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AI 기반의 열역학을 이용한 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치 및 방법

  • 기술번호 : KST2020003354
  • 담당센터 : 인천기술혁신센터
  • 전화번호 : 032-420-3580
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 AI 기반의 열역학을 이용한 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치 및 방법에 대한 것이다. 본 발명에 따르면 열역학을 이용한 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치에 있어서, 클러스터링 장치를 통해 입력된 복수의 단백질에 대한 정보를 수집하는 단백질 정보 수집부, 수시로 구조가 변하는 복수의 단백질 구조로부터 획득한 복수의 유효 에너지값을 획득하는 유효에너지 값 획득부, 상기 획득된 복수의 단백질의 정보를 이용하여 2차원 형태의 반응좌표를 산출하는 반응좌표 산출부, 상기 산출된 2차원의 반응좌표에 유효에너지 값을 적용하여 3차원의 좌표로 변환하는 좌표변환부, 그리고, 상기 변환된 3차원의 좌표에서 근접한 단백질 구조끼리 클러스터링하는 클러스터링부를 포함한다. 이와 같이 본 발명에 따르면, 2차원 형태로 제공되는 반응좌표에 유효에너지를 적용하여 3차원 형태의 좌표로 변환함으로써, 단백질 구조를 더욱 세세하게 분류 가능하므로, 질병의 발생 원인이 되는 폴딩(misfolding) 과 미스 폴딩(misfolding) 구조를 유효에너지의 값에 따라 복수개로 분류하여 질병의 원인을 더욱 정확하게 접근할 수 있으며, 정확하고 신뢰성 있는 진단 및 치료가 가능한 효과를 도모할 수 있다.
Int. CL G16B 15/00 (2019.01.01) G16B 30/00 (2019.01.01) G16B 45/00 (2019.01.01)
CPC G16B 15/00(2013.01) G16B 15/00(2013.01) G16B 15/00(2013.01)
출원번호/일자 1020180100472 (2018.08.27)
출원인 숙명여자대학교산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2020-0023940 (2020.03.06) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2018.08.27)
심사청구항수 14

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 숙명여자대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 용산구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 함시현 서울특별시 용산구
2 정성호 서울특별시 용산구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인태백 대한민국 서울 금천구 가산디지털*로 *** 이노플렉스 *차 ***호

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 숙명여자대학교산학협력단 서울특별시 용산구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2018.08.27 수리 (Accepted) 1-1-2018-0848064-92
2 등록결정서
Decision to grant
2020.07.01 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2020-0447890-33
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번호 청구항
1 1
열역학을 이용한 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치에 있어서,AI 기능을 구비한 클러스터링 장치를 통해 입력된 복수의 단백질에 대한 정보를 수집하는 단백질 정보 수집부, 수시로 구조가 변하는 복수의 단백질 구조로부터 획득한 복수의 유효 에너지값을 획득하는 유효에너지 값 획득부,상기 획득된 복수의 단백질의 정보를 이용하여 2차원 형태의 반응좌표를 산출하는 반응좌표 산출부, 상기 산출된 2차원의 반응좌표에 유효에너지 값을 적용하여 3차원의 좌표로 변환하는 좌표변환부, 그리고, 상기 변환된 3차원의 좌표에서 근접한 단백질 구조끼리 클러스터링하는 클러스터링부를 포함하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치
2 2
제1항에 있어서, 상기 유효에너지 값 획득부는,복수의 단백질 구조로부터 획득한 복수의 유효에너지를 이용하여 표준화하고자 하는 최대값 및 최소값을 산출하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치
3 3
제2항에 있어서, 상기 유효에너지는, 하기의 수학식과 같이 단백질 변동 과정에 대한 열역학적 분석을 통해 산출되는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치; 여기서, 는 단백질 형태 에 대한 단일 값을 제공하는 유효에너지이고, 는 단백질 위치 에너지이고, 는 용매화 자유에너지이다
4 4
제1항에 있어서, 상기 반응좌표 산출부는,단백질로부터 가장 큰 방향성을 가지는 복수의 경로를 산출하고, 산출된 복수의 경로를 각각의 축으로 하는 반응좌표를 구하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치
5 5
제1항에 있어서, 상기 반응좌표 산출부는,TICA기법 또는 PCA기법을 통해 기하학적인 상기 반응좌표를 획득하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치
6 6
제1항에 있어서, 상기 클러스터링 된 단백질 구조에 따른 유효에너지 값을 통하여 폴딩 또는 미스 폴딩 구조를 판단하는 판단부를 더 포함하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치
7 7
제6항에 있어서, 상기 판단부는,상기 유효에너지 값이 클수록 단백질 구조는 미스 폴딩인 구조이고, 상기 유효에너지의 값이 작을수록 안정화된 단백질 폴딩 구조로 판단하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 장치
8 8
열역학을 이용한 단백질 폴딩 구조 클러스터링 방법에 있어서,클러스터링 장치를 통해 입력된 복수의 단백질에 대한 정보를 수집하는 단계, 수시로 구조가 변하는 복수의 단백질 구조로부터 각각의 유효 에너지값을 획득하는 단계,상기 수집된 복수의 단백질을 이용하여 2차원 형태의 반응좌표를 획득하는 단계,상기 획득한 2차원의 반응좌표에 유효에너지 값을 적용하여 3차원의 좌표로 변환시키는 단계, 그리고상기 변환된 3차원의 좌표에서 근접하고 있는 단백질 구조끼리 클러스터링하는 단계를 포함하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 방법
9 9
제7항에 있어서, 상기 유효 에너지값을 획득하는 단계는,복수의 단백질 구조로부터 획득한 복수의 유효에너지 값을 이용하여 표준화하고자 하는 최대값 및 최소값을 산출하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 방법
10 10
제7항에 있어서, 상기 유효에너지는,하기의 수학식과 같이 단백질 변동 과정에 대한 열역학적 분석을 통해 산출되는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 방법:여기서, 는 단백질 형태 에 대한 단일 값을 제공하는 유효에너지이고, 는 단백질 위치 에너지이고, 는 용매화 자유에너지이다
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제7항에 있어서, 상기 반응좌표를 획득하는 단계는, 단백질로부터 가장 큰 방향성을 가지는 복수의 경로를 산출하고, 산출된 복수의 경로를 각각의 축으로 하는 반응좌표를 구하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 방법
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제7항에 있어서, 상기 반응좌표를 획득하는 단계는,TICA기법 또는 PCA기법을 통해 기하학적인 상기 반응좌표를 획득하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 방법
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제7항에 있어서, 상기 클러스터링 된 단백질 구조에 따른 유효에너지 값을 통하여 폴딩 또는 미스 폴딩 구조를 판단하는 단백질 구조를 판단하는 단계를 더 포함하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 방법
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제10항에 있어서, 상기 단백질 구조를 판단하는 단계는, 상기 유효에너지 값이 클수록 단백질 구조는 미스 폴딩인 구조이고, 상기 유효에너지의 값이 작을수록 안정화된 단백질 폴딩 구조로 판단하는 단백질 폴딩 구조 클러스터링 방법
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