맞춤기술찾기

이전대상기술

양자역학 계산과 용매화 효과를 이용한 단백질-리간드 도킹 구조의 예측방법

  • 기술번호 : KST2019038477
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 양자역학 계산과 용매화 효과를 이용한 단백질-리간드 도킹 구조의 예측방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 묵시적 용매(implicit solvent) 모델 환경하에서 양자역학 계산을 통해 도출된 양자역학 영역에 존재하는 원자 전하를 이용하는 양자역학/분자역학 계산에 기초한 도킹 프로토콜에 관한 것이다. 본 발명에 따르면, 양자역학 계산 시 용매화 효과를 고려하여 도출된 양자역학 영역의 원자 전하를 이용함으로써 기존 도킹 방법에 의한 경우보다 정확한 모델링이 가능하다.
Int. CL G16B 5/00 (2019.01.01) G16B 45/00 (2019.01.01) G01N 33/68 (2006.01.01)
CPC G16B 99/00(2013.01) G16B 99/00(2013.01) G16B 99/00(2013.01) G16B 99/00(2013.01)
출원번호/일자 1020170117720 (2017.09.14)
출원인 고려대학교 세종산학협력단
등록번호/일자 10-2174746-0000 (2020.10.30)
공개번호/일자 10-2019-0030365 (2019.03.22) 문서열기
공고번호/일자 (20201105) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2017.09.14)
심사청구항수 8

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 세종산학협력단 대한민국 세종특별자치시

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 조은성 대한민국 서울특별시 종로구
2 김민섭 대한민국 서울특별시 노원구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 정은열 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로**길 **, ***호(정앤김특허법률사무소)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 세종산학협력단 세종특별자치시
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2017.09.14 수리 (Accepted) 1-1-2017-0893755-32
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2018.01.20 수리 (Accepted) 4-1-2018-5011666-45
3 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2018.07.20 수리 (Accepted) 4-1-2018-5138839-36
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2019.02.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0116601-78
5 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2019.04.18 수리 (Accepted) 1-1-2019-0398609-21
6 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2019.05.20 수리 (Accepted) 1-1-2019-0513567-12
7 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2019.06.18 수리 (Accepted) 1-1-2019-0622649-92
8 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2019.07.18 수리 (Accepted) 1-1-2019-0736596-55
9 지정기간연장 관련 안내서
Notification for Extension of Designated Period
2019.07.22 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2019-0119260-63
10 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2019.08.05 수리 (Accepted) 1-1-2019-0800897-28
11 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2019.08.05 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2019-0800896-83
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.08.20 수리 (Accepted) 4-1-2019-5165251-68
13 최후의견제출통지서
Notification of reason for final refusal
2019.10.14 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0739194-76
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.11.01 수리 (Accepted) 4-1-2019-5228968-96
15 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2019.12.16 수리 (Accepted) 1-1-2019-1296506-92
16 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2020.01.14 수리 (Accepted) 1-1-2020-0040890-18
17 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2020.02.14 수리 (Accepted) 1-1-2020-0158539-85
18 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2020.03.16 수리 (Accepted) 1-1-2020-0274153-53
19 지정기간연장 관련 안내서
Notification for Extension of Designated Period
2020.03.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2020-0041336-07
20 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.03.30 수리 (Accepted) 4-1-2020-5073634-85
21 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2020.04.14 수리 (Accepted) 1-1-2020-0386914-30
22 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2020.04.14 보정승인 (Acceptance of amendment) 1-1-2020-0386913-95
23 등록결정서
Decision to grant
2020.10.27 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2020-0740079-72
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
묵시적 용매(implicit solvent) 모델 환경하에서, 미리 정의된 양자역학 영역(QM region)에 대한 양자역학 계산을 수행하는 소정의 소프트웨어를 실행하는 연산부에서 상기 양자역학 영역에 존재하는 단백질 잔기와 리간드의 원자 전하를 계산하는 단계; 및도킹을 수행하는 소정의 소프트웨어를 실행하는 도킹부에서 상기 계산된 원자 전하를 이용하여 도킹을 수행하는 단계;를 포함하는 단백질-리간드 도킹구조의 예측방법
2 2
제1항에 있어서,상기 양자역학 영역은 단백질과 리간드의 결합 부위(binding site)의 단백질 잔기와 리간드를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질-리간드 도킹구조의 예측방법
3 3
제2항에 있어서,상기 양자역학 영역은 상기 리간드 및 결합 부위에서 5 Å이내의 범위의 단백질 잔기를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질-리간드 도킹구조의 예측방법
4 4
제1항에 있어서,상기 묵시적 용매 모델은 Poisson Boltzmann(PB) 용매 모델인 것을 특징으로 하는 단백질-리간드 도킹구조의 예측방법
5 5
제1항에 있어서,상기 단백질은 G 단백질-결합 수용체(G protein-coupled receptor, GPCR)인 것을 특징으로 하는 단백질-리간드 도킹구조의 예측방법
6 6
(a) 선택된 단백질-리간드 세트에 대하여, 도킹을 수행하는 소정의 소프트웨어를 실행하는 도킹부에서 역장(force-field)-기초 도킹을 수행하여 다수의 포즈(pose)를 생성하는 단계; 및(b) 생성된 상기 다수의 포즈에 대하여, 묵시적 용매화(implicit) 모델 환경하에서, 미리 정의된 양자역학 영역(QM region)에 대한 양자역학 계산을 수행하는 소정의 소프트웨어를 실행하는 연산부에서 상기 양자역학 영역에 존재하는 단백질 잔기와 리간드의 원자 전하를 계산하여 가장 안정한 포즈를 선택하는 단계;를 포함하는 단백질-리간드 도킹구조의 예측방법
7 7
삭제
8 8
삭제
9 9
제6항에 있어서,상기 (b) 단계에서, 반데르발스 에너지 및 상기 계산된 원자 전하로부터 도출된 단백질과 리간드 사이의 정전기 인력을 기반으로 가장 안정한 포즈를 선택하는 것을 특징으로 하는 단백질-리간드 도킹구조의 예측방법
10 10
제6항에 있어서,상기 (b) 단계에서, 속박된(constrained) 단백질 원자에 대한 기하학적 구조(geometry) 최적화를 5회 이하로 반복 수행하는 것을 특징으로 하는 단백질-리간드 도킹구조의 예측방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 과학기술정보통신부 고려대학교 산학협력단 중견연구자지원 멀티스케일모델링을 이용한 GPCR 타겟용 다킹 방법의 개발