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정방향 프라이머 결합 영역, 및 표적 서열의 제1 영역에 특이적으로 혼성화하는 LHS(left hybridization sequence) 영역을 포함하는 LPO(left probe oligonucleotide); 및상기 표적 서열의 상기 제1 영역과 연속으로 연결된 제2 영역에 특이적으로 혼성화하는 RHS(right hybridization sequence) 및 역방향 프라이머 결합 영역을 포함하는 RPO(right probe oligonucleotide);로 구성되고,상기 LHS(left hybridization sequence) 및 상기 RHS(right hybridization sequence)가 서열 번호 1 및 서열번호 2인 제1 프로브, 서열번호 3 및 서열번호 4인 제2 프로브, 서열번호 5 및 서열번호 6인 제3 프로브, 서열번호 7 및 서열번호 8인 제4 프로브 및 서열번호 9 및 서열번호 10인 제5 프로브로 이루어진 그룹에서 선택되는 어느 하나인 것인 패혈증-유발 그람 음성균 검출용 프로브
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제1항에 있어서,상기 그람 음성균은 대장균(Escherichia
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제1항에 있어서,상기 서열 번호 1 및 서열 번호 2인 제1 프로브는 대장균(Escherichia
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제1항에 있어서,상기 LHS(left hybridization sequence) 및 상기 RHS(right hybridization sequence)가 서열 번호 11 및 서열번호 12인 제6 프로브를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 패혈증-유발 그람 음성균 검출용 프로브
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제4항에 있어서,상기 서열번호 11 및 서열번호 12인 제6 프로브는 ESBL-생성 균주의 유전자 CTX-M group 1의 서열 번호 18에 특이적으로 혼성 결합하는 것을 특징으로 하는, 패혈증-유발 그람 음성균 검출용 프로브
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제1항 내지 제5항 중 어느 한 항의 프로브를 포함하는, 패혈증-유발 그람 음성균 검출용 조성물
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7
제6항의 조성물을 포함하는, 패혈증-유발 그람 음성균 검출용 키트
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하기 단계를 포함하는 패혈증-유발 그람 음성균의 존재를 검출하는 방법:시료를 예비 증폭시키는 단계(S1);예비 증폭된 시료를 제1항의 패혈증-유발 그람 음성균 검출용 프로브 세트와 접촉시켜 혼성화시키는 단계(S2);상기 시료와 혼성화된 프로브를 라이게이션(ligation)하여 프로브 어셈블리(probe assembly)를 형성시키는 단계(S3);상기 형성된 프로브 어셈블리(probe assembly)를 주형으로 하여 PCR 증폭시키는 단계(S4);상기 증폭 산물을 분리 및 검출하는 단계(S5);상기 증폭 산물이 분리, 검출되는 경우 상기 시료 내에 상기 증폭된 프로브 어셈블리(probe assembly)를 구성하는 프로브가 상보적으로 결합하는 패혈증-유발 그람 음성균이 존재하는 것으로 판단하는 단계(S6)
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제8항에 있어서,상기 단계(S1)의 시료를 예비 증폭시키는 단계에서는 제1 프라이머 세트 내지 제6 프라이머 세트를 이용하여 시료 내의 균주의 표적 서열의 제1 영역 및 상기 제1 영역과 연속으로 연결된 제2 영역을 증폭시키는 것을 특징으로 하는 패혈증-유발 그람 음성균의 존재를 검출하는 방법
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10
제8항에 있어서,상기 서열번호 19 및 서열번호 20인 제1 프라이머 세트는 대장균(Escherichia
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11
제8항에 있어서,상기 단계(S2)에서, 상기 시료의 표적 서열 제1 영역과 상기 LPO 프로브의 LHS가 혼성화되고, 상기 시료의 표적 서열 제2 영역과 상기 RPO 프로브의 RHS 가 혼성화되는 것을 특징으로 하는 패혈증-유발 그람 음성균의 존재를 검출하는 방법
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제8항에 있어서,상기 단계(S2)에서 3시간 내지 20시간 동안 혼성화되는 것을 특징으로 하는 패혈증-유발 그람 음성균의 존재를 검출하는 방법
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제8항에 있어서,상기 단계(S3)에서, 상기 시료의 제 1 영역과 혼성 결합된 LPO의 LHS의 말단과 상기 시료의 제2 영역과 혼성 결합된 RPO의 RHS의 말단을 라이게이션(ligation)하여 정방향 프라이머 결합 영역-LHS-RHS-역방향 프라이머 결합 영역으로 구성된 프로브 어셈블리(probe assembly)를 형성하는 것을 특징으로 하는 패혈증-유발 그람 음성균의 존재를 검출하는 방법
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제8항에 있어서,상기 단계(S4)에서, 상기 프로브 어셈블리(probe assembly)를 구성하는 LPO(left probe oligonucleotide)가 포함하는 정방향 프라이머 결합 영역, 및 RPO(right probe oligonucleotide)가 포함하는 역방향 프라이머 결합 영역에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 사용하여 상기 형성된 프로브 어셈블리(probe assembly)가 PCR 증폭되는 것을 특징으로 하는 패혈증-유발 그람 음성균의 존재를 검출하는 방법
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제8항에 있어서,상기 단계(S5)에서, 프로브 어셈블리(probe assembly)를 주형으로 하여 증폭된 PCR 산물을 CE-SSCP(Capillary Electrophoresis-Single strand conformation polymorphism)를 이용하여 분리 및 검출하는 것을 특징으로 하는 패혈증-유발 그람 음성균의 존재를 검출하는 방법
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제8항에 있어서,상기 단계(S2)에서, 제4항에 의한 패혈증-유발 그람 음성균 검출용 프로브 세트를 사용하여 복수의 그람 음성균의 존재를 한 번에 검출하는 것을 특징으로 하는 패혈증-유발 그람 음성균의 존재를 검출하는 방법
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제8항 내지 제16항 중 어느 한 항의 방법을 이용한, 패혈증 치료를 위한 정보제공 방법
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