맞춤기술찾기

홈으로 가기
맞춤기술찾기
이전대상기술
프린트하기

이전대상기술

물 분자 네트워크 분석 방법

  • 기술번호 : KST2019012532
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
상담신청 PDF 받기
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 물 분자 네트워크 분석 방법에 관한 것으로서, 분자동역학(Molecular Dynamics, MD) 모의실험 소프트웨어 패키지를 실행하여 분석 결과를 제공하는 분석 서버 및 분자동역학 모의 실험에 필요한 데이터를 관리하는 데이터베이스를 포함하는 물 분자 네트워크 분석 시스템에 의해 수행되는 물 분자 네트워크 분석 방법에 있어서, 웹 기반의 플랫폼 UI(User Interface)를 통해 명령어를 입력하여 상기 분자동역학 모의실험을 실행하는 제1 단계; 분자동역학 모의실험이 수행된 PDB(Protein Data Bank)의 단백질 구조 파일(trajectory file)로부터 물 분자를 가져오는 제2 단계; 상기 물 분자들 중 기준 물 분자를 중심으로 주변 물 분자들 사이의 에너지 관계를 토대로 고리 구조(Water ring)의 물 분자 네트워크를 분석하는 제3 단계; 기설정된 크기의 물 분자 고리마다 서브 PDB 파일을 각각 생성하는 제4 단계; 상기 서브 PDB 파일과 단백질 파일을 궤적별로 합산하여 출력 파일을 생성하는 제5 단계; 및 상기 궤적별로 고리 구조를 형성하는 물 분자와 단백질을 포함하는 PDB 파일을 지정된 크기의 물 분자 고리구조를 갖는 메인 PDB 파일로 통합하는 제 6단계를 포함을 포함한다. 따라서, 본 발명은 에너지 기반으로 물 분자 고리를 계산하거나 거리 기반으로 물 분자 고리를 계산하여 단백질 결합 자리 내의 물 분자 움직임을 분석할 수 있기 때문에 단백질-리간드 결합시 물 분자가 두 물질의 결합력과 결합 양식에 중요한 역할을 하고 있으므로 유사한 결합 자리를 가지는 서로 다른 단백질에 대한 선택적인 리간드 설계에 중용한 정보를 제공할 수 있고, 웹 기반의 플랫폼 UI를 통해 프로그래밍 경험이 부족한 신약개발 연구자들이 직관적이 UI를 통해 분석에 대한 접근성을 높이고, 실험실 외부나 원격지에서 분석 서버의 분석 진행 상태를 웹 또는 모바일에서 제어 또는 확인할 수 있으며, 분석 결과와 단계별로 생성되는 결과 데이터(OUTPUT DATA)를 웹 리포팅 형식으로 제공하여 연구의 효율성을 높일 수 있다.
Int. CL G16B 5/00 (2019.01.01) G16B 15/00 (2019.01.01) G16B 50/00 (2019.01.01) G16C 10/00 (2019.01.01)
CPC G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01)
출원번호/일자 1020180029647 (2018.03.14)
출원인 충남대학교산학협력단, 주식회사 유클리드소프트
등록번호/일자 10-1902150-0000 (2018.09.18)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20181012) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2018.03.14)
심사청구항수 3

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 충남대학교산학협력단 대한민국 대전광역시 유성구
2 주식회사 유클리드소프트 대한민국 대전광역시 서구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 강남숙 대전광역시 유성구
2 채은경 대전광역시 서구
3 이명휘 대전광역시 서구
4 최광은 대전광역시 유성구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 김상욱 대한민국 대전광역시 서구 둔산중로 ***, ****호(둔산동,주은오피스텔)(주은국제특허법률사무소)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 충남대학교산학협력단 대한민국 대전광역시 유성구
2 주식회사 유클리드소프트 대한민국 대전광역시 서구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2018.03.14 수리 (Accepted) 1-1-2018-0255206-36
2 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2018.03.14 수리 (Accepted) 1-1-2018-0254936-79
3 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2018.05.16 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0331216-01
4 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2018.07.10 수리 (Accepted) 1-1-2018-0677866-25
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2018.07.10 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-0677706-39
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2018.07.10 무효 (Invalidation) 1-1-2018-0677468-67
7 보정요구서
Request for Amendment		 2018.07.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2018-0111717-16
8 [지정기간단축]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Reduction of Designated Period] Request for Extension of Period (Reduction, Expiry Reconsideration)		 2018.07.19 수리 (Accepted) 1-1-2018-0712841-51
9 무효처분통지서
Notice for Disposition of Invalidation		 2018.07.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2018-0113241-21
10 등록결정서
Decision to grant		 2018.09.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0641743-88
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
분자동역학(Molecular Dynamics, MD) 모의실험 소프트웨어 패키지를 실행하여 분석 결과를 제공하는 분석 서버 및 분자동역학 모의 실험에 필요한 데이터를 관리하는 데이터베이스를 포함하는 물 분자 네트워크 분석 시스템에 의해 수행되는 물 분자 네트워크 분석 방법에 있어서, 웹 기반의 플랫폼 UI(User Interface)를 통해 명령어를 입력하여 PDB(Protein Data Bank)의 단백질 구조 파일(trajectory file)로부터 물 분자와 헤테로 원자(hetero atom)를 선택하여 새로운 PDB 파일을 생성하는 제1 단계; 상기 물 분자들 중 기준 물 분자를 중심으로 산소 원자끼리의 거리 기준으로 주변 물 분자들 사이의 고리 구조(Water ring)의 물 분자 네트워크를 분석하기 위하여 하기한 포텐셜 함수를 이용하는 제2 단계; 단백질과 물이 결합된 상태에서 물 분자만 분리하기 위해 기설정된 크기의 물 분자 고리마다 서브 PDB 파일을 각각 생성하는 제3 단계; 상기 서브 PDB 파일과 단백질 파일을 궤적별로 합산하여 서브 pdb 파일별로 PDB 파일 형태의 출력 파일을 생성하는 제4 단계; 및 상기 궤적별로 고리 구조를 형성하는 물 분자와 단백질을 포함하는 PDB 파일형태의 각 출력 파일들을 하나의 메인 PDB 파일로 통합하고, 상기 물 분자 고리에서 최단거리의 단백질 원자들을 식별하여 단백질을 구성하는 각 아미노산 또는 원자들의 물 분자 고리 패턴을 분석하는 제5 단계를 포함하되,상기 포텐셜 함수는 이고, 상기 포텐셜 함수에서 q i는 전하 값, A는 4εσ12, C는 4εσ6인 것을 특징으로 하는 물 분자 네트워크 분석 방법
2 2
제1항에 있어서, 사용자가 상기 웹 기반의 플랫폼 UI(User Interface)를 통해 상기 분석 서버에서 실행되는 상기 물 분자 네트워크의 분석 진행 상태를 웹 또는 모바일 상에서 실시간으로 제어 및 확인하고, 상기 물 분자 네트워크의 분석 결과를 웹 리포팅 형식으로 제공하며, 사용자별로 입력 데이터(INPUT DATA)를 관리하여, 기 분석된 데이터(INPUT DATA)를 재활용하는 것을 특징으로 하는 물 분자 네트워크 분석 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 분석 서버는 데이터베이스와 연계하여 상기 물 분자 네트워크의 분석 데이터와 설정 값(OPTIONS)의 이력 관리를 수행하고, 3차원 단백질 구조를 가시화 도구 라이브러리를 이용하여 웹 리포팅 형식으로 제공하는 것을 특징으로 하는 물 분자 네트워크 분석 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.