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유방암 분자아형 분류방법 및 이를 이용한 유방암 분자아형 분류 디바이스

  • 기술번호 : KST2018008464
  • 담당센터 : 서울서부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-6124-6930
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 종양세포에서 측정된 차별 발현 유전자 세트의 발현수준을 획득하는 단계, 차별 발현 유전자 세트에 대한 파라미터를 갖는 분류모델에 획득한 상기 차별 발현 유전자 세트에 대한 발현수준을 입력하는 단계, 종양세포에 대한 유방암 분자아형을 결정하는 단계 및 결정된 유방암 분자아형을 제공하는 단계를 포함하는 유방암 분자아형 분류방법을 제공한다.
Int. CL C12Q 1/68 (2018.01.01) G06F 19/20 (2011.01.01)
CPC C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01)
출원번호/일자 1020160170132 (2016.12.14)
출원인 연세대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2018-0068444 (2018.06.22) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호 1020180070882;
심사청구여부/일자 Y (2016.12.14)
심사청구항수 15

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서대문구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김상우 대한민국 서울특별시 마포구
2 백순명 미국 서울특별시 마포구
3 서미경 대한민국 서울특별시 서대문구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인인벤싱크 대한민국 서울특별시 강남구 언주로 ***, *층 (역삼동, 아레나빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 (주) 노보믹스 서울특별시 영등포구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2016.12.14 수리 (Accepted) 1-1-2016-1224778-68
2 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2017.09.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2017-0652637-69
3 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2017.09.22 수리 (Accepted) 1-1-2017-0927485-41
4 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2017.11.17 수리 (Accepted) 1-1-2017-1143236-46
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2017.12.18 수리 (Accepted) 1-1-2017-1258034-94
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2017.12.18 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2017-1258048-22
7 등록결정서
Decision to grant
2018.04.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0284143-74
8 [분할출원]특허출원서
[Divisional Application] Patent Application
2018.06.20 수리 (Accepted) 1-1-2018-0606247-31
9 [분할출원]특허출원서
[Divisional Application] Patent Application
2018.06.20 취하 (Withdrawal) 1-1-2018-0606168-22
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번호 청구항
1 1
기저형 (basal type), 루미널 A형 (luminal A type), 루미널 B형 (luminal B type), 정상-유사형, 정상형 및 HER2형의 분자아형을 갖는 종양세포 각각에 대해 측정된, 복수의 유방암과 연관된 유전자의 발현수준을 획득하는 단계;상기 종양세포 중에서 선택된 두 개의 분자아형의 종양세포 각각에 대한 상기 복수의 유방암과 연관된 유전자의 발현수준의 차이를 산출하는 단계;상기 복수의 유방암과 연관된 유전자 중 상기 분자아형에 따라 유전자간의 발현수준의 차이가 상대적으로 큰 적어도 하나의 유방암과 연관된 유전자를 차별 발현 유전자 세트로 결정하는 단계;상기 차별 발현 유전자 세트의 발현수준을 기초로 정의되는 [수학식 1]의 발현비율값으로 구성된 메트릭스를 분류모델로 정의하고, 기계학습을 수행하는 단계;[수학식 1](여기서, ei는 밑이 2인 로그에 상기 차별 발현 i유전자의 발현값을 취한 로그값이고, ej는 밑이 2인 로그에 상기 차별 발현 i유전자와 상이한 차별 발현 j유전자의 발현값을 취한 로그값이다
2 2
제1항에 있어서,상기 발현수준은 RNA 시퀀싱 (RNA sequencing) 을 이용하여 상기 종양세포에서 측정된 제1 유전자 세트 및 제2 유전자 세트의 발현수준 또는 마이크로어레이 (microarray) 를 이용하여 상기 종양세포에서 측정된 상기 제1 유전자 세트 및 제3 유전자 세트의 발현수준이고,상기 제1 유전자 세트는 ESR1, PGR, ERBB2 및 MKI67 유전자를 포함하고,상기 제2 유전자 세트 및 상기 제3 유전자 세트는 서로 상이한, 유방암 분자아형 분류방법
3 3
제2항에 있어서,상기 RNA 시퀀싱을 이용하는 경우, 상기 제2 유전자 세트는 FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, GRB7, BCL2, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1, KRT14, MELK, KRT5, MIA, KIF2C, EGFR, NAT1 및 ANLN 유전자로 이루어진 그룹으로부터 선택된 적어도 하나의 유전자를 포함하는, 유방암 분자아형 분류방법
4 4
제3항에 있어서,상기 제2 유전자 세트는, FOXC1 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2 및 KRT17 유전자 또는, FOXA1 및 SFRP1 유전자 또는, MLPH, FGFR4, MYBL2 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXC1, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2 및 KRT14 유전자 또는, KRT17, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, KRT17, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2 및 KRT14 유전자 또는, MLPH, FGFR4, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, GRB7, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, GRB7, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, MLPH, FGFR4, CEP55 및 KRT17 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, GRB7, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1, MELK, KRT5 및 KRT14 유전자 또는, BLC2, MIA, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, GRB7, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1, MELK, KRT5 및 KRT14 유전자 또는, KIF2C, EGFR, NAT1, ANLN, BLC2, MIA, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, GRB7, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1, MELK, KRT5 및 KRT14 유전자를 포함하는, 유방암 분자아형 분류방법
5 5
제2항에 있어서,상기 마이크로어레이를 이용하는 경우, 상기 제3 유전자 세트는 FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14, BLVRA, BCL2, UBE2C, KRT17, CCNB1, NAT1, SLC39A6, CDC20, KRT5 및 CCNE1 유전자로 이루어진 그룹으로부터 선택된 적어도 하나의 유전자를 포함하는, 유방암 분자아형 분류방법
6 6
제5항에 있어서,상기 제3 유전자 세트는, FOXC1 및 CEP55 유전자 또는, FOXC1, MELK 및 CEP55 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, GRB7, CEP55, BIRC5, MELK 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, CEP55, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, CEP55, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FGFR4, CEP55, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, FGFR4, CEP55, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FGFR4, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, FGFR4, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, CEP55, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOX1C, CEP55, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, GRB7, CEP55, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, GRB7, CEP55, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, CEP55, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FGFR4, FOXA1, FOXC1, CEP55, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FGFR4, FOXA1, BIRC5, CEP55, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FGFR4, FOXA1, BIRC5, CEP55, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, FGFR4, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FGFR4, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FGFR4, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, GRB7, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1 및 ANLN 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA 및 BAG1 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14 및 BLVRA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14, BLVRA, BCL2, UBE2C, KRT17 및 CCNB1 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14 및 BLVRA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14, BLVRA, BCL2, UBE2C, KRT17, CCNB1, NAT1, SLC39A6, CDC20, KRT5 및 CCNE1 유전자를 포함하는, 유방암 분자아형 분류방법
7 7
삭제
8 8
삭제
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제1항에 있어서,상기 분류모델은, 상기 dij 값을 하기 [수학식 2]로 보정하여 산출한, 상기 차별 발현 유전자 세트에서 선택된 두 개의 상기 차별 발현 유전자에 대한 발현비율값으로 구성된 메트릭스에 의해 정의되는, 유방암 분자아형 분류방법
10 10
제1항에 있어서,상기 유방암의 분자아형은, 기저형, 루미널 A형, 루미널 B형, 정상-유사형, 정상형 및 HER2형으로 이루어진 그룹으로부터 선택된 적어도 하나를 포함하는, 유방암 분자아형 분류방법
11 11
통신부와 동작 가능하게 연결된 프로세서를 포함하고,상기 프로세서는,기저형, 루미널 A형, 루미널 B형, 정상-유사형, 정상형 및 HER2형의 분자아형을 갖는 종양세포 각각에 대해 측정된, 복수의 유방암과 연관된 유전자의 발현수준을 획득하고,상기 종양세포 중에서 선택된 두 개의 분자아형의 종양세포 각각에 대한 상기 복수의 유방암과 연관된 유전자의 발현수준의 차이를 산출하고,상기 복수의 유방암과 연관된 유전자 중 상기 분자아형에 따라 유전자간의 발현수준의 차이가 상대적으로 큰 적어도 하나의 유방암과 연관된 유전자를 차별 발현 유전자 세트로 결정하고, 상기 차별 발현 유전자 세트의 발현수준을 기초로 정의되는 [수학식 1]의 발현비율값으로 구성된 메트릭스를 분류모델로 정의하고, 기계학습을 수행하고,[수학식 1](여기서, ei는 밑이 2인 로그에 상기 차별 발현 i유전자의 발현값을 취한 로그값이고, ej는 밑이 2인 로그에 상기 차별 발현 i유전자와 상이한 차별 발현 j유전자의 발현값을 취한 로그값이다
12 12
제11항에 있어서,상기 발현수준은 RNA 시퀀싱을 이용하여 상기 종양세포에서 측정된 제1 유전자 세트 및 제2 유전자 세트의 발현수준 또는 마이크로어레이를 이용하여 상기 종양세포에서 측정된 상기 제1 유전자 세트 및 제3 유전자 세트의 발현수준이고,상기 제1 유전자 세트는 ESR1, PGR, ERBB2 및 MKI67 유전자를 포함하고,상기 제2 유전자 세트 및 상기 제3 유전자 세트는 서로 상이한, 유방암 분자아형 분류 디바이스
13 13
제12항에 있어서,상기 RNA 시퀀싱을 이용하는 경우, 상기 제2 유전자 세트는 FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, GRB7, BCL2, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1, KRT14, MELK, KRT5, MIA, KIF2C, EGFR, NAT1 및 ANLN 유전자로 이루어진 그룹으로부터 선택된 적어도 하나의 유전자를 포함하는, 유방암 분자아형 분류 디바이스
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제13항에 있어서,상기 제2 유전자 세트는, FOXC1 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2 및 KRT17 유전자 또는, FOXA1 및 SFRP1 유전자 또는, MLPH, FGFR4, MYBL2 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXC1, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, KRT17 및 SFRP1 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2 및 KRT14 유전자 또는, KRT17, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, KRT17, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2 및 KRT14 유전자 또는, MLPH, FGFR4, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, GRB7, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, FOXA1, FOXC1, MLPH, FGFR4, BCL2, CEP55, MYBL2, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, GRB7, BCL2, FOXA1, MLPH, FGFR4, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1 및 KRT14 유전자 또는, MLPH, FGFR4, CEP55 및 KRT17 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, GRB7, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1, MELK, KRT5 및 KRT14 유전자 또는, BLC2, MIA, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, GRB7, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1, MELK, KRT5 및 KRT14 유전자 또는, KIF2C, EGFR, NAT1, ANLN, BLC2, MIA, FOXC1, FOXA1, MLPH, FGFR4, GRB7, CEP55, MYBL2, KRT17, SFRP1, MELK, KRT5 및 KRT14 유전자를 포함하는, 유방암 분자아형 분류 디바이스
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제12항에 있어서,상기 마이크로어레이를 이용하는 경우, 상기 제3 유전자 세트는 FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14, BLVRA, BCL2, UBE2C, KRT17, CCNB1, NAT1, SLC39A6, CDC20, KRT5 및 CCNE1 유전자로 이루어진 그룹으로부터 선택된 적어도 하나의 유전자를 포함하는, 유방암 분자아형 분류 디바이스
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제15항에 있어서, 상기 제3 유전자 세트는, FOXC1 및 CEP55 유전자 또는, FOXC1, MELK 및 CEP55 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, GRB7, CEP55, BIRC5, MELK 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, CEP55, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, CEP55, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FGFR4, CEP55, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, FGFR4, CEP55, FOXA1, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FGFR4, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, FGFR4, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, CEP55, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOX1C, CEP55, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, GRB7, CEP55, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXC1, GRB7, CEP55, FOXA1, FGFR4, BIRC5, MELK, SFRP1 및 MIA 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, CEP55, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FGFR4, FOXA1, FOXC1, CEP55, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FGFR4, FOXA1, BIRC5, CEP55, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FGFR4, FOXA1, BIRC5, CEP55, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FOXC1, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, FGFR4, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FGFR4, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FGFR4, FOXA1, GRB7, CEP55, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, GRB7, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXC1, GRB7, FOXA1, FGFR4, CEP55, BIRC5, MELK, SFRP1, MIA 및 KRT14 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1 및 ANLN 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA 및 BAG1 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14 및 BLVRA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14, BLVRA, BCL2, UBE2C, KRT17 및 CCNB1 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14 및 BLVRA 유전자 또는, FOXA1, FGFR4, CEP55, SFRP1, ANLN, FOXC1, GRB7, BIRC5, MIA, BAG1, MLPH, MELK, KRT14, BLVRA, BCL2, UBE2C, KRT17, CCNB1, NAT1, SLC39A6, CDC20, KRT5 및 CCNE1 유전자를 포함하는, 유방암 분자아형 분류 디바이스
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삭제
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제11항에 있어서,상기 분류모델은, 상기 dij 값을 하기 [수학식 2]로 보정하여 산출한, 상기 차별 발현 유전자 세트에서 선택된 두 개의 상기 차별 발현 유전자에 대한 발현비율값으로 구성된 메트릭스에 의해 정의되는, 유방암 분자아형 분류 디바이스
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 보건복지부 연세대학교 세브란스병원 연구중심병원 육성R&D 글로벌 의료수요 해결을 위한 전략적 기술통합의 개방형 연구 비즈니스 플랫폼 구축
2 보건복지부 연세대학교 산학협력단 포스트게놈 다부처 유전체사업 차세대 염기서열 분석법을 이용한 뇌전증 유발 뇌기형 원인 체성 돌연변이 발굴 및 유전자 진단 기술 개발