1 |
1
갈색거저리 시료를 균질화하는 단계;상기 균질화된 시료를 고형분을 제거하기 위해 원심분리하는 단계;상기 원심분리된 상등액을 초여과(ultrafiltration)하여 폴리펩타이드를 수득하는 단계;상기 수득된 폴리펩타이드를 단백질 분해효소로 분해하는 단계; 및상기 분해된 폴리펩타이드를 LC-MS/MS로 분리하여 분석하는 단계를 포함하는 갈색거저리의 단백질체 분석 방법으로,상기 분리된 펩타이드 분석 결과는 다음 중에 적어도 하나를 포함하는, 갈색거저리의 단백질체 분석 방법:상기 갈색거저리의 성체, 번데기 및 애벌레의 모든 형태에서 분석된 단백질은 아르기닌 키나아제 이소폼 X1(arginine kinase isoform X1) 및 프럭토스 비스포스페이트 알도라아제 이소폼 X2(fructose-bisphosphate aldolase isoform X2)에서 선택됨;갈색거저리의 성체 및 애벌레에서 분석된 단백질은 LOC100142319(GenScript, CloneID:OTg04832), ATP 신타아제 서브유닛 알파(ATP synthase subunitalpha,mitochondrial), 시토크롬 c-2(cytochrome c-2), 트로포미오신-2 이소폼 X16(tropomyosin-2 isoform X16), 히트쇽 70kDa 프로테인 코그네이트 2(heat shock 70 kDa protein cognate 2), 아데닐레이트 키나아제 이소엔자임 1-라이크 이소폼 X2(adenylate kinase isoenzyme 1-like isoform X2), 아데닐레이트 키나아제 이소엔자임 1-라이크 이소폼 X1(adenylate kinase isoenzyme 1-like isoform X1), 및 트로포닌 C 이소폼 2(troponin C, isoform 2)에서 선택됨;상기 갈색거저리의 성체 및 번데기에서 분석된 단백질은 프럭토스 비스포스페이트 알도라아제 이소폼 X1(fructose-bisphosphate aldolase isoform X1)임
|
2 |
2
제1항에 있어서,상기 초여과하여 수득된 폴리펩타이드는 10kDa 이하의 저분자량이고,상기 단백질 분해효소는 트립신이고, 상기 LC-MS/MS 분석시 트립신으로 분해된 펩타이드는 카바아미도메틸레이션(cabamidomethylation) 및 메티오닌 산화를 참조하여 분석된 방법
|
3 |
3
제1항에 있어서,상기 분리된 펩타이드 분석 결과, 갈색거저리 유래 단백질의 개수는 펩타이드 수준(peptide level)에서 150 ~ 200개이고, 단백질 수준에서 10 ~ 25개인 방법
|
4 |
4
삭제
|
5 |
5
제1항에 있어서, 상기 분리된 펩타이드 분석 결과는 다음 중에 적어도 하나를 포함하는 방법:갈색거저리의 성체, 번데기 및 애벌레에서 분석된 단백질은 51종류임;갈색거저리의 성체, 번데기 및 애벌레의 모든 형태에서 분석된 단백질은 2종류임;갈색거저리의 성체 및 애벌레에서 분석된 단백질은 11종류임;갈색거저리의 성체 및 번데기에서 분석된 단백질은 1종류임;갈색거저리의 애벌레 및 번데기에서 분석된 단백질은 8종류임;갈색거저리의 성체에서만 분석된 단백질은 15종류임;갈색거저리의 애벌레에서만 분석된 단백질은 8종류임; 및갈색거저리의 번데기에서만 분석된 단백질은 6종류임
|
6 |
6
삭제
|
7 |
7
삭제
|
8 |
8
삭제
|
9 |
9
제1항에 있어서,상기 갈색거저리의 애벌레 및 번데기에서 분석된 단백질은 케모센서리 프로테인 11 프리커서(chemosensory protein 11 precursor), 글루타치온 S-트랜스퍼라아제(glutathione S-transferase), LOC100142328(NCBI, Gene ID:100142328), 히트쇽 프로테인 18a(heat shock protein 18a), 글루코시다제 2 서브유닛 베타(glucosidase 2 subunit beta), 케모센서리 프로테인 10 프리커서(chemosensory protein 10 precursor), 및 글루타메이트 리셉터 이오노트로픽 카이네이트 2(glutamate receptor ionotropic, kainate 2)에서 선택되는 방법
|
10 |
10
제1항에 있어서,상기 갈색거저리의 성체에서만 분석된 단백질은 액틴 릴레이트 프로테인 1(actin related protein 1), 트로포닌 I 이소폼 X11(troponin I isoform X11), 트로포닌 T 스케리탈 머슬 이소폼 X1(troponin T skeletal muscleisoformX1), 시트레이트 신타아제 2(citrate synthase 2, mitochondrial), 말레이트 디히드로게나아제(malate dehydrogenase, mitochondrial), 미토콘드리얼-프로세싱 펩티다아제 서브유닛 베타(mitochondrial-processing peptidase subunitbeta),WD 리피트-컨테이닝 프로테인 78(WD repeat-containing protein 78), 미오신 레귤러토리 라이트 체인 2(myosin regulatory light chain 2), 로-덴서티 리포프로테인 리셉터-릴레이티드 프로테인 4 이소폼 X1(low-density lipoprotein receptor-related protein 4 isoform X1), 리포프로테인 리셉터-릴레이티드 프로테인 4 이소폼 X2(protein receptor-related protein 4 isoform X2), 미오신 헤비 체인 머슬 이소폼 X4(myosin heavy chain, muscleisoformX4), Y-박스 팩터 호몰로그 이소폼 X1(Y-box factor homolog isoform X1), 및 14-3-3 프로테인 엡실론(14-3-3 protein epsilon)에서 선택되는 방법
|
11 |
11
제1항에 있어서,상기 갈색거저리 애벌레에서만 분석된 단백질은 트로포닌 T 이소폼 X2(troponin T isoform X2), 아르기닌 키나아제 이소폼 X2(arginine kinase isoform X2), 미오신 헤비 체인 머슬 이소폼 X29(myosin heavy chain, muscleisoformX29), 트로포미오신-2 이소폼 X17(tropomyosin-2, isoforms X17), 알파-케토글루타레이트-디펜던트 디옥시게아제 alkB 호몰로그 6(alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6), LOC660354(NCBI, Gene ID:660354) 및 LOC657439(NCBI, Gene ID: 657439)에서 선택되는 방법
|
12 |
12
제1항에 있어서,상기 갈색거저리의 번데기에서만 분석된 단백질은 헥사머린 3 프리커서(hexamerin 3 precursor), LOC663390 이소폼 X1(LOC663390 isoform X1), 에놀라아제-포스페이트 E1(enolase-phosphate E1), 구아닌 뉴클레오타이드-바인딩 프로테인 G 서브유닛 알파(guanine nucleotide-binding proteinG(s) subunit alpha), 안지오텐신 컨버팅 엔자임-라이크(angiotensin-converting enzyme-like) 및 아미노아실라아제-1(aminoacylase-1)에서 선택되는 방법
|
13 |
13
삭제
|
14 |
14
삭제
|
15 |
15
삭제
|
16 |
16
삭제
|
17 |
17
삭제
|
18 |
18
삭제
|
19 |
19
삭제
|
20 |
20
삭제
|
21 |
21
삭제
|
22 |
22
삭제
|