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간암 발생 특이적 유전자 발현에 관여하는 유전자 구조 내 CPG 섬의 DNA 메틸화 변이를 이용한 간암의 예측 또는 진단 방법(METHOD FOR DIAGNOSING OR PREDICTING HEPATOCELLULAR CARCINOMA USING DNA METHYLATION CHANGES OF INTRAGENIC CPG ISLAND INVOLVED IN HEPATOCELLULAR CARCINOMA SPECIFIC GENE EXPRESSION)

  • 기술번호 : KST2017010398
  • 담당센터 : 서울서부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-6124-6930
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 간암(hepatocellular carcinoma, HCC) 발생 특이적 유전자 발현에 관여하는 유전자 구조 내 CpG 섬(intragenic CGI)의 메틸화 변이를 이용한 간암의 예측 또는 진단 방법에 관한 것이다. 보다 구체적으로, 본 발명은 간암 발생 과정에서 후성유전학적 변이에 관여하는 유전자 구조 내 CpG 섬(Intragenic CGI)의 DNA 메틸화 변이를 이용하여 간암의 예측 또는 진단을 가능하게 한다. 또한, 본 발명은 상기 간암 발생 과정에서 후성유전학적 변이에 관여하는 유전자 구조 내 CpG 섬의 DNA 메틸화 변이와 환자 그룹별 인종, 성별, 나이 및 바이러스와의 연관성을 바탕으로 환자 맞춤형 간암 치료를 가능하게 한다.
Int. CL C12Q 1/68 (2018.01.01)
CPC C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01)
출원번호/일자 1020150179742 (2015.12.16)
출원인 연세대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2017-0071724 (2017.06.26) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 N
심사청구항수 7

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서대문구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김영준 대한민국 서울특별시 강남구
2 이선민 대한민국 경기도 화성
3 최원영 대한민국 서울특별시 용산구
4 이정우 대한민국 서울특별시 도봉구
5 김다원 대한민국 서울특별시 강남구
6 이진영 대한민국 경기도 안산시 단원구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인다나 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 *길 **, 신관 *층~*층, **층(역삼동, 광성빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2015.12.16 수리 (Accepted) 1-1-2015-1231374-56
2 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)
2019.03.15 수리 (Accepted) 1-1-2019-0269898-17
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번호 청구항
1 1
(A) 임상 샘플에서 DNA를 분리하는 단계; (B) 상기 분리된 DNA에서 간암(hepatocellular carcinoma, HCC) 발생 특이적 유전자 발현에 관여하는 유전자 구조 내 CpG 섬(Intragenic CGI)의 DNA 메틸화를 측정하는 단계; 및(C) 상기 측정된 유전자 구조 내 CGI의 DNA 메틸화 수준을 표준 유전자 구조 내 CGI의 DNA 메틸화 수준과 비교하는 단계를 포함하는, 간암의 예측 또는 진단 방법
2 2
제1항에 있어서,상기 간암 발생 특이적 유전자는 TP53, CTNNB1, ALB, RB1, BAP1, ARID1A, AXIN1, HNF1A, PTEN, IL6ST 및 CDKN1A로 이루어진 군으로부터 1종 이상 선택되는 것인, 간암의 예측 또는 진단 방법
3 3
제1항에 있어서,상기 간암 발생 특이적 유전자 발현에 관여하는 유전자는 AATK(NM_001080395), ABCA3(NM_001089), ABHD8(NM_024527), ABR(NM_001159746), ABR(NM_001092), ACHE(NM_001282449), ACTL8(NM_030812), ADAMTS15(NM_139055), ADAMTS17(NM_139057), ADAMTS2(NM_014244), ADAMTS7(NM_014272), ADAMTSL2(NM_001145320), ADAP1(NM_001284309), ADARB2(NM_018702), ADD2(NM_001185055), ADRA1B(NM_000679), AFAP1(NM_001134647), AGRN(NM_198576), AHRR(NM_001242412), AICDA(NM_020661), AJAP1(NM_018836), AMN(NM_030943), ANKRD29(NM_173505), ANO8(NM_020959), ANO9(NM_001012302), APBA2(NM_005503), APC2(NM_005883), APCDD1(NM_153000), APCDD1L(NM_153360), APLP1(NM_005166), ARHGAP22(NM_001256025), ARHGAP23(NM_001199417), ARHGAP39(NM_025251), ARHGEF1(NM_199002), ARHGEF10(NM_014629), ARMC9(NM_001271466), ARSI(NM_001012301), ASB18(NM_212556), ASPG(NM_001080464), ASPHD2(NM_020437), ATP10A(NM_024490), ATP2A3(NM_005173), ATP2B4(NM_001001396), ATP8A2(NM_016529), B3GAT1(NM_054025), B4GALNT4(NM_178537), BAI1(NM_001702), BARX2(NM_003658), BCAN(NM_198427), BCL11B(NM_138576), BIN1(NM_139346), BMP2(NM_001200), BMPER(NM_133468), BRSK1(NM_032430), BRSK2(NM_003957), C10orf71(NM_001135196), C14orf180(NM_001286399), C19orf35(NM_198532), C1QC(NM_172369), C1QL4(NM_001008223), C1QTNF1(NM_030968), C2orf54(NM_001282921), C4orf22(NM_001206997), CACNA1A(NM_001127222), CACNA1B(NM_001243812), CACNA1C(NM_001167625), CACNA1E(NM_000721), CACNA1G(NM_198380), CACNA1H(NM_021098), CACNA1I(NM_021096), CACNG8(NM_031895), CAMK2B(NM_001220), CAMKK1(NM_172206), CAPN10(NM_023083), CAPN2(NM_001146068), CARD11(NM_032415), CASR(NM_001178065), CBFA2T3(NM_005187), CCDC102A(NM_033212), CCDC114(NM_144577), CCDC42B(NM_001144872), CCDC64B(NM_001103175), CCDC74B(NM_001258307), CDH11(NM_001797), CDH15(NM_004933), CDH22(NM_021248), CDH4(NM_001794), CDH4(NM_001252339), CDH5(NM_001795), CDHR3(NM_152750), CDK18(NM_212502), CDR2L(NM_014603), CELF4(NM_001025089), CELSR1(NM_014246), CELSR3(NM_001407), CHD5(NM_015557), CHRFAM7A(NM_148911), CHRNA3(NR_046313), CHRNA7(NR_046324), CHRNB2(NM_000748), CHST8(NM_001127896), CILP2(NM_153221), CLCA4(NM_012128), CLCN1(NR_046453), CNGA4(NM_001037329), CNPY1(NM_001103176), CNTN2(NM_005076), CNTNAP1(NM_003632), COL15A1(NM_001855), COL20A1(NM_020882), COL22A1(NM_152888), COL23A1(NM_173465), COL4A1(NM_001845), COL4A2(NM_001846), COL5A1(NM_000093), COL6A1(NM_001848), COL6A3(NM_004369), COL6A4P2(NR_027898), COMP(NM_000095), COX6B2(NM_144613), CPAMD8(NM_015692), CPLX1(NM_006651), CPXM2(NM_198148), CRB2(NM_173689), CTBP2(NM_022802), CYP2A13(NM_000766), CYP2W1(NM_017781), CYP4F22(NM_173483), CYTH2(NM_004228), DAB2IP(NM_032552), DACH1(NM_004392), DACT1(NR_046095), DAZAP1(NM_018959), DBN1(NM_080881), DENND3(NM_014957), DGKG(NM_001346), DHRS7C(NM_001105571), DLEU1(NR_109974), DLGAP1(NM_001242763), DLGAP2(NM_004745), DLL1(NM_005618), DLX1(NM_001038493), DLX5(NM_005221), DMBT1(NM_007329), DMRTA2(NM_032110), DNAH10(NM_207437), DNAH2(NM_020877), DNMT3A(NM_022552), DOK6(NM_152721), DPP6(NM_001936), DPYSL4(NM_006426), DSCAML1(NM_020693), DUOX2(NM_014080), DUSP4(NM_001394), EBF1(NM_024007), EBF3(NM_001005463), EBF4(NM_001110514), EEF1A2(NM_001958), ELANE(NM_001972), EML2(NM_001193269), EMX1(NM_004097), EN1(NM_001426), EN2(NM_001427), ENTPD8(NM_001033113), EPHA10(NM_173641), EPHA10(NM_001099439), EPHA8(NM_020526), EPHB2(NM_017449), EPHB3(NM_004443), EPS8L1(NM_017729), ESRRB(NM_004452), ESYT3(NM_031913), EVC2(NM_001166136), EVX1(NM_001989), F12(NM_000505), FAM101B(NM_182705), FAM171A2(NM_198475), FAM184B(NM_015688), FAM19A5(NM_001082967), FAM47A(NM_203408), FAM78A(NM_033387), FAM83F(NM_138435), FAM89B(NM_152832), FAM90A1(NM_018088), FAT3(NM_001008781), FBLN2(NM_001004019), FGF23(NM_020638), FHDC1(NM_033393), FHOD3(NM_001281740), FIBCD1(NM_032843), FLI1(NM_002017), FLNC(NM_001458), FLT4(NM_182925), FNDC1(NM_032532), FRAS1(NM_025074), FSCN2(NM_012418), GABRA5(NM_001165037), GABRB3(NM_001278631), GABRD(NM_000815), GALNT9(NM_021808), GALNT9(NM_001122636), GALR3(NM_003614), GATA5(NM_080473), GDF2(NM_016204), GFPT2(NM_005110), GFRA2(NM_001165039), GFRA4(NM_022139), GLB1L2(NM_138342), GLI2(NM_005270), GLI3(NM_000168), GMDS(NM_001253846), GNAL(NM_001142339), GNG7(NM_052847), GP6(NM_016363), GPR123(NM_001291085), GPR123(NM_001083909), GPSM1(NM_001145638), GRASP(NM_181711), GRID1(NM_017551), GRID2IP(NM_001145118), GRIK5(NM_002088), GRIN1(NM_000832), GRIN2C(NM_000835), GRIN2D(NM_000836), GRIN3B(NM_138690), GRM4(NM_001256813), GRM6(NM_000843), HAPLN3(NM_178232), HAPLN4(NM_023002), HAS1(NM_001523), HECW1(NM_001287059), HHIPL1(NM_032425), HK3(NM_002115), HLA-DOA(NM_002119), HLA-DQB2(NM_001198858), HOXA3(NM_153631), HOXA7(NM_006896), HOXB13(NM_006361), HOXC4(NM_014620), HOXC6(NM_153693), HOXD3(NM_006898), HPCAL4(NM_001282397), HRNR(NM_001009931), HS3ST2(NM_006043), HTRA3(NM_053044), IDUA(NM_000203), IFT140(NM_014714), IGF1R(NM_000875), IGFN1(NM_001164586), IGLON5(NM_001101372), IGSF21(NM_032880), IGSF9B(NM_001277285), IL17D(NM_138284), IL17RD(NM_017563), IL17REL(NM_001001694), ILDR2(NM_199351), IQSEC2(NM_015075), IQSEC3(NM_001170738), ISL2(NM_145805), ITGAM(NM_001145808), ITGAX(NM_001286375), ITGB4(NM_000213), ITIH5(NM_001001851), ITPKB(NM_002221), ITPR3(NM_002224), JAKMIP1(NM_144720), JAKMIP3(NM_001105521), JPH1(NM_020647), KCNAB2(NM_001199860), KCNC4(NR_036437), KCND2(NM_012281), KCNF1(NM_002236), KCNG1(NM_002237), KCNH2(NM_001204798), KCNK15(NM_022358), KCNN3(NM_170782), KCNQ1(NM_000218), KCNQ2(NM_172108), KCNQ3(NM_004519), KCNQ4(NM_172163), KCNS1(NM_002251), KCNT1(NM_020822), KHDC1(NM_001251874), KIAA1211(NM_020722), KIF26A(NM_015656), KIF26B(NM_018012), KIF5C(NM_004522), KLC3(NM_177417), KNDC1(NM_152643), KRT28(NM_181535), LAMA1(NM_005559), LAMC3(NM_006059), LEFTY1(NM_020997), LHX8(NM_001256114), LINGO1(NM_001301200), LINGO3(NM_001101391), LMTK3(NM_001080434), LMX1A(NM_001174069), LOC154449(NR_002787), LRFN2(NM_020737), LRRC4B(NM_001080457), LSP1(NM_002339), LTBP2(NM_000428), LTBP4(NM_003573), LY9(NM_001033667), LYPD3(NM_014400), LZTS1(NM_021020), MAN2B1(NM_000528), MAPK15(NM_139021), 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4 4
제1항에 있어서, 상기 간암 발생 특이적 유전자의 과메틸화는 E2A, HOXA9, MyoG, Ap4, Myf5, Hoxc9, Ascl1, GATA, IR4, Ptf1a, Pax7, HNF7 및 Atoh1으로 이루어진 군으로부터 선택되는 전사조절인자에 의해 유도되는 것인, 간암의 예측 또는 진단 방법
5 5
제1항에 있어서,상기 간암 발생 특이적 유전자의 저메틸화는 HIF-1b, c-Myc, HIF-1a, Ptf1a, SCL, n-Myc, HOXA9, HIF2a, CLOCK, BMAL1, USF1, Phox2a, NPAS2, Bcl6, Max 및 PR로 이루어진 군으로부터 선택되는 전사조절인자에 의해 유도되는 것인, 간암의 예측 또는 진단 방법
6 6
제1항에 있어서, 상기 임상 샘플은 간암 의심 환자 또는 진단 대상 유래의 조직, 세포, 혈액, 혈장, 대변 또는 소변인 것인, 간암의 예측 또는 진단 방법
7 7
제1항에 있어서, 상기 (B)단계의 메틸화 측정은 PCR, 메틸화 특이 PCR(methylation specific PCR), 실시간 메틸화 특이 PCR(real time methylation specific PCR), 메틸화 DNA 특이적 결합 단백질을 이용한 PCR, 정량 PCR, DNA 칩, 파이로시퀀싱 또는 바이설파이트 시퀀싱으로 수행되는 것인, 간암의 예측 또는 진단 방법
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1 미래창조과학부 연세대학교산학협력단 포스트게놈 다부처유전체 사업 인간유도 줄기세포 lncRNA 유전체 분석 국제 협력연구
2 미래창조과학부 연세대학교산학협력단 글로벌연구실 염증반응에서 비롯된 유전자 변화에 의한 내장암 발병/진행 과정 연구(3/3,3단계)
3 미래창조과학부 연세대학교산학협력단 바이오의료기술개발사업 조혈줄기세포유래 수지상세포 분화관련 후성유전인자 탐색 및 기능연구