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컴퓨팅 장치로 구현되는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법으로서,의생명 문헌데이터로부터 약-유전자(D-G)관련성데이터 혹은 질병-유전자(P-G)관련성데이터를 도출하는 DGP관련성도출단계; 및상기 약-유전자(D-G)관련성데이터 및 질병-유전자(P-G)관련성데이터로부터 타겟약-타겟질병(D-P)관련데이터를 도출하는 DP관련성도출단계를 포함하고,상기 약-유전자(D-G)관련성데이터는 1 이상의 약, 1 이상의 유전자, 특정 약과 특정 유전자의 억제(down-regulation) 혹은 활성화(up-regulation) 되는지 여부에 대한 유전자조절점수를 포함하고,상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터는 1 이상의 질병, 1 이상의 유전자, 특정 질병과 특정 유전자의 억제(down-regulation) 혹은 활성화(up-regulation) 되는지 여부에 대한 유전자조절점수를 포함하고,상기 DP관련성도출단계는,관련성을 도출할 타겟약 및 타겟질병을 결정하는 타겟결정단계;상기 타겟약에 대한 상기 약-유전자(D-G)관련성데이터에서의 유전자 및 상기 타겟질병에 대한 상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터에서의 유전자에서 중복유전자를 도출하는 중복유전자 판별단계;상기 타겟약에 대한 상기 약-유전자(D-G)관련성데이터에서의 상기 중복유전자의 유전자조절점수의 부호 및 상기 타겟질병에 대한 상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터에서의 상기 중복유전자의 유전자조절점수의 부호를 비교하는 중복유전자GRS부호비교단계; 및상기 중복유전자GRS부호비교단계에서의 부호비교결과에 따라서 타겟약-타겟질병의 치유가능성을 계산하는 치유가능성 계산단계를 포함하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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청구항 1에 있어서,상기 DGP관련성도출단계는, 상기 의생명 문헌데이터로부터 텍스트를 로드하는 텍스트로드단계;로드된 상기 텍스트로부터 기설정된 규칙에 따라 분석대상텍스트를 추출하는 문장추출단계;상기 분석대상텍스트가 약, 유전자, 및 질병 중 2 이상을 포함하고 있는 지 여부를 판별하는 문장판별단계;상기 분석대상텍스트에서 약, 유전자, 및 질병 중 2 이상의 대상의 관계와 관련된 유효단어를 추출하는 유효단어추출단계; 및상기 유효단어로부터 약, 유전자, 및 질병 중 2 이상의 대상의 관계를 도출하는 제1 GRS계산단계;를 포함하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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청구항 2에 있어서,상기 문장추출단계는,로드된 상기 텍스트로부터 구(phrase) 혹은 절(clause) 단위로 2 이상의 단어를 추출하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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청구항 2에 있어서,상기 문장판별단계는,상기 분석대상텍스트에 약 및 유전자의 기재 혹은 질병 및 유전자의 기재가 있는지 여부를 판별하는 동시사용문장추출단계를 포함하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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청구항 4에 있어서,상기 문장판별단계는,상기 분석대상텍스트에 부정문(not)과 관련된 표현이 있는지 여부를 판별하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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청구항 4에 있어서,상기 유효단어추출단계는,상기 분석대상텍스트로부터 동사, 및 명사를 포함하는 2이상의 유효단어를 포함하는 유효단어그룹을 추출하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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청구항 6에 있어서,상기 제1 GRS계산단계는,상기 유효단어그룹의 유효단어에 대해 기설정된 억제의미의 생물학용어에 해당하는지 여부를 판별하는 단계;상기 유효단어그룹의 요소가 기설정된 억제의미의 생물학용어에 해당하는 경우에는, 상기 유효단어그룹의 요소에 대해 제1 파라미터값을 부여하는 단계;상기 유효단어그룹의 요소가 기설정된 억제의미의 생물학용어에 해당하지 않는 경우에는, 상기 유효단어그룹의 요소에 대해 제2 파라미터값을 부여하는 단계; 및상기 유효단어그룹의 유효단어에 부여된 파라미터값에 기초하여, 약 및 유전자 혹은 질병 및 유전자에 대한 유전자조절점수(GRS)를 계산하는 GRS도출단계를 포함하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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8
청구항 7에 있어서,상기 제1 파라미터값 및 상기 제2 파라미터값은 부호가 상이한 숫자값에 해당하고,상기 GRS도출단계는 상기 유효단어그룹의 유효단어에 부여된 2 이상의 파라미터값을 곱하여 상기 유전자조절점수를 계산하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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9
청구항 7에 있어서,상기 제1 GRS계산단계에서 동일한 약 및 유전자에 대해 2 이상의 유전자조절점수가 도출되는 경우에, 상기 2 이상의 유전자조절점수로부터 유전자조절점수합(GRSsum)을 유전자조절점수로 업데이트하는 제2 GRS계산단계를 더 포함하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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청구항 1에 있어서,상기 치유가능성계산단계는,상기 타겟약의 중복유전자의 유전자조절점수와 상기 타겟질병의 중복유전자의 유전자조절점수의 부호가 상이한 경우의 개수 및 상기 타겟약의 중복유전자의 유전자조절점수와 상기 타겟질병의 중복유전자의 유전자조절점수의 부호가 동일한 경우의 개수에 기초하여 치유가능성값(T(D,P))을 계산하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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청구항 11에 있어서,상기 타겟약의 중복유전자의 유전자조절점수와 상기 타겟질병의 중복유전자의 유전자조절점수의 부호가 상이한 경우의 개수가 많을수록, 상기 치유가능성값은 증가하고,상기 타겟약의 중복유전자의 유전자조절점수와 상기 타겟질병의 중복유전자의 유전자조절점수의 부호가 동일한 경우의 개수가 많을수록 상기 치유가능성값은 감소하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 방법
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13
청구항 11에 있어서,상기 치유가능성값(T(D,P))은 의 수식에 의하여 도출되고,t 는 상기 타겟약의 중복유전자의 유전자조절점수와 상기 타겟질병의 중복유전자의 유전자조절점수의 부호가 상이한 경우의 개수이고,u 는 상기 타겟약의 중복유전자의 유전자조절점수와 상기 타겟질병의 중복유전자의 유전자조절점수의 부호가 동일한 경우의 개수이고,d는 상기 타겟약과 관련된 유전자의 개수이고,p는 상기 타겟질병과 관련된 유전자 개수인, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출방법
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컴퓨터-판독가능 매체로서,상기 컴퓨터-판독가능 매체는, 컴퓨팅 장치로 하여금 이하의 단계들을 수행하도록 하는 명령들을 저장하며, 상기 단계들은:의생명 문헌데이터로부터 약-유전자(D-G)관련성데이터 혹은 질병-유전자(P-G)관련성데이터를 도출하는 DGP관련성도출단계; 및상기 약-유전자(D-G)관련성데이터 및 질병-유전자(P-G)관련성데이터로부터 타겟약-타겟질병(D-P) 관련데이터를 도출하는 DP관련성도출단계를 포함하고,상기 약-유전자(D-G)관련성데이터는 1 이상의 약, 1 이상의 유전자, 특정 약과 특정 유전자의 억제(down-regulation) 혹은 활성화(up-regulation) 되는지 여부에 대한 유전자조절점수를 포함하고,상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터는 1 이상의 질병, 1 이상의 유전자, 특정 질병과 특정 유전자의 억제(down-regulation) 혹은 활성화(up-regulation) 되는지 여부에 대한 유전자조절점수를 포함하고,상기 DP관련성도출단계는,관련성을 도출할 타겟약 및 타겟질병을 결정하는 타겟결정단계;상기 타겟약에 대한 상기 약-유전자(D-G)관련성데이터에서의 유전자 및 상기 타겟질병에 대한 상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터에서의 유전자에서 중복유전자를 도출하는 중복유전자 판별단계;상기 타겟약에 대한 상기 약-유전자(D-G)관련성데이터에서의 상기 중복유전자의 유전자조절점수의 부호 및 상기 타겟질병에 대한 상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터에서의 상기 중복유전자의 유전자조절점수의 부호를 비교하는 중복유전자GRS부호비교단계; 및상기 중복유전자GRS부호비교단계에서의 부호비교결과에 따라서 타겟약-타겟질병의 치유가능성을 계산하는 치유가능성 계산단계를 포함하는, 컴퓨터-판독가능 매체
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1 이상의 프로세서 및 1 이상의 메모리를 포함하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 장치로서,의생명 문헌데이터로부터 약-유전자(D-G)관련성데이터 혹은 질병-유전자(P-G)관련성데이터를 도출하는 DGP관련성도출부; 및상기 약-유전자(D-G)관련성데이터 및 질병-유전자(P-G)관련성데이터로부터 타겟약-타겟질병(D-P)관련데이터를 도출하는 DP관련성도출부를 포함하고,상기 약-유전자(D-G)관련성데이터는 1 이상의 약, 1 이상의 유전자, 특정 약과 특정 유전자의 억제(down-regulation) 혹은 활성화(up-regulation) 되는지 여부에 대한 유전자조절점수를 포함하고,상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터는 1 이상의 질병, 1 이상의 유전자, 특정 질병과 특정 유전자의 억제(down-regulation) 혹은 활성화(up-regulation) 되는지 여부에 대한 유전자조절점수를 포함하고,상기 DP관련성도출부는,관련성을 도출할 타겟약 및 타겟질병을 결정하는 타겟결정부;상기 타겟약에 대한 상기 약-유전자(D-G)관련성데이터에서의 유전자 및 상기 타겟질병에 대한 상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터에서의 유전자에서 중복유전자를 도출하는 중복유전자 판별부;상기 타겟약에 대한 상기 약-유전자(D-G)관련성데이터에서의 상기 중복유전자의 유전자조절점수의 부호 및 상기 타겟질병에 대한 상기 질병-유전자(P-G)관련성데이터에서의 상기 중복유전자의 유전자조절점수의 부호를 비교하는 중복유전자GRS부호비교부; 및상기 중복유전자GRS부호비교부에서의 부호비교결과에 따라서 타겟약-타겟질병의 치유가능성을 계산하는 치유가능성 계산부를 포함하는, 의생명 문헌데이터를 기반으로 한 약효능 도출 장치
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