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유전자 차별 발현 분석을 위한 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법 및 이를 기록한 기록매체(RNA-seq expression data simulation method for differential gene expression analysis, and recording medium thereof)

  • 기술번호 : KST2017018209
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 유전자 차별 발현 분석을 위한 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법에 관한 것으로서, 본 발명의 컴퓨터 장치에서 실행되는 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법에서, 유전자 샘플을 입력받는 단계 및 입력된 유전자가 차별 발현되지 않은 유전자이면, 고정된 포아송 분포(Poisson distribution)에서 상기 유전자의 발현량을 생성하는 단계를 포함한다.본 발명의 RNA-seq 유전자 발현 데이터 시뮬레이션 방법은 차별 발현 분석기법의 정확성 및 신뢰성 벤치마킹을 가능하게 한다는 효과가 있다.
Int. CL G06F 19/12 (2016.07.14) C12Q 1/68 (2016.07.14) G06F 17/16 (2016.07.14) G06F 17/18 (2016.07.14)
CPC G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01)
출원번호/일자 1020160073379 (2016.06.13)
출원인 충북대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2017-0140708 (2017.12.21) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2016.06.13)
심사청구항수 7

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 충북대학교 산학협력단 대한민국 충청북도 청주시 서원구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 류근호 대한민국 충청북도 청주시 서원구
2 박영준 대한민국 충청북도 청주시 서원구
3 류광선 대한민국 충청북도 청주시 서원구
4 박현우 대한민국 충청북도 청주시 서원구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 김정현 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 ***, *층 (역삼동, 신명빌딩)(한맥국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 충북대학교 산학협력단 충청북도 청주시 서원구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2016.06.13 수리 (Accepted) 1-1-2016-0566279-95
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2016.11.10 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2016.12.20 수리 (Accepted) 9-1-2016-0052223-36
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2017.12.01 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2017-0841864-05
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2018.01.22 수리 (Accepted) 1-1-2018-0070287-85
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2018.01.22 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-0070288-20
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2018.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2018-5086612-26
8 등록결정서
Decision to grant		 2018.06.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0425917-14
9 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2018.11.29 수리 (Accepted) 1-1-2018-1193248-34
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.07.06 수리 (Accepted) 4-1-2020-5149268-82
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
컴퓨터 장치에서 실행되는 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법에서,유전자 샘플을 입력받는 단계; 입력된 유전자가 차별 발현되지 않은 유전자이면, 고정된 포아송 분포(Poisson distribution)에서 상기 유전자의 발현량을 생성하는 단계; 및발현되지 않은 유전자 중에서 임의의 유전자를 선택하여 발현량에 0값을 부여하는 0-발현 유전자 발현량 생성 단계를 포함하는 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법
2 2
청구항 1에 있어서,입력된 유전자가 차별 발현된 유전자이면, 샘플별 또는 레플리카(replica)별로 서로 다른 포아송 분포에서 상기 유전자의 발현량을 생성하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법
3 3
청구항 1에 있어서,입력된 유전자가 공발현(co-expressed) 유전자이면, 상관 계수 행렬을 만족하는 다변량 정규분포를 이용하여 공발현 유전자 개수만큼 확률 벡터를 생성하는 단계; 및누적 분포 함수를 이용하여, 생성된 확률 벡터를 포아송 분포를 따르는 벡터들로 변환하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법
4 4
삭제
5 5
청구항 1에 있어서,차별 발현이나 공발현이 되지 않은 유전자를 임의로 선택하여, 발현량 값에 입력된 상수를 곱하여 발현량을 재생성하는 과발현(highly-expressed) 유전자 발현량 생성 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법
6 6
청구항 3에 있어서, 상기 확률 벡터를 생성하는 단계에서, 상관 계수 행렬을 만족하고, μ=0, σ=1인 다변량 정규분포를 이용하여 p 차원 확률벡터인 을 생성하고,상기 포아송 분포를 따르는 벡터들로 변환하는 단계에서, 상기 확률벡터 값 에 대하여 누적 정규 분포 함수 를 구하고, 각각의 에 대해 평균값 λi를 이용하여 포아송 역누적 확률 함수 LPi를 구하는 방식으로, 상기 확률벡터 을 포아송 분포를 따르는 벡터로 변환하는 것을 특징으로 하는 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법
7 7
청구항 6에 있어서,상기 LPi를, 의 수학식으로 나타낼 수 있는 것을 특징으로 하는 RNA-seq 발현량 데이터 시뮬레이션 방법
8 8
청구항 1 내지 청구항 3, 청구항 5 내지 청구항 7 중 어느 한 청구항의 방법을 컴퓨터로 실행시킬 수 있는 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 미래창조과학부 충북대학교 산학협력단 중견연구자지원사업 하이브리드 마커 기반 맞춤형 급성심근경색 진단 데이터 마이닝 기술
2 미래창조과학부 충북대학교 산학협력단 대학ICT연구센터육성 지원사업 스마트 공간을 위한 빅데이터 기반의 스마트 라이프 케어서비스