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유전자 발현에 기반한 조합 논리 네트워크를 생성하는 방법 및 시스템

  • 기술번호 : KST2018007459
  • 담당센터 : 인천기술혁신센터
  • 전화번호 : 032-420-3580
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 유전자 발현에 기반한 조합 논리 네트워크를 생성하는 방법 및 시스템에 관한 것이다. 본 발명에 따르면, 생물학적 네트워크 모델링에 있어서 복수 개의 시료에서 각 유전자의 발현 수준에 대한 대표값을 사용하는 대신, 모든 시료에서의 각 유전자의 발현 수준을 모두 반영하므로, 대상 경로에 대한 보다 정확한 모델링이 가능하다.
Int. CL G06F 19/12 (2011.01.01) G06F 19/28 (2011.01.01)
CPC G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01)
출원번호/일자 1020160160468 (2016.11.29)
출원인 가천대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2018-0060691 (2018.06.07) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2016.11.29)
심사청구항수 10

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 가천대학교 산학협력단 대한민국 경기도 성남시 수정구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 남승윤 대한민국 서울특별시 성북구
2 박성진 대한민국 서울특별시 구로구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인이룸리온 대한민국 서울특별시 서초구 사평대로 ***, *층 (반포동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 가천대학교 산학협력단 경기도 성남시 수정구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2016.11.29 수리 (Accepted) 1-1-2016-1170273-13
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2017.01.11 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2017.04.20 수리 (Accepted) 9-1-2017-0012986-51
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2018.06.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0415675-81
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2018.07.27 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-0747736-74
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2018.07.27 수리 (Accepted) 1-1-2018-0747735-28
7 등록결정서
Decision to grant
2018.12.11 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0852251-19
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
2 이상의 각 시료로부터 얻어진 2 이상의 유전자의 발현 수준을 나타내는 데이터로부터, 하나 이상의 입력 유전자 및 하나의 출력 유전자를 갖는 모듈을 생성하는 단계;상기 데이터 중 생성된 모듈에 속하는 유전자의 발현 수준을 이진수로 변환하여 상기 모듈에 대한 이진수 코드를 생성하는 단계로서, 상기 코드가 입력 유전자의 발현 수준에 대응하는 부분코드A 및 출력 유전자의 발현 수준에 대응하는 부분코드B로 이루어지는 것인 단계;생성된 이진수 코드 중 임의로 선택된 2종의 이진수 코드가 동일한 부분코드A 및 상이한 부분코드B를 가질 경우 그 2종의 이진수 코드를 각각 서로 다른 그룹에 위치시켜, 각 그룹에 포함된 이진수 코드가 부분코드A 및 그에 대응하는 단일의 부분코드B로 이루어지도록 하는, 이진수 코드의 그룹화 단계; 및상기 그룹 중 일부 또는 전부에 대하여 각각 논리 회로(logic circuit)를 생성하는 단계를 포함하는, 유전자 발현에 기반한 조합 논리 네트워크를 생성하는 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 모듈 생성 단계가 문헌, 실험 측정치, 전사체 데이터베이스, 생물학적 경로 데이터베이스, 유전자 세트 분석 도구, 또는 그의 조합을 고려하여 모듈을 생성하는 것인 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 이진수 변환 단계가 유전자 발현 수준을 변환 함수(transfer function)를 통해 이진수로 변환하는 것인 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 각 그룹에 대하여 조건부 확률에 기반한 점수를 계산하는 단계를 더 포함하는 것인 방법
5 5
제4항에 있어서, 상기 점수가 하기 수학식에 의해 계산되는 것인 방법:상기 수학식에서,은 모듈의 출력 부분의 유전자 발현 이진값이고,은 모듈의 입력 부분의 하나 이상의 유전자 발현의 이진값 서열이며, 은 특정 입력 서열의 조건 하에 특정 출력값의 확률이고,은 각 그룹에서 관찰되는 회수이다
6 6
제1항에 있어서, 상기 시료가 위암 환자로부터 수득된 것인 방법
7 7
2 이상의 각 시료로부터 얻어진 2 이상의 유전자의 발현 수준을 나타내는 데이터로부터, 하나 이상의 입력 유전자 및 하나의 출력 유전자를 갖는 모듈을 생성하는 모듈 생성부;상기 데이터 중 생성된 모듈에 속하는 유전자의 발현 수준을 이진수로 변환하여 상기 모듈에 대한 이진수 코드를 생성하는 이진수 변환부로서, 상기 코드가 입력 유전자의 발현 수준에 대응하는 부분코드A 및 출력 유전자의 발현 수준에 대응하는 부분코드B로 이루어지는 것인 이진수 변환부;생성된 이진수 코드 중 임의로 선택된 2종의 이진수 코드가 동일한 부분코드A 및 상이한 부분코드B를 가질 경우 그 2종의 이진수 코드를 각각 서로 다른 그룹에 위치시켜, 각 그룹에 포함된 이진수 코드가 부분코드A 및 그에 대응하는 단일의 부분코드B로 이루어지도록 하는, 그룹 생성부; 및상기 그룹 중 일부 또는 전부에 대하여 각각 논리 회로를 생성하는 논리 회로 생성부를 포함하는, 유전자 발현에 기반한 조합 논리 네트워크 생성 시스템
8 8
제7항에 있어서, 상기 모듈 생성부가 문헌, 실험 측정치, 전사체 데이터베이스, 생물학적 경로 데이터베이스, 유전자 세트 분석 도구, 또는 그의 조합을 고려하여 모듈을 생성하는 것인 시스템
9 9
제7항에 있어서, 상기 이진수 변환부가 유전자 발현 수준을 변환 함수를 통해 이진수로 변환하는 것인 시스템
10 10
제7항에 있어서, 생성된 각 그룹에 대하여 조건부 확률에 기반한 점수를 계산하는 점수 계산부를 더 포함하는 것인 시스템
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.