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GEO에 공개된 차세대 염기서열 데이터를 이용한 유전체 분석 방법

  • 기술번호 : KST2019006438
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 차세대 염기서열 데이터를 이용한 유전체 분석 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면, 유전체 분석 장치를 이용한 유전체 분석 방법에 있어서, 유전체 분석 방법은 사용자로부터 입력된 고유번호에 대응하는 압축 유전체 데이터를 수신하는 단계, 상기 압축 유전체 데이터를 이용하여 염기서열 분석 데이터를 생성한 후, 상기 염기서열 분석 데이터의 라이브러리 형식(library)에 따라 기 설정된 조건에 매칭되는 일부 데이터를 제거하여 전처리 유전체 데이터를 생성하는 단계, 상기 전처리 유전체 데이터에 대응하는 기 저장된 데이터 분석 기법을 선택하는 단계, 그리고 상기 선택된 데이터 분석 기법에 따라 상기 전처리 유전체 데이터를 분석하는 단계를 포함한다. 이와 같이 본 발명에 따르면, 일반 연구자가 쉽고 간편하게 사용 가능한 자동화 파이프 라인 개발을 통해 생명현상 연구에 어려움을 해소하고 차세대 염기서열을 쉽고 빠르게 분석함으로써 독자적인 분석 시스템을 구축할 뿐만 아니라 기존의 유전체 진단 연구 효율이 증가시킬 수 있다.
Int. CL G16B 30/00 (2019.01.01) G16B 40/00 (2019.01.01) C12Q 1/68 (2018.01.01)
CPC G16B 30/00(2013.01) G16B 30/00(2013.01) G16B 30/00(2013.01)
출원번호/일자 1020170160479 (2017.11.28)
출원인 단국대학교 천안캠퍼스 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2019-0061771 (2019.06.05) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 거절
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2018.08.07)
심사청구항수 1

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 단국대학교 천안캠퍼스 산학협력단 대한민국 충청남도 천안시 동남구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 강근수 충청남도 천안시 서북구
2 한규동 충청남도 천안시 동남구
3 문세영 충청남도 천안시 서북구
4 손근홍 서울특별시 강서구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인태백 대한민국 서울 금천구 가산디지털*로 *** 이노플렉스 *차 ***호

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2017.11.28 수리 (Accepted) 1-1-2017-1185359-26
2 [심사청구]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2018.08.07 수리 (Accepted) 1-1-2018-0778630-59
3 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2020.04.21 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2020-0281573-26
4 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2020.06.11 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2020-0602437-75
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
 2020.06.11 수리 (Accepted) 1-1-2020-0602438-10
6 거절결정서
Decision to Refuse a Patent		 2020.08.05 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2020-0535816-62
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
 2020.08.31 수리 (Accepted) 1-1-2020-0913754-49
8 [명세서등 보정]보정서(재심사)
Amendment to Description, etc(Reexamination)		 2020.08.31 보정승인 (Acceptance of amendment) 1-1-2020-0913753-04
9 거절결정서
Decision to Refuse a Patent		 2020.09.14 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2020-0632147-23
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번호 청구항
1 1
유전체 분석 장치를 이용한 유전체 분석 방법에 있어서, 사용자로부터 입력된 고유번호에 대응하는 압축 유전체 데이터를 수신하는 단계, 상기 압축 유전체 데이터를 이용하여 염기서열 분석 데이터를 생성한 후, 상기 염기서열 분석 데이터의 라이브러리 형식(library)에 따라 기 설정된 조건에 매칭되는 일부 데이터를 제거하여 전처리 유전체 데이터를 생성하는 단계, 상기 전처리 유전체 데이터에 대응하는 기 저장된 데이터 분석 기법을 선택하는 단계, 그리고 상기 선택된 데이터 분석 기법에 따라 상기 전처리 유전체 데이터를 분석하는 단계를 포함하는 유전체 분석 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 전처리 유전체 데이터를 생성하는 단계는, 상기 압축 유전체 데이터를 압축 해제하여 복수의 반복실험 데이터를 생성하는 단계, 상기 복수의 반복실험 데이터를 병합하여 하나의 염기서열 분석 데이터를 생성하는 단계, 상기 염기서열 분석 데이터의 라이브러리 형식을 검출하는 단계, 그리고 상기 검출된 라이브러리 형식 중 기 설정된 라이브러리 형식에 대응하는 신뢰성 판단 알고리즘을 통해 상기 염기서열 분석 데이터 중 기 설정된 신뢰도보다 낮은 데이터를 삭제하여 전처리 유전체 데이터를 생성하는 단계를 포함하는 유전체 분석 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 압축 유전체 데이터를 수신하는 단계는, 사용자로부터 입력된 개인 염기서열 분석 데이터를 더 수신하며 상기 전처리 유전체 데이터를 생성하는 단계는, 상기 개인 염기서열 분석 데이터를 수신하는 경우, 상기 개인 염기서열 분석 데이터를 라이브러리 형식에 따라 기 설정된 조건에 매칭되는 데이터를 일부 제거하여 전처리 유전체 데이터를 생성하는 유전체 분석 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 데이터 타입은, DNA, RNA 및 CHIP 중 적어도 하나를 포함하고, 상기 데이터 분석 기법은, SNP calling 분석 기법, RNA-seq 분석 기법 및 ChIP-seq 분석 기법 중 적어도 하나를 포함하는 유전체 분석 방법
5 5
제1항에 있어서, 상기 데이터 분석 기법을 선택하는 단계는, 상기 전처리 유전체 데이터의 데이터 타입을 검출하는 단계, 그리고 상기 검출된 데이터 타입에 매칭되는 데이터 분석 기법을 선택하는 단계를 포함하며, 상기 데이터 타입이 DNA이면 SNP calling 분석 기법을 선택하고, RNA이면 RNA-seq 분석 기법을 선택하며, CHIP이면 ChIP-seq 분석 기법을 선택하는 유전체 분석 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 과학기술정보통신부 단국대학교 천안캠퍼스 산학협력단 바이오의료기술개발사업 비교의학적 다중오믹스 정보분석 기술 개발