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하나의 올리고뉴클레오티드를 이용해서 올리고뉴클레오티드 풀을 생산하는 방법(METHOD FOR GENERATING POOL CONTAINING OLIGONUCLEOTIDES FROM A OLIGONUCLEOTIDE)

  • 기술번호 : KST2017014773
  • 담당센터 : 서울서부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-6124-6930
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 본 발명은 하나의 올리고뉴클레오티드 및 차세대 시퀀싱(next generation sequencing, NGS)을 이용하여 다양한 염기서열 조합을 갖는 올리고뉴클레오티드의 풀(pool)을 생산하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면, 종래 비용 및 시간이 많이 소요되었던 마이크로어레이칩의 사용이 필요없고, 다양한 조합의 올리고뉴클레오티드를 얻기 위한 많은 횟수의 합성단계를 줄일 수 있어 비용 및 시간 효율적으로 올리고뉴클레오티드 풀을 생산할 수 있다. 또한, 본 발명의 방법에 의하는 경우, 올리고뉴클레오티드 풀을 생산하는 단계를 간소화 하였는바, 생산 및 활용 가능한 올리고뉴클레오티드 조합의 수를 기하급수적으로 늘릴 수 있고, 유전물질의 다양한 용도 확장을 가능하게 할 수 있다.
Int. CL C12N 15/10 (2017.03.09) C12Q 1/68 (2017.03.09) C07H 21/04 (2017.03.09) G06F 19/22 (2017.03.09)
CPC
출원번호/일자 1020170028336 (2017.03.06)
출원인 연세대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2017-0103702 (2017.09.13) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020160026299   |   2016.03.04
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2017.03.06)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서대문구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 방두희 대한민국 서울특별시 서대문구
2 황병진 대한민국 서울특별시 서대문구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인다나 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 *길 **, 신관 *층~*층, **층(역삼동, 광성빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 서울특별시 서대문구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2017.03.06 수리 (Accepted) 1-1-2017-0222420-04
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2017.11.10 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2018.01.16 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2018-0009463-19
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2018.01.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0039600-58
5 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2018.03.16 수리 (Accepted) 1-1-2018-0264030-19
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2018.04.16 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-0375269-83
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2018.04.16 수리 (Accepted) 1-1-2018-0375270-29
8 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2018.06.08 수리 (Accepted) 1-1-2018-0561024-78
9 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2018.08.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0558209-93
10 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2018.10.17 수리 (Accepted) 1-1-2018-1020540-50
11 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2018.10.17 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-1020541-06
12 등록결정서
Decision to grant
2019.02.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0133283-95
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번호 청구항
1 1
길이가 100mer 이상이며, 길이가 R mer인 랜덤 부위를 포함하는 하나의 시작 올리고뉴클레오티드로부터 복수 개의 클론 올리고뉴클레오티드를 합성하는 단계; 및 클론 올리고뉴클레오티드들 중에서 원하는 염기서열로 이루어진 랜덤 부위를 포함하는 클론 올리고뉴클레오티드를 선택하기 위해 상기에서 합성된 복수 개의 클론 올리고뉴클레오티드에 대하여 차세대 시퀀싱을 수행하여 클론 올리고뉴클레오티드 각각의 전체 염기서열을 확인하는 단계;를 포함하고, 여기에서, 상기 합성은 클론 올리고뉴클레오티드가 랜덤 부위를 포함하도록 수행되며,상기 랜덤 부위는 길이가 R mer 이고, A, T, C, G로 만들어질 수 있는 염기서열 4R 개로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 염기서열로 이루어진 것인, 복수 개의 클론 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 풀(pool)을 생산하는 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 전체 염기서열이 확인된 복수 개의 클론 올리고뉴클레오티드 중에서 원하는 염기서열로 이루어진 랜덤 부위를 포함하는 클론 올리고뉴클레오티드를 선택하는 단계;를 더 포함하는 올리고뉴클레오티드 풀(pool)을 생산하는 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 생산 방법은 합성하는 단계를 한 번만 수행하는 것이고, 상기 올리고뉴클레오티드 풀(pool)은 랜덤 부위의 염기서열이 서로 다른 클론 올리고뉴클레오티드를 2개 내지 4R 개 포함하는 것인, 올리고뉴클레오티드 풀(pool)을 생산하는 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 하나의 올리고뉴클레오티드는 양측 말단에 차세대 시퀀싱(next generation sequencing, NGS)을 위한 아답터 서열이 존재하는 아답터 부위(adaptor space)를 포함하는 것인, 올리고뉴클레오티드 풀(pool)을 생산하는 방법
5 5
삭제
6 6
제1항에 있어서, 상기 R은 2 내지 20의 정수 인, 올리고뉴클레오티드 풀(pool)을 생산하는 방법
7 7
제1항에 있어서,상기 하나의 올리고뉴클레오티드는 서열번호 1의 염기서열 또는 서열번호 2의 염기서열로 이루진 것인, 올리고뉴클레오티드 풀(pool)을 생산하는 방법
8 8
길이가 100mer 이상이며, 길이가 R mer인 랜덤 부위를 포함하는 하나의 시작 올리고뉴클레오티드로부터 복수 개의 클론 올리고뉴클레오티드를 합성하는 단계;클론 올리고뉴클레오티드들 중에서 원하는 염기서열로 이루어진 랜덤 부위를 포함하는 클론 올리고뉴클레오티드를 선택하기 위해 상기에서 합성된 복수 개의 클론 올리고뉴클레오티드에 대하여 차세대 시퀀싱을 수행하여 클론 올리고뉴클레오티드 각각의 전체 염기서열을 확인하는 단계; 상기 전체 염기서열이 확인된 각각의 클론 올리고뉴클레오티드 랜덤 부위의 염기서열을 x-y좌표 상에 입력하여 맵핑하는 단계; 및시퀀싱 플레이트로부터 저장하고자 하는 정보를 인코딩한 염기서열과 매칭되는 염기서열을 포함하는 클론 올리고뉴클레오티드를 선택하는 단계;를 포함하고, 여기에서, 상기 합성은 클론 올리고뉴클레오티드가 랜덤 부위를 포함하도록 수행되며, 상기 랜덤 부위는 길이가 R mer 이고, A, T, C, G로 만들어질 수 있는 염기서열 4R 개로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 염기서열로 이루어진 것이며, 상기 랜덤 부위의 염기서열은 위치(address) 정보를 암호화하는 위치서열 및 데이터 정보를 암호화하는 데이터서열로 이루어진, DNA에 정보를 저장하는 방법
9 9
제8항에 있어서,DNA에 저장하고자 하는 정보(대상 정보)를 A, T, C, G로 만들어 질 수 있는 염기서열로 인코딩하는 단계;를 더 포함하는 것인, DNA에 정보를 저장하는 방법
10 10
서열번호 1의 염기서열 또는 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 하나의 올리고뉴클레오티드로 복수 개의 클론 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 풀(pool)을 생산할 수 있는 올리고뉴클레오티드
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US20170253871 US 미국 FAMILY

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 US2017253871 US 미국 DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
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2 미래창조과학부 연세대학교 산학협력단 미래유망파이오니어사업 차세대 DNA 어셈블러 개발과 응용
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5 과학기술정보통신부 연세대학교 산학협력단 바이오의료기술개발사업 CRISPR 기반 유전자 진단기술 개발