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단백질 변성의 열역학적 분석방법(Methods for Thermodynamic Analysis of Protein Denaturation)

  • 기술번호 : KST2017006699
  • 담당센터 : 인천기술혁신센터
  • 전화번호 : 032-420-3580
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 액체 환경에서의 생체분자, 특히 단백질의 응집(aggregation) 가능성 예측방법 및 미스폴딩(misfolding) 가능성 예측방법에 관한 것이다.본 발명의 방법은 생체분자의 용매화 자유에너지를 척도로 하여 생체분자의 폴딩, 중합체화 및 응집 등의 시계열적이고 연속적인 변화에 대한 신뢰도 높은 정보를 수득할 수 있다. 본 발명의 방법은 단백질의 응집 또는 미스폴딩이 어떠한 에너지 요인에 의해, 또는 단백질의 어떠한 잔기에 의해 일어났는지를 밝힐 수 있는 정확한 위치 지향적 열역학적 분석(site-directed thermodynamics)을 제공한다. 이에, 본 발명은 다양한 단백질 변성질환(protein conformational disorder)을 치료 또는 예방하는 의약의 개발 및 생물학적 치료제로서 응집-내성 단백질을 설계하는 전략 수립에 유용하게 이용될 수 있다.
Int. CL G06F 19/12 (2015.11.14) G06F 19/16 (2015.11.14)
CPC G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01)
출원번호/일자 1020150136879 (2015.09.25)
출원인 숙명여자대학교산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2017-0037371 (2017.04.04) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2015.09.25)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 숙명여자대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 용산구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 함시현 대한민국 서울특별시 용산구
2 정성호 대한민국 서울특별시 용산구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인미주 대한민국 서울특별시 서초구 바우뫼로 **(우면동, 선일빌딩 *층)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 숙명여자대학교산학협력단 서울특별시 용산구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2015.09.25 수리 (Accepted) 1-1-2015-0940139-40
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2016.02.16 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2016.04.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2016-0044524-03
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2016.04.19 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0282456-33
5 보정요구서
Request for Amendment		 2016.06.16 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2016-0091859-41
6 [출원서 등 보정(보완)]보정서
 2016.06.20 수리 (Accepted) 1-1-2016-0591083-29
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2016.06.20 수리 (Accepted) 1-1-2016-0591151-36
8 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2016.06.20 수리 (Accepted) 1-1-2016-0591263-41
9 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2016.06.20 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2016-0591355-43
10 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2016.11.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0865276-85
11 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2017.01.31 수리 (Accepted) 1-1-2017-0098141-38
12 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2017.02.28 수리 (Accepted) 1-1-2017-0205310-36
13 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2017.02.28 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2017-0205339-59
14 등록결정서
Decision to grant		 2017.03.29 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2017-0225897-18
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2018.06.27 수리 (Accepted) 4-1-2018-5117847-65
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
하기 수학식을 이용하여 제 1 상태 및 제 2 상태의 생체분자에서의 용매화 자유에너지(solvation free energy)의 변화량을 측정하는 단계를 포함하는 액체 환경에서의 생체분자의 응집(aggregation) 가능성 예측방법:상기 식에서, Gsolv(ru)는 상기 생체분자의 특정 배위(configuration, ru)에서의 용매화 자유에너지이고, uij는 상기 생체분자의 구성원자 및 물 분자의 구성원자 간의 상호작용 전위(interaction potential)이며, λ는 상기 상호작용이 없는 상황(λ=0)에서 총(full) 상호작용(λ=1)에 이르기까지 점차적으로 전환되는 전하 파라미터(charging parameter)이고, gij(r;ru;λ)는 상기 전하 파라미터가 λ일 때의 평형 방사방향 분배 함수(equilibrium radial distribution function)이며, ρ는 물의 평균 개수밀도이다
2 2
제 1 항에 있어서, 상기 방법은 상기 용매화 자유에너지 변화량이 양의 값일 경우, 상기 생체분자의 응집 가능성이 증가하는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 액체 환경에서의 생체분자의 응집 가능성 예측방법
3 3
제 1 항에 있어서, 상기 용매화 자유에너지 변화량은 상기 생체분자의 단량체(monomer)를 물에 위치시키는 전산 시뮬레이션을 이용하여 측정하는 것을 특징으로 하는 액체 환경에서의 생체분자의 응집 가능성 예측방법
4 4
제 3 항에 있어서, 상기 전산 시뮬레이션은 분자 동력학 시뮬레이션(Molecular Dynamic Simulation)인 것을 특징으로 하는 액체 환경에서의 생체분자의 응집 가능성 예측방법
5 5
삭제
6 6
제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 생체분자는 단백질인 것을 특징으로 하는 액체 환경에서의 생체분자의 응집 가능성 예측방법
7 7
하기 수학식을 이용하여 제 1 상태 및 제 2 상태의 단백질의 용매화 자유에너지(solvation free energy)의 변화량을 측정하는 단계를 포함하는 액체 환경에서의 단백질의 미스폴딩(misfolding) 가능성 예측방법:상기 식에서, Gsolv(ru)는 상기 단백질의 특정 배위(configuration, ru)에서의 용매화 자유에너지이고, uij는 상기 단백질의 구성원자 및 물 분자의 구성원자 간의 상호작용 전위(interaction potential)이며, λ는 상기 상호작용이 없는 상황(λ=0)에서 총(full) 상호작용(λ=1)에 이르기까지 점차적으로 전환되는 전하 파라미터(charging parameter)이고, gij(r;ru;λ)는 상기 전하 파라미터가 λ일 때의 평형 방사방향 분배 함수(equilibrium radial distribution function)이며, ρ는 물의 평균 개수밀도이다
8 8
제 7 항에 있어서, 상기 방법은 상기 용매화 자유에너지 변화량이 양의 값일 경우, 상기 단백질의 미스폴딩 가능성이 증가하는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 액체 환경에서의 단백질의 미스폴딩 가능성 예측방법
9 9
제 7 항에 있어서, 상기 용매화 자유에너지 변화량은 상기 단백질의 단량체(monomer)를 물에 위치시키는 전산 시뮬레이션을 이용하여 측정하는 것을 특징으로 하는 액체 환경에서의 단백질의 미스폴딩 가능성 예측방법
10 10
제 9 항에 있어서, 상기 전산 시뮬레이션은 분자 동력학 시뮬레이션(Molecular Dynamic Simulation)인 것을 특징으로 하는 액체 환경에서의 단백질의 미스폴딩 가능성 예측방법
11 11
삭제
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.