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FFPE 조직에서 핵산의 분리 방법

  • 기술번호 : KST2017003072
  • 담당센터 : 부산기술혁신센터
  • 전화번호 : 051-606-6561
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 FFPE(formalin-fixed, paraffin-embedded) 조직 절편을 포함하는 시료로부터 핵산을 분리하는 방법, 핵산 분리 키트 및 핵산 분리를 위한 용해 완충액에 관한 것이다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) G01N 35/00 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)
CPC C12N 15/1013(2013.01)C12N 15/1013(2013.01)C12N 15/1013(2013.01)
출원번호/일자 1020150034697 (2015.03.12)
출원인 재단법인 아산사회복지재단, 울산대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2016-0110806 (2016.09.22) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2015.03.12)
심사청구항수 23

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 재단법인 아산사회복지재단 대한민국 서울특별시 송파구
2 울산대학교 산학협력단 대한민국 울산광역시 남구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 장세진 대한민국 경기도 성남시 분당구
2 천성민 대한민국 서울특별시 강동구
3 김태임 대한민국 서울특별시 송파구
4 이정신 대한민국 서울특별시 강남구
5 최은경 대한민국 서울특별시 송파구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 손민 대한민국 서울특별시 송파구 법원로 ***, *층(문정동)(특허법인한얼)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 울산대학교 산학협력단 대한민국 울산광역시 남구
2 재단법인 아산사회복지재단 대한민국 서울특별시 송파구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2015.03.12 수리 (Accepted) 1-1-2015-0244716-48
2 보정요구서
Request for Amendment		 2015.03.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2015-0061818-08
3 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2015.04.27 수리 (Accepted) 1-1-2015-0409102-06
4 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2015.05.07 수리 (Accepted) 1-1-2015-0438305-36
5 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2016.02.12 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
6 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2016.04.04 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2016-0043577-33
7 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2016.04.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0285129-33
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2016.06.20 수리 (Accepted) 4-1-2016-5080807-13
9 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2016.06.20 수리 (Accepted) 1-1-2016-0594402-16
10 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2016.07.20 수리 (Accepted) 1-1-2016-0705291-16
11 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2016.08.22 수리 (Accepted) 1-1-2016-0811532-23
12 지정기간연장 관련 안내서
Notification for Extension of Designated Period		 2016.08.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2016-0125995-84
13 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2016.09.05 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2016-0864690-59
14 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2016.10.20 수리 (Accepted) 1-1-2016-1021041-88
15 지정기간연장승인서
Acceptance of Extension of Designated Period		 2016.11.03 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0795073-48
16 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2016.11.18 수리 (Accepted) 1-1-2016-1129544-30
17 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2016.11.18 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2016-1129545-86
18 보정의취하간주안내문
 2016.11.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2016-0167270-75
19 등록결정서
Decision to grant		 2017.03.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2017-0219232-92
20 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.07.10 수리 (Accepted) 4-1-2020-5154267-54
21 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.07.31 수리 (Accepted) 4-1-2020-5172343-48
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
(a) FFPE(formalin-fixed, paraffin-embedded) 조직 절편을 킬레이트제(chelating agent), 이온성 계면활성제(ionic surfactant) 및 Tris-Cl을 포함하는 용해 완충액에 용해하여 분리된 시료를 제조하는 단계;(b) 상기 분리된 시료에 1 내지 4M의 염화나트륨을 포함하고, 평균 분자량이 6,000 내지 10,000Da인 PEG(polyethylene glycol)를 10 내지 40 %(w/v)로 포함하는 용액 및 자성 비드를 상기 용해 완충액의 부피를 기준으로 1배 내지 2
2 2
삭제
3 3
제1항에 있어서,상기 용해 완충액은 10 내지 100 mM 킬레이트제; 0
4 4
제3항에 있어서, 상기 용해 완충액의 pH는 7
5 5
제1항에 있어서, 상기 킬레이트제(chelating agent)는 DTPA(diethylenetriaminepentaacetic acid), EDTA(ethylenediaminetetraacetic acid), EGTA(ethylene glycol tetraacetic acid), 및 NTA(N,N-bis(carboxymethyl)glycine)로 이루어진 군으로부터 선택된 것인, 방법
6 6
제1항에 있어서, 상기 이온성 계면활성제는 SDS(sodium dodecyl sulfate), 암모니움 라우릴 설페이트(ammonium lauryl sulfate), SLES(sodium lauryl ether sulfate), 소디움 미레쓰 설페이트(sodium myreth sulfate), 디옥틸 소디움 설포석시네이트(dioctyl sodium sulfosuccinate), PFOS(perfluorooctanesulfonate), 페르플루오로부탄설포네이트(perfluorobutanesulfonate), LABs(linear alkylbenzene sulfonates), 소디움 라우로일 사르코시네이트(sodium lauroyl sarcosinate), PFOA(perfluorononanoate) 및 PFO(perfluorooctanoate)로 이루어진 군으로부터 선택된 것인, 방법
7 7
제1항에 있어서, 상기 용해 완충액은 EDTA, SDS 및 Tris-Cl을 포함하는 것인, 방법
8 8
삭제
9 9
삭제
10 10
삭제
11 11
제1항에 있어서, 용해 완충액과 함께 단백질 분해효소를 FFPE 조직 절편에 첨가하는 것을 포함하는 것인, 방법
12 12
제1항에 있어서, 상기 (c) 단계는 자성 비드가 첨가된 시료에서 자성 비드를 세척한 후, 자성 비드를 획득하고, 이로부터 핵산을 분리하는 것인, 방법
13 13
제12항에 있어서, 상기 세척은 50 내지 95 %(v/v) 에탄올 용액을 사용하여 수행되는 것인, 방법
14 14
제1항에 있어서, 상기 핵산은 게놈 DNA(genomic DNA)인, 방법
15 15
제1항에 있어서, 상기 FFPE 조직 절편은 4 내지 8㎛ 두께인 것인, 방법
16 16
제1항에 있어서, 상기 FFPE 조직은 제조된지 10년 이상인 것인, 방법
17 17
제1항에 있어서, 상기 FFPE 조직 절편은 용해 전에 탈파라핀 된 것인, 방법
18 18
킬레이트제(chelating agent), 이온성 계면활성제(ionic surfactant), 및 Tris-Cl을 포함하는 용해 완충액(lysis buffer); 1 내지 4M의 염화나트륨을 포함하고, 평균 분자량이 6,000 내지 10,000Da인 PEG(polyethylene glycol)를 10 내지 40%(w/v)로 포함하는 용액; 및 자성 비드를 포함하고,상기 1 내지 4 M의 염화나트륨을 포함하고, 평균 분자량이 6,000 내지 10,000Da인 PEG를 10 내지 40%(w/v)로 포함하는 용액과 자성 비드가 상기 용해 완충액의 부피를 기준으로 1배 내지 2
19 19
삭제
20 20
제18항에 있어서,상기 용해 완충액은 10 내지 100 mM 킬레이트제; 0
21 21
제18항 또는 제20항에 있어서, 상기 용해 완충액의 pH는 7
22 22
제18항에 있어서,상기 킬레이트제(chelating agent)는 DTPA(diethylenetriaminepentaacetic acid), EGTA(ethylene glycol tetraacetic acid), 및 NTA(N,N-bis(carboxymethyl)glycine)로 이루어진 군으로부터 선택된 것인, 키트
23 23
제18항에 있어서, 상기 이온성 계면활성제는 SDS(sodium dodecyl sulfate), 암모니움 라우릴 설페이트(ammonium lauryl sulfate), SLES(sodium lauryl ether sulfate), 소디움 미레쓰 설페이트(sodium myreth sulfate), 디옥틸 소디움 설포석시네이트(dioctyl sodium sulfosuccinate), PFOS(perfluorooctanesulfonate), 페르플루오로부탄설포네이트(perfluorobutanesulfonate), LABs(linear alkylbenzene sulfonates), 소디움 라우로일 사르코시네이트(sodium lauroyl sarcosinate), PFOA(perfluorononanoate) 및 PFO(perfluorooctanoate)로 이루어진 군으로부터 선택된 것인, 키트
24 24
제18항에 있어서, 상기 용해 완충액은 EDTA, SDS 및 Tris-Cl을 포함하는 것인, 키트
25 25
삭제
26 26
삭제
27 27
삭제
28 28
제18항에 있어서, 상기 키트는 추가로 자성 비드 세척 완충액, 자성 비드 분리 기구, 또는 둘 다를 추가로 포함하는 것인, 키트
29 29
제28항에 있어서, 상기 자성 비드 세척 완충액은 50 내지 95 %(v/v) 에탄올 용액인 것인, 키트
30 30
제28항에 있어서, 상기 자성 비드 분리 기구는 자성 스탠드(magnetic stand)인 것인, 키트
31 31
제18항에 있어서, 상기 핵산은 게놈 DNA(genomic DNA)인, 키트
32 32
삭제
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 CN107922940 CN 중국 FAMILY
2 EP03269813 EP 유럽특허청(EPO) FAMILY
3 US20180112208 US 미국 FAMILY
4 WO2016144136 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 CN107922940 CN 중국 DOCDBFAMILY
2 EP3269813 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
3 EP3269813 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
4 US2018112208 US 미국 DOCDBFAMILY
5 WO2016144136 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 미래창조과학부 울산대학교 산학협력단 동북아RND허브기반구축 아산-다나파버 암 유전체 연구 센터