맞춤기술찾기

홈으로 가기
맞춤기술찾기
이전대상기술
프린트하기

이전대상기술

in vivo에서 RNA-가이드 뉴클레아제의 활성을 고처리량 방식으로 평가하는 방법(Method for in vivo high-throughput evaluating of RNA-guided nuclease activity)

  • 기술번호 : KST2017016995
  • 담당센터 : 서울서부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-6124-6930
상담신청 PDF 받기
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 세포에서 RNA-가이드 뉴클레아제 (RNA-guided nuclease)의 활성을 고처리량 방식 (high-throughput manner)으로 평가하는 방법에 관한 것으로, 구체적으로 가이드 RNA (guide RNA) 코딩 염기서열 및 표적 염기서열을 포함하는 분리된 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 세포 라이브러리의 인델 빈도 (indel frequency)로부터 RNA-가이드 뉴클레아제의 활성을 평가하는 방법에 관한 것이다.본 발명의 가이드 RNA-표적서열 페어 (pair) 라이브러리를 이용한 RNA-가이드 뉴클레아제의 특성을 분석하는 방법은 세포 내 (in vivo)에서 고처리량 방식 (high-throughput manner)으로 RNA-가이드 뉴클레아제의 활성을 평가할 수 있도록 하므로, RNA-가이드 뉴클레아제를 적용하는 모든 분야에서 매우 유용하게 활용될 수 있다.
Int. CL C12Q 1/68 (2018.01.01) C12Q 1/42 (2006.01.01) C12N 15/63 (2006.01.01) C12N 9/22 (2006.01.01) G16B 30/00 (2019.01.01)
CPC
출원번호/일자 1020170055655 (2017.04.28)
출원인 연세대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2017-0123581 (2017.11.08) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020160052365   |   2016.04.28
법적상태 거절
심사진행상태 보정승인간주
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호 1020190052219;
심사청구여부/일자 Y (2017.04.28)
심사청구항수 19

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서대문구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 김형범 대한민국 서울특별시 성동구
2 김희권 대한민국 충청북도 진천군
3 송명재 대한민국 서울특별시 도봉구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 특허법인 아이피에스 대한민국 서울특별시 서초구 반포대로**길 **, *층 (서초동)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
최종권리자 정보가 없습니다
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2017.04.28 수리 (Accepted) 1-1-2017-0422861-50
2 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2018.03.09 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0167670-57
3 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2018.05.09 수리 (Accepted) 1-1-2018-0455736-58
4 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2018.06.08 수리 (Accepted) 1-1-2018-0564246-11
5 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2018.07.09 수리 (Accepted) 1-1-2018-0672912-77
6 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)		 2018.08.08 수리 (Accepted) 1-1-2018-0782382-70
7 지정기간연장 관련 안내서
Notification for Extension of Designated Period		 2018.08.09 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2018-0124735-21
8 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2018.09.07 수리 (Accepted) 1-1-2018-0892986-38
9 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2018.09.07 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-0892987-84
10 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)		 2018.10.05 수리 (Accepted) 1-1-2018-0981733-60
11 거절결정서
Decision to Refuse a Patent		 2019.01.24 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0060298-89
12 [법정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
 2019.02.22 수리 (Accepted) 1-1-2019-0189100-58
13 법정기간연장승인서
 2019.02.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2019-0032251-90
14 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2019.03.22 수리 (Accepted) 1-1-2019-0299430-12
15 [명세서등 보정]보정서(재심사)
Amendment to Description, etc(Reexamination)		 2019.03.22 보정승인 (Acceptance of amendment) 1-1-2019-0299429-65
16 거절결정서
Decision to Refuse a Patent		 2019.04.08 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0252364-08
17 [분할출원]특허출원서
[Divisional Application] Patent Application		 2019.05.03 수리 (Accepted) 1-1-2019-0457350-19
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
(a) RNA-가이드 뉴클레아제 (RNA-guided nuclease)가 도입된, 가이드 RNA (guide RNA)를 코딩하는 염기서열 및 상기 가이드 RNA가 목적하는 표적 염기서열을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 세포 라이브러리로부터 수득한 DNA를 이용하여 서열분석을 수행하는 단계; 및(b) 상기 서열분석을 통해 수득한 데이터로부터 각 가이드 RNA-표적 서열 페어 (pair)의 인델 빈도 (indel frequency)를 검출하는 단계를 포함하는, RNA-가이드 뉴클레아제 (RNA-guided nuclease)의 활성을 평가하는 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 가이드 RNA는 crRNA (CRISPR RNA)를 포함하는 것인, 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 올리고뉴클레오티드는 PAM (protospacer adjacent motif) 서열을 포함하는, 방법
4 4
제1항에 있어서, 올리고뉴클레오티드는 5' 에서 3' 또는 그 역순으로, 가이드 RNA 코딩 서열, 바코드 서열, 및 표적 염기서열을 포함하는, 방법
5 5
제1항에 있어서, 올리고뉴클레오티드는 5' 에서 3' 또는 그 역순으로, 가이드 RNA 코딩 서열, 바코드 서열, PAM (protospacer adjacent motif) 서열, 및 표적 염기서열을 포함하는, 방법
6 6
제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 올리고뉴클레오티드는 직접 반복 서열, 폴리 T 서열, 바코드 서열, 불변부 서열, 프로모터 서열, 및 스캐폴드 서열로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상을 추가로 포함하는, 방법
7 7
제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 올리고뉴클레오티드는 100 내지 200 개의 염기서열로 이루어진, 방법
8 8
제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 하나의 올리고뉴클레오티드 상에 존재하는 가이드 RNA는 동일 올리고뉴클레오티드 상에 존재하는 표적 염기서열에 대해 Cis-작용 (Cis-acting)하는 가이드 RNA인, 방법
9 9
제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은(a) 가이드 RNA를 코딩하는 염기서열 및 상기 가이드 RNA가 목적하는 표적 염기서열을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 세포 라이브러리에 RNA-가이드 뉴클레아제를 도입하는 단계;(b) 상기 RNA-가이드 뉴클레아제가 도입된 세포 라이브러리로부터 수득한 DNA를 이용하여 딥 시퀀싱을 수행하는 단계; 및(c) 상기 딥 시퀀싱으로 수득한 데이터로부터 각 가이드 RNA-표적 서열 페어의 인델 빈도를 검출하는 단계를 포함하는, 방법
10 10
제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 RNA-가이드 뉴클레아제는 Cas9 단백질 또는 Cpf1 단백질인, 방법
11 11
제10항에 있어서, 상기 Cas9 단백질은 스트렙토코커스 (Streptococcus) 속, 네이세리아 (Neisseria) 속, 파스테우렐라 (Pasteurella) 속, 프란시셀라 (Francisella) 속 및 캄필로박터 (Campylobacter) 속으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 유래인, 방법
12 12
제10항에 있어서, 상기 Cpf1 단백질은 캔디다투스 파세이박터 (Candidatus Paceibacter), 라치노스피라 (Lachnospira) 속, 뷰티리비브리오 (Butyrivibrio) 속, 페레그리니박테리아 (Peregrinibacteria), 액시도미노코쿠스 (Acidominococcus) 속, 포르파이로모나스 (Porphyromonas) 속, 프레보텔라 (Prevotella) 속, 프란시셀라 (Francisella) 속, 캔디다투스 메타노플라스마 (Candidatus Methanoplasma), 또는 유박테리움 (Eubacterium) 속으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 유래인, 방법
13 13
제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 RNA-가이드 뉴클레아제의 특성은,(i) RNA-가이드 뉴클레아제의 PAM 서열,(ii) RNA-가이드 뉴클레아제의 표적 활성 (on-target activity), 또는(iii) RNA-가이드 뉴클레아제의 비표적 활성 (off-target activity)으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상을 포함하는, 방법
14 14
제1항에 있어서, 상기 서열분석은 딥 시퀀싱 (deep sequencing)으로 수행하는 것인, 방법
15 15
가이드 RNA를 코딩하는 염기서열 및 상기 가이드 RNA가 목적하는 표적 염기서열을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 세포를 2 종 이상 포함하는, 세포 라이브러리
16 16
가이드 RNA를 코딩하는 염기서열 및 상기 가이드 RNA가 목적하는 표적 염기서열을 포함하는 분리된 올리고뉴클레오티드를 포함하는 벡터
17 17
제16항에 있어서, 상기 벡터는 바이러스 벡터인, 벡터
18 18
제16항에 있어서, 상기 벡터는 렌티바이러스 벡터, 레트로바이러스 벡터 및 플라스미드 벡터로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인, 벡터
19 19
가이드 RNA를 코딩하는 염기서열 및 상기 가이드 RNA가 목적하는 표적 염기서열을 포함하는 분리된 올리고뉴클레오티드를 포함하는 벡터를 2 종 이상 포함하는 벡터 라이브러리
20 20
가이드 RNA 코딩 염기서열 및 표적 염기서열을 포함하는 분리된 올리고뉴클레오티드
21 21
제20항의 올리고뉴클레오티드를 2 종 이상 포함하는 올리고뉴클레오티드 라이브러리
22 22
(a) RNA-가이드 뉴클레아제로 타겟팅하고자 하는 표적 염기서열을 설정하는 단계; (b) 상기 설정된 표적 염기서열의 상보적 사슬과 염기쌍을 형성하는, 가이드 RNA를 코딩하는 염기 서열을 설계하는 단계; (c) 상기 표적 염기서열과 이를 목적으로 하는 가이드 RNA를 포함하는 올리고뉴클레오티드를 설계하는 단계; 및 (d) 상기 (a) 내지 (c) 단계를 1 회 이상 반복하는 단계를 포함하는 단계를 포함하는, 제20항의 올리고뉴클레오티드의 라이브러리를 구축하는 방법
23 23
제22항에 있어서, 상기 (c) 단계 혹은 (d) 단계는 추가로 설계된 올리고뉴클레오티드를 합성하는 단계를 포함하는, 방법
24 24
TTTV 혹은 CTTA인 PAM (proto-spacer-adjacent Motif) 서열에 인접한, 표적 염기서열의 상보적 사슬 (complementary strand)과 염기쌍을 형성할 수 있는 서열을 포함하는, 분리된 가이드 RNA
25 25
제24항에 있어서, 상기 분리된 가이드 RNA는 이와 함께 사용되는 RNA-가이드 뉴클레아제가 Cpf1 단백질인, 분리된 가이드 RNA
26 26
제24항 또는 제25항의 분리된 가이드 RNA, 혹은 이를 코딩하는 핵산을 포함하는, 유전체 교정을 위한 조성물
27 27
제24항 또는 제25항의 분리된 가이드 RNA, 혹은 이를 코딩하는 핵산; 및 Cpf1 단백질 혹은 이를 코딩하는 핵산을 포함하는, 포유 동물 세포에서의 유전체 교정을 위한 시스템
28 28
제24항의 가이드 RNA 혹은 이를 코딩하는 핵산; 및 Cpf1 단백질 혹은 이를 코딩하는 핵산을 순차적으로 혹은 동시에 분리된 포유동물 세포에 도입하는 단계를 포함하는, 포유동물 세포에서 Cpf1으로 유전체 교정을 하는 방법
지정국 정보가 없습니다
순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - 패밀리정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 CN109415756 CN 중국 FAMILY
2 EP03450570 EP 유럽특허청(EPO) FAMILY
3 JP31514379 JP 일본 FAMILY
4 KR1020190050956 KR 대한민국 FAMILY
5 US20190136211 US 미국 FAMILY
6 WO2017188797 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - DOCDB 패밀리 정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 CN109415756 CN 중국 DOCDBFAMILY
2 EP3450570 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
3 EP3450570 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
4 JP2019514379 JP 일본 DOCDBFAMILY
5 KR20190050956 KR 대한민국 DOCDBFAMILY
6 US2019136211 US 미국 DOCDBFAMILY
7 WO2017188797 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 미래창조과학부 연세대학교 한국연구재단-중견연구자지원사업-핵심연구 CRISPR/Cas9 유전자가위를 이용한 long intergenic noncoding RNA (linc RNA) 녹아웃 라이브러리의 제조 및 이를 이용한 lincRNA 기능 규명
2 미래창조과학부 서울대학교 산학협력단 한국연구재단-바이오.의료기술개발사업 유전자가위를 이용한 생체 외 및 생체 내 안전한 유전자 교정법 개발
3 미래창조과학부 가톨릭대학교 성의교정 한국연구재단-바이오.의료기술개발사업 미세환경을 조절하는 신물질 및 microRNA를 이용한 심장조직 재생 기술 개발
4 보건복지부 연세대학교 산학협력단 한국보건산업진흥원-세계선도의생명과학자육성사업 질환 치료를 위한 유전자 교정 기반 기술 개발
5 미래창조과학부 연세대학교 산학협력단 한국연구재단-신진연구자지원사업 상동 재조합과 유전자 가위 기술을 이용한 세포의 유전적 변환