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환자 유래 세포의 RNA 시퀀싱 데이터를 획득하는 단계;상기 획득된 RNA 시퀀싱 데이터로부터 개별 유전자의 대체 폴리아데닐화(Alternative polyadenylation, APA)를 추정하는 단계로서, RNA 시퀀싱 데이터로부터 유전자의 short isoform과 long isoform의 상대적인 양 변화를 측정하거나 또는 개별 유전자에 대한 3'UTR의 길이 변화에 의해 대체 폴리아데닐화를 추정하는 것인 단계;개별 유전자의 발현 정도를 나타내는 인덱스를 산출하는 단계로서, 상기 인덱스는 획득된 RNA 시퀀싱 데이터로부터 리드 정령(read alignment)와 리드 정량화(read quantification) 과정을 통해 개별 유전자의 리드 카운트(read count)를 확보하여 산출되는 것인 단계; 및상기 산출된 인덱스 및 대체 폴리아데닐화의 상관관계를 측정하는 단계로서, 개별 유전자의 3'UTR의 길이 변화와 개별 유전자의 발현의 상관관계를 피어슨의 상관계수(Pearson's correlation coefficient)를 사용하여 계산하는 것인 단계를 포함하는, 초기 암 환자의 생존율과 연관된 바이오마커의 선별 방법
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청구항 1에 있어서, 분류된 환자 그룹 간의 생존율 차이를 나타내는 통계적 유의 수준을 산출하고, 상기 산출된 통계적 유의 수준에 기초하여 유전자를 선별하는 단계를 추가로 포함하는 방법
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청구항 1에 있어서, 단일 세포 RNA 시퀀싱 데이터인 방법
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청구항 3에 있어서, 상기 단일 세포는 종양세포, B 림프구, T 림프구, 골수성 세포 및 기질세포로 구성된 군에서 선택된 것인 방법
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청구항 1에 있어서, 상기 데이터는 RNA 전장 전사체(full-length transcript)인 방법
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청구항 1에 있어서, 상기 대체 폴리아데닐화는 DaPars 또는 Roar를 사용하여 추정하는 것인 방법
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청구항 1에 있어서, 상기 대체 폴리아데닐화는 개별 유전자의 3'UTR의 길이 변화에 의해 추정되는 것인 방법
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청구항 1에 있어서, 상기 세포는 유방암, 교모세포종, 신 세포 암종, 선암, 점액암, 인환세포함, 편평상피암, 선편평상피암, 소세포암, 융모암 및 미분화암으로 구성된 군에서 선택된 것인 방법
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청구항 1에 있어서, 세포 유형에 따라 대체 폴리아데닐화가 조절되는 것인 방법
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청구항 9에 있어서, 상기 세포는 종양세포, B 림프구, T 림프구, 골수성 세포 및 기질세포로 구성된 군에서 선택된 것인 방법
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청구항 1에 있어서, 종양 특이성을 가지는 것인 방법
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청구항 1에 의해 선별된 바이오마커 패널
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환자 유래 세포의 RNA 시퀀싱 데이터를 획득하는 단계;상기 획득된 RNA 시퀀싱 데이터로부터 개별 유전자의 대체 폴리아데닐화(Alternative polyadenylation, APA)를 추정하는 단계로서, RNA 시퀀싱 데이터로부터 유전자의 short isoform과 long isoform의 상대적인 양 변화를 측정하거나 또는 개별 유전자에 대한 3'UTR의 길이 변화에 의해 대체 폴리아데닐화를 추정하는 것인 단계; 개별 유전자의 발현 정도를 나타내는 인덱스를 산출하는 단계로서, 상기 인덱스는 획득된 RNA 시퀀싱 데이터로부터 리드 정령(read alignment)와 리드 정량화(read quantification) 과정을 통해 개별 유전자의 리드 카운트(read count)를 확보하여 산출되는 것인 단계; 상기 산출된 인덱스 및 대체 폴리아데닐화의 상관관계를 측정하는 단계로서, 개별 유전자의 3'UTR의 길이 변화와 개별 유전자의 발현의 상관관계를 피어슨의 상관계수(Pearson's correlation coefficient)를 사용하여 계산하는 것인 단계; 및 개체의 개별 유전자의 발현 수준 및 대체 폴리아데닐화가 대조군에 비해 증가하면 암으로 판단하는 단계를 포함하는 초기 암의 진단을 위한 정보 제공방법
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