하를 띄지 않는 아미노산 잔기에 의한 수화 에너지의 변화(ΔGn-ch)는 하기 수학식을 이용하여 측정하는 것을 특징으로 하는 방법:상기 식에서, ΔQ는 아미노산 변이로 인한 단백질 총 전하의 변화이고, Q(wt)는 야생형 단백질의 총 전하이며, Δ는 아미노산 변이로 인한 비-하전된 잔기의 주쇄 산소 및 질소 원자의 용매 접근 가능한 표면적 변화이고, (wt)는 비-하전된 잔기의 주쇄 산소 및 질소 원자의 용매 접근 가능한 표면적이며, C는 무차원 계수(dimensionless coefficient)이다
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제 1 항에 있어서, 상기 변이된 아미노산 잔기에 의한 수화 자유에너지 변화(ΔGmut); 전하를 띄는 아미노산 잔기에 의한 수화 에너지의 변화(ΔGch); 및 전하를 띄지 않는 아미노산 잔기에 의한 수화 에너지의 변화(ΔGn-ch)의 측정은 전산 시뮬레이션을 이용하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법
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제 4 항에 있어서, 상기 전산 시뮬레이션은 분자 동력학 시뮬레이션(Molecular Dynamic Simulation)인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 한 항의 방법을 이용하여 아미노산 변이로 인한 단백질의 수화 자유에너지(hydration free energy, Ghyd) 변화(ΔGhyd) 값을 측정하는 단계를 포함하는 아미노산 변이로 인한 단백질의 소수성 변화를 예측하는 방법
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제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 한 항의 방법을 이용하여 아미노산 변이로 인한 단백질의 수화 자유에너지(hydration free energy, Ghyd) 변화(ΔGhyd) 값을 측정하는 단계를 포함하는 아미노산 변이로 인한 단백질의 응집(aggregation) 가능성을 예측하는 방법
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제 7 항에 있어서, 상기 단백질은 아밀로이드-베타(amyloid beta) 단백질인 것을 특징으로 하는 방법
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다음의 단계를 포함하는 변이된 아밀로이드-베타(amyloid beta) 단백질을 가지는 개체에서의 단백질 형태이상 질환(protein conformational disease)의 위험성을 결정하기 위한 분석 방법:(a) 유전정보를 포함하는 분리된 생체시료로부터 아밀로이드-베타(amyloid beta) 단백질의 코딩 뉴클레오타이드의 서열정보를 수득하는 단계; 및(b) 상기 (a) 단계에서 수득한 서열정보를 이용하여 제 1 항 내지 제 3 항 중 어느 한 항의 방법으로 아미노산 변이로 인한 단백질의 수화 자유에너지(hydration free energy, Ghyd) 변화(ΔGhyd) 값을 측정하는 단계
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제 9 항에 있어서, 상기 방법은 상기 아미노산 변이로 인한 단백질의 수화 자유에너지(hydration free energy, Ghyd) 변화(ΔGhyd)가 양의 값일 경우, 상기 단백질 형태이상 질환(protein conformational disease)의 위험성이 증가하는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 방법
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제 10 항에 있어서, 상기 단백질 형태이상 질환(protein conformational disease)은 알츠하이머병(Alzheimer's disease), 루이소체 치매(Lewy body dementia), 포함체 근육염(inclusion body myositis) 및 아밀로이드 뇌혈관병증(cerebral amyloid angiopathy)으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
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